简介:组蛋白去乙酰化在基因表达调控方面扮演重要角色,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用.在基因组范围内,利用生物信息学方法对辣椒的组蛋白去乙酰化(HDAC)基因家族的各成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示辣椒HDAC家族包含14个蛋白质,分为3个亚族,其中RPD3/HDA1成员最多,为10个;HD2具有3个成员,SRT2仅有1个成员;其主要分布在8个染色体上,且进化分析结果表明辣椒HDAC基因成员与拟南芥家族具有相似分类.在辣椒HDAC结构域中包含18个重要的基序,同组中的HDAC成员蛋白序列的氨基酸保守结构域基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守结构域组成特异,表明这些基序的存在对HDAC蛋白功能的执行是必需的.分析辣椒发育过程中HDAC各成员表达谱数据发现,CaHDA1在果皮和胎座成熟过程中表达量逐渐升高,说明该基因可能参与了辣椒后期果实的发育过程.这将为辣椒HDAC家族基因的深入研究和功能解析提供实验参考依据.
简介:病毒病是陕西关中地区线辣椒的主要病害。关于该地区线辣椒病毒病毒源鉴定已经有过文献报道。但是,随着品种的更新、栽培环境的演化以及病原的分化等,有必要对其毒源进行定期地检测,以便为病毒病的防控提供依据。该研究在陕西省关中西部线辣椒主产区(千阳县、凤翔县、周至县)根据田间宏观症状随机采集当地主栽品种和部分育种优系的叶样,利用ELISA检测蚕豆萎蔫病毒(BBWV)等6种病毒,同时利用检测试纸对黄瓜花叶病毒(CMV)进行现场检测。ELISA结果表明,检测的55份样品均携带1种以上病毒,病毒侵染率高达100%。有2个样品携带所检测的全部6种病毒。在检测的6种病毒中,BBWV,PMMV、CMV、ToMV、TMV和PVY的检出率分别为100%、81.8%、76.4%、43.6%、41.8%和23.6%。CMV试纸检测的18个样品全部携带CMV病毒。