简介:摘要目的分析环状RNA在脑性瘫痪(简称脑瘫)患儿中的差异表达情况,从而探讨其成为脑瘫早期诊断标志物的可能性。方法回顾性分析2017年6月至2018年10月在新疆医科大学第二附属医院神经外科确诊的5例脑瘫患儿的临床资料。同时选取性别、年龄、民族匹配的5名健康儿童,收集其外周血,采用芯片技术检测环状RNA在脑瘫患儿中的表达谱,两组间环状RNA的差异表达水平比较采用独立样本t检验。通过基因本体富集分析法和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析法对差异表达的环状RNA进行分析,探讨环状RNA的生物学功能与基因功能改变和细胞通路的关系。同期随机选择20例脑瘫患儿(脑瘫组)和20名健康儿童(健康组),并收集其外周血,对表达具有明显差异的环状RNA采用定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)技术进一步验证。结果在5例脑瘫患儿和5名健康儿童中共发现53 586个不同表达的环状RNA,共筛选出45个差异表达的环状RNA,其中表达上调的43个,表达下调的2个(差异倍数≥2.0,P<0.05)。基因本体富集分析发现,环状RNA的生物学功能与神经发生、神经元分化、发育过程的调节、细胞周期调控等有关。KEGG富集分析发现,环状RNA可能与cAMP信号通路、内质网蛋白质加工、调节干细胞多能性的信号通路等相关。筛选并验证3个环状RNA的结果表明,hsa_circ_0062733(差异倍数=3.20,P=0.010)在qRT-PCR验证时具有良好的特异性。结论脑瘫患儿较健康儿童存在大量差异表达的环状RNA,经验证hsa_circ_006273在脑瘫患儿中差异表达显著且表达上调,hsa_circ_006273可能成为脑瘫早期诊断的潜在生物学标志物。
简介:摘要目的分析环状RNA在脑性瘫痪(简称脑瘫)患儿中的差异表达情况,从而探讨其成为脑瘫早期诊断标志物的可能性。方法回顾性分析2017年6月至2018年10月在新疆医科大学第二附属医院神经外科确诊的5例脑瘫患儿的临床资料。同时选取性别、年龄、民族匹配的5名健康儿童,收集其外周血,采用芯片技术检测环状RNA在脑瘫患儿中的表达谱,两组间环状RNA的差异表达水平比较采用独立样本t检验。通过基因本体富集分析法和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析法对差异表达的环状RNA进行分析,探讨环状RNA的生物学功能与基因功能改变和细胞通路的关系。同期随机选择20例脑瘫患儿(脑瘫组)和20名健康儿童(健康组),并收集其外周血,对表达具有明显差异的环状RNA采用定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)技术进一步验证。结果在5例脑瘫患儿和5名健康儿童中共发现53 586个不同表达的环状RNA,共筛选出45个差异表达的环状RNA,其中表达上调的43个,表达下调的2个(差异倍数≥2.0,P<0.05)。基因本体富集分析发现,环状RNA的生物学功能与神经发生、神经元分化、发育过程的调节、细胞周期调控等有关。KEGG富集分析发现,环状RNA可能与cAMP信号通路、内质网蛋白质加工、调节干细胞多能性的信号通路等相关。筛选并验证3个环状RNA的结果表明,hsa_circ_0062733(差异倍数=3.20,P=0.010)在qRT-PCR验证时具有良好的特异性。结论脑瘫患儿较健康儿童存在大量差异表达的环状RNA,经验证hsa_circ_006273在脑瘫患儿中差异表达显著且表达上调,hsa_circ_006273可能成为脑瘫早期诊断的潜在生物学标志物。
简介:摘要目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在脑性瘫痪(CP)儿童外周血中的差异性表达。方法选择2017年6月至2017年10月在新疆医科大学第二附属医院就诊的年龄、性别、民族匹配的5对CP儿童和健康儿童,抽取外周血,分离提取总RNA,通过微阵列芯片技术筛选lncRNA,随机选择2017年11月至2018年10月在新疆医科大学第二附属医院确诊50例CP儿童(CP组)和50例健康儿童(健康组),实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术验证候选lncRNA在CP患儿中的表达。采用SPSS 20.0进行差异显著性分析,对计量资料作t检验,计数资料作χ2检验。结果筛选出184个差异lncRNA,其中,上调165个,下调19个。选择生物学功能相关的10个lncRNA:NONHSAT157763.1(t=2.656,P<0.05)、NONHSAT239818.1(t=2.514,P<0.05)、NONHSAT096484.2(t=2.062,P<0.05)、XR_931347.2(t=0.373,P<0.05)、NONHSAT231439.1(t=0.400,P<0.05)、NONHSAT150881.1(t=4.831,P<0.05)、NONHSAT066313.2(t=2.456,P<0.05)、NONHSAT150959.1(t=2.449,P<0.05)、NONHSAT149263.1(t=3.104,P<0.05)和NONHSAT151386.1(t=2.596,P<0.05),进行验证,结果前8个PCR扩增特异性较好。结论通过微阵列芯片技术筛选CP儿童外周血差异表达lncRNA,探寻其对应的生物学功能,而这些差异表达、与临床靶基因相关联的lncRNA,可能会成为CP的重要生物标志物。