简介:WedevelopedanRfunctionnamed'microarrayoutlierfilter'(MOF)toassistintheidentificationoffailedarrays.Insortingagroupofsimilararraysbythelike-lihoodoffailure,twostatisticalindiceswereemployed:thecorrelationcoefficientandthepercentageofoutlierspots.MOFcanbeusedtomonitorthequalityofmi-croarraydataforbothtroubleshooting,andtoeliminatebaddatasetsfromdown-streamanalysis.Thefunctionisfreelyavaliableathttp://www.wriwindber.org/applications/mof/.
简介:MYB蛋白质在真核细胞的有机体起重要作用。在植物,R1R2R3类型MYB蛋白质在房间周期控制工作。然而,R2R3类型MYB蛋白质是否也涉及房间部门过程,仍然保持未知。这里,我们报导那R2R3类型抄写因素基因,AtMYB59,涉及房间周期前进和根生长的规定。AtMYB59蛋白质在洋葱的原子核是局部性的表皮的房间并且transactivation活动。在酵母房间的AtMYB59的表示压制房间增长,和transformants与更长的房间有更多的原子核和更高的aneuploidDNA内容。在AtMYB59的保存领域的变化在酵母细胞生长上废除它的效果。在同步Arabidopsis房间暂停,AtMYB59基因明确地在房间周期前进期间在S阶段被表示。表示和promoter-GUS分析表明AtMYB59基因富有地在根被表示。转基因的植物overexpressingAtMYB59更短的根与野类型的植物(Arabidopsis就职Col-0)相比,并且在在根尖端的有丝分裂的房间的一半附近在中期。相反地,空变异的myb59-1比关口在中期让更长的根和更少有丝分裂的房间,建议那AtMYB59可以由扩大有丝分裂的房间的中期禁止根生长。AtMYB59调整许多下游的基因,包括CYCB1;1基因,可能通过到MYB应答的元素的绑定。这些结果在细胞周期规定和植物根生长为AtMYB59支持一个角色。
简介:Amajorproblemwhichispoorlyunderstoodinthemanagementofbladdercancerislowsensitivitytochemotherapyandhighrecurrenceaftertransurethralresection.Insulin-likegrowthfactor1receptor(IGF-1R)signalingplaysaveryimportantroleinprogression,invasionandmetastasisofbladdercancercells.Inthisstudy,weinvestigatedwhetherIGF-1Rwasinvolvedinthegrowthstimulatingactivityanddrugresistanceofbladdercancercells.Theresultsshowed:ThemRNAsofIGF-1,IGF-2andIGF-1Rwerestronglyexpressedinserum-freeculturedT24cellline,whereasnormalurothelialcellsdidnotexpressthesefactors/receptorsoronlyintracelevels;T24cellrespondedfarbettertogrowthstimulationbyIGF-1thandidnormalurothelialcells;blockageofIGF1Rbyantisenseoligodeoxynucleotide(ODN)significantlyinhibitedthegrowthofT24cellandenhancedsensitivityandapoptosisofT24cellstomitomycin(MMC).TheseresultssuggestedthatblockageofIGF-IRsignalingmightpotentiallycontributetothetreatmentofbladdercancercellswhichareinsensitivetochemotherapy.
简介:目的:通过检测藏獒黑素皮质激素受体1(MClR)基因的单链构象多态性(SSCP)在不同毛色群体中的分布,探讨MClR基因多态性与毛色表型的相关性。方法:采用DNA测序技术,选择不同毛色藏獒的DNA为样本,根据GenBank发布的荷斯坦牛MClR基因序列设计一对引物,采用PCR-SSCP技术分析MClR基因在藏獒中的SSCP。结果:MClR基因在藏獒中具有PCR-SSCP多态性,分别检测到3种基因型(AA、AB和BB);对MClR基因多态性片段DNA克隆测序后发现,MClR基因在编码区第313位存在单碱基突变(G-,A),该突变导致第105位氨基酸发生由丙氨酸向苏氨酸的改变(T105A)。结论:肘CJR基因的多态性与毛色性状不存在显著的相关性。
简介:TheR(replicase)proteinistheuniquelydefinednon-structuralprotein(NSP)responsibleforRNAreplication,mutationrateorfidelity,regulationoftranscrip-tionincoronavirusesandmanyotherssRNAviruses.Basedonourcompletegenomesequencesoffourisolates(BJ01-BJ04)ofSARS-CoVfromBeijing,China,weanalyzedthestructureandpredictedfunctionsoftheRproteinincomparisonwith13otherisolatesofSARS-CoVand6othercoronaviruses.TheentireORF(open-readingframe)encodesfortwomajorenzymeactivities,RNA-dependentRNApolymerase(RdRp)andproteinaseactivities.TheRpolyproteinunder-goesacomplexproteolyticprocesstoproduce15function-relatedpeptides.Ahydrophobicdomain(HOD)andahydrophilicdomain(HID)arenewlyidentifiedwithinNSP1.ThesubstitutionrateoftheRproteinisclosetotheaverageoftheSARS-CoVgenome.ThefunctionaldomainsinallNSPsoftheRproteingivedifferentphylogeneticresultsthatsuggesttheirdifferentmutationrateunderselectivepressure.ElevenhighlyconservedregionsinRdRpandtwelvecleavagesitesby3CLP(chymotrypsin-likeprotein)havebeenidentifiedaspotentialdrugtargets.Findingssuggestthatitispossibletoobtaininformationaboutthephy-logenyofSARS-CoV,aswellaspotentialtoolsfordrugdesign,genotypinganddiagnosticsofSARS.
简介:【目的】松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明.【方法】通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异.【结果】参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣ)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因.相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因.推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用.GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在L,中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃.【结论】以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致.
简介:【背景】多样性比较是评价转基因作物对生物群落影响的标准参数之一。以往用于描述多样性的指数很多,但这些指数各有优缺点,生物学解释不全面。运用现代生物多样性表示方法,能够描述更复杂情况下的多样性关系。本文主要介绍了Rényi多样性指数曲线在生物安全研究中的应用。【方法】Rényi多样性指数曲线与以往常用的一维多样性指数不同,当其等级参数为某些特定值时代表了几个著名的多样性指数,该方法可较为确切地评价复杂的生物群落的多样性。本文在介绍其计算公式后,通过比较河北省2种转Bt基因棉田(孟山都33B和中棉30,均未施农药)以及常规管理(施用农药)和综合治理(IPM,施用农药和释放赤眼蜂相结合)条件下非转基因棉田的蜘蛛群落,证明了该方法的适用性。【结果】Rényi多样性指数曲线分析表明了所有可能的互作类型:1个明确的多样性排序以及2类棉田蜘蛛群落间不同的潜在关系。Rényi指数分析表明,在供试棉田中,中棉30棉田的蜘蛛多样性指数最高,其他3种棉田蜘蛛的多样性高低则难以一概而论。蜘蛛稀有种的多样性以孟山都33B棉田最高,IPM和常规棉田次之;蜘蛛常见种的多样性以IPM棉田最高,常规棉田和孟山都33B棉田次之。【结论与意义】Rényi多样性指数可用于生物群落多样性的综合评价,并可用于评价不同管理措施对生物多样性的影响。该方法弥补了仅用单一数量参数评价多样性的传统方法的缺陷,将不同参数整合成一个具有内在关联的概念框架。
简介:鼻-眼-脑型真菌感染(ROCM)致死率高达60%~85%,发病早期易误诊误治。文章就该病的流行病学特点、病理生理过程、临床表现、辅助检查、治疗方法作一简要综述,希望为临床诊治提供一定帮助。
简介:目的了解趾间型足癣患者趾间和健康志愿者趾间细菌菌种分布特征。方法对37例经临床和真菌镜检确诊的趾间型足癣患者的趾间进行细菌培养,然后给予1%联苯苄唑霜1次/d外用治疗4周,在治疗后的第1、2、4周分别对趾间再进行细菌培养。33例健康志愿者作为对照。结果健康志愿者趾间细菌培养葡萄球菌属占92.5%,其中表皮葡萄球菌占32.5%,未分离到金黄色葡萄球菌。趾间型足癣患者细菌培养葡萄球菌属占74.4%,其中金黄色葡萄球菌占27.9%,表皮葡萄球菌仅占2.3%,还分离到化脓性链球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、奇异变形杆菌、铜绿假单胞菌等。经过4周的外用联苯苄唑霜治疗,金黄色葡萄球菌消失,表皮葡萄球菌又成为优势菌(37.5%)。结论趾间型足癣患者趾间金黄色葡萄球菌的分离率明显高,此乃足癣继发细菌感染的主要致病菌,因此积极治疗足癣对预防足癣合并症有非常重要的意义。