基于GEO数据库芯片对反复种植失败者子宫内膜生物信息学分析

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摘要 摘要目的利用生物信息学分析方法挖掘反复胚胎种植失败患者相关关键基因及通路,探讨其对子宫内膜容受性的影响。方法从GEO数据库中下载GSE26787数据集及GSE111974数据集为研究样本,以重复植入失败的患者及既往正常妊娠的女性的子宫内膜组织数据为研究对象,使用R语言将原始数据经过质量分析、归一化、探针和基因名转换,构建表达矩阵后,利用limma包进行差异基因的筛选,进而利用DAVID数据库进行GO及KEGG分析,再使用String数据库及Cytoscape软件筛选关键基因。结果得到两数据集共同关键基因PTGS2、PLCB1、MGP、CYP3A5、LPAR3、VCAM1、ALPL、SLC1A1、SLC4A7、SULT1E1及关键通路hsa01100。结论本研究所得的关键基因及通路可通过调控子宫内膜氧化还原及代谢状态进而影响子宫内膜容受性,可作为研究其相关作用的靶点。
出处 《中华生殖与避孕杂志》 2022年07期
出版日期 2022年12月13日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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