简介：摘要目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase，HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3, HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查，对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定，与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对，应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列，核苷酸同源性在96.6%~100%之间，其中48株为C3基因亚型，1株为C5基因亚型。系统进化分析显示，我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行，毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%，其中C3是我国的优势流行基因亚型，分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支，以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示，其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年，有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳；C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10-4~5.82×10-4替换/位点/年之间；C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点，选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别，形成了广泛传播和持续流行态势，并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

简介：摘要目的了解2014—2019年北京市急性腹泻儿童中诺如病毒(Norovirus, NoV)的感染特征。方法收集2014年4月至2019年12月于首都儿科研究所附属儿童医院以急性腹泻为主要症状的患儿粪便标本，利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)筛查NoV；阳性标本进行NoV VP1基因及RdRp基因扩增及序列测定，所测得的序列应用在线分型工具Norovirus Genotyping Tool 2.0进行基因分型。结果本研究共收集2 577例急性腹泻儿童粪便标本，NoV核酸检测阳性的484例(18.78%，484/2 577)；NoV感染全年均可发生，具有明显的季节分布，流行高峰在秋冬季节。NoV的检出无性别差异(χ2＝1.77, P＝0.183)。其中有399例得到了VP1区分型，结果显示有11个基因型，主要为GII基因群(98.25%, 392/399)，GII.4 Sydney型为主(52.13%, 208/399)，其次为GII.3型(19.8%, 79/399)、GII.2型(18.5%, 74/399)。267例完成了RdRp区分型，结果显示有10个基因型，以GII.P31型为主(57.3%, 153/267)，其次为GII.P12型(15.36%, 41/267)及GII.P16型(14.98%, 40/267)。双基因分型结果显示存在16种组合方式，主要为GII.4 Sydney[P31](53.18%, 142/267)，GII.3[P12]检出率呈下降趋势，而GII.4 Sydney[P16]检出率逐渐增高。结论NoV是北京市2014—2019年儿童急性腹泻的重要病原，流行的基因型别多样。

简介：摘要目的比较北京地区急性呼吸道感染住院患儿中不同型别腺病毒感染临床特征，明确腺病毒分型的临床必要性。方法采用横断面研究，纳入2017年11月至2019年10月在首都儿科研究所附属儿童医院因急性呼吸道感染住院的9 022例次患儿呼吸道标本，经直接免疫荧光（DFA）和（或）核酸检测确定为腺病毒阳性者进行五邻体、六邻体及纤维蛋白基因扩增并测序，构建系统进化树区分腺病毒型别。收集并分析腺病毒主要型别感染患儿的实验室检查、影像学资料等临床资料，采用t检验、U检验、χ²检验进行型别间临床特征差异的统计学分析。结果9 022例次急性呼吸道感染住院患儿中腺病毒阳性检出率为4.34%（392例次），成功分型205例，其中男131例、女74例，年龄22.6（6.7，52.5）月龄，3型腺病毒阳性102例（49.76%），7型86例（41.95%），1、2、4、6、14、21型共17例。7型与3型腺病毒感染患儿临床特征比较，在出现喘息［10例（11.63%）比25例（24.51%）］、白细胞计数>15×109/L［4例（4.65%）比14例（13.73%）］、白细胞计数<5×109/L［26例（30.23%）比11例（10.78%）］、降钙素原水平>0.5 mg/L［43例（50.00%）比29例（28.43%）］、多肺叶浸润［45例（52.33%）比38例（37.25%）］、胸腔积液［23例（26.74%）比10例（9.80%）］、危重症腺病毒肺炎［7例（8.14%）比2例（1.96%）］比例方面，差异均有统计学意义（χ²=5.11、4.44、11.16、9.19、4.30、9.25、3.91，P=0.024、0.035、0.001、0.002、0.038、0.002、0.048）；住院时间差异也有统计学意义［11（8，15）比7（5，13）d，Z=3.73，P<0.001］。结论北京地区急性呼吸道感染住院患儿中腺病毒感染以3、7型为主要型别。与3型感染比较，7型感染炎症反应更明显，肺部症状更重，住院时间更长，区分腺病毒型别具有临床必要性。

简介：摘要急性呼吸道感染是儿童最常见的感染性疾病，严重威胁儿童生命健康。快速准确的病原学诊断对于该类疾病的临床诊疗及防控具有重要意义。核酸检测方法因具有较高的灵敏度和特异性，得以快速地在临床推广应用，成为呼吸道感染病原体诊断的主要方法。为规范儿童呼吸道感染病原体核酸检测的临床应用，提升病原体的诊断水平，特组织相关领域专家，撰写《儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识》，以指导儿童呼吸道感染病原体的核酸检测，整体提升儿童呼吸道感染病原体的诊断能力。

简介：摘要人腺病毒（HAdV）是急性呼吸道感染、腹泻、急性眼角结膜炎等多种疾病的常见病原体。许多研究表明HAdV基因组易发生基因重组，进而形成新的基因型别，迄今已报道的104个型别中53~104型为重组形成的新基因型，在全球范围内引起多次疫情，对疾病的防控提出新挑战。目前对其重组研究较少，亟需深入研究以揭示重组机制及临床意义。