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In Silico Screening for Microsatellite Markers from Expressed Sequence Tags of Porphyra yezoensis （Bangiales,Rhodophyta）

作者： WANG Mengqiang HU Jingjie ZHUANG Yunyun ZHANG Lei LILT Wei MAO Yunxiang
学科：天文地球 > 海洋科学
创建时间：2007-02-12
出处：《中国海洋大学学报：英文版》 2007年第2期

简介：表示顺序标注的Porphyrayezoensis(EST)的genomic资源被利用识别简单顺序重复(SSR)，或微卫星。这个方法拿了为基因身份的建立或为高多型性的获得使用EST和微卫星的优点。当基因标记whenmicrosatellites被附在基因，微卫星能被使用。由生物信息学分析揭示了，1162从21954颗ESTscontained微卫星和聚合分析显示984这些EST掉进112contigs，当另外的178EST是单条时。290唯一的包含SSR基因的一个总数被识别。AACSSR是微卫星的最人口多的类型。在所有微卫星之中占优势的GC富有的microsatelliteswere。
标签：条斑紫菜表达序列标签微卫星标记虚拟筛选

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