简介：摘要目的比较甲型肝炎病毒(hepatitis A virus，HAV)四种核酸检测方法。方法采用A、B、C实时荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)及D微滴芯片数字RT-PCR(RT-dPCR)分别对HAV质粒标准品、梯度稀释的HAV疫苗进行灵敏度检测；对相关病毒核酸进行特异性检测；用A、B、C方法对40份人工污染HAV牡蛎、市售牡蛎及血清标本、HAV疫苗标本进行检测，比较检出率；比较A、D方法对低浓度HAV人工污染牡蛎的回收率。结果A、B方法对质粒标准品均可检测至10拷贝/μL；检测梯度稀释的HAV疫苗，A、B、C方法的斜率、R2值、扩增效率(-3.446～-3.297、0.991～0.998、95.07%～101.051%)均在可接受范围；40份不同来源的标本，A、B、C方法的阳性检出率分别是50%(20/40)、47.5%(19/40)、55%(22/40)，差异无统计学意义(χ2＝0.467，P＝0.792)；A、D方法对梯度稀释疫苗检测灵敏度无明显差别，对低浓度HAV人工污染牡蛎检测，D方法回收率高于A方法，但差异无统计学意义(F＝0.294，P＝0.642)。结论A、B、C方法无明显差异，较方便快捷；在检测低浓度HAV污染的食品时，D方法略有优势，但检测成本稍高，选取检测方法可根据实际情况选择。

简介：摘要目的分析四川南充和新疆和田甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)分离株全基因组序列特征。方法收集2006年四川南充同1起暴发的3份和2016年新疆和田6份急性期甲肝患者血清标本，通过核酸提取、逆转录、分段巢式PCR、测序和序列拼接获得9条HAV全基因组序列。利用生物信息学软件进行系统进化、抗原中和位点、重组和选择压力分析。结果VP1-2A连接区基因分型表明9条HAV序列都属于IA亚型，分为4个不同的分支，其中3条南充序列和3条和田序列属于同一分支；全基因组序列表明，3条南充序列核苷酸和氨基酸同源性分别为99.99%～100%和100%，与3条和田序列全基因组核苷酸和氨基酸差异分别为0.50%～0.57%和0.08%～0.17%。9条HAV全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为98.29%～100%和99.62%～100%，与我国hd9和蒙古MNA12-001关系最近(核苷酸和氨基酸同源性分别为：与hd9 98.60%～99.50%和99.75%～99.92%；与MNA12-001 98.45%～99.32%和99.71%～99.87%)。9条HAV序列在已发表的抗原中和位点处未发生改变，未发现重组，选择压力分析表明处于负向选择。结论我国存在多株HAV流行株；9条HAV氨基酸序列在主要抗原中和位点处很保守。

简介：摘要目的比较戊型肝炎病毒(hepatitis E virus，HEV)3种核酸检测方法的敏感性及特异性。方法将HEV基因4型代表株的开放阅读框(open reading frame，ORF)2区部分基因序列克隆至pUC57载体，合成质粒DNA，使用A、B两种实时定量方法检测该质粒，比较最低检出限；使用其他标本做特异性检测。使用3种方法平行检测急性戊肝病例血清标本，比较检测结果。结果A、B方法对质粒DNA的最低检出限均可达35拷贝数/反应，特异度均为100%；A、B和C方法对急性戊肝病例血清标本HEV RNA检出阳性率分别为47.8%(43/90)、43.3%(39/90)和41.1%(37/90)，一致率为88.9%(80/90)，3种方法的检出率之间无统计学差异(χ2＝0.8414，P＝0.6566)。A方法检测Ct值≤34.6或者B方法检测Ct值≤35.6的血清标本，C方法扩增成功率为100%。结论A方法的敏感性和特异性均较高，C方法为灵敏的基因检测方法。