简介:摘要目的探讨脑胶质瘤组织中八聚体结合转录因子4(OCT4)表达情况及其与患者预后的关系。方法收集南阳市第二人民医院2015年3月至2016年6月收治的脑胶质瘤患者168例和颅脑损伤术后手术留取的正常脑组织标本72例。采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测标本组织中OCT4A、OCT4B mRNA表达水平,分析其与脑胶质瘤患者临床病理特征及预后的关系。结果168例脑胶质瘤组织中OCT4A、OCT4B mRNA相对表达量分别为(2.28±0.85)、(2.84±1.29),均明显高于正常脑组织的(1.05±0.41)、(1.18±0.46),差异均有统计学意义(t=11.649、14.798,均P<0.01);脑胶质瘤组织中OCT4A与OCT4B mRNA表达水平呈正相关(r=0.682,P=0.001)。不同病理分期、病理类型、分化程度、浸润深度的脑胶质瘤患者OCT4A、OCT4B mRNA表达水平差异均有统计学意义(t=14.695、11.309,16.038、13.721,17.216、15.083,14.871、15.417,均P<0.01)。以OCT4A、OCT4B mRNA表达的中位值为界值,分为低表达、高表达,OCT4A、OCT4B低表达患者总生存期分别为(24.17±3.41)个月、(25.30±4.16)个月,均明显长于高表达患者的(15.80±2.93)个月、(15.94±3.07)个月,差异均有统计学意义(t=15.639、16.143,均P=0.000)。Cox回归模型分析显示,OCT4A、OCT4B表达水平是脑胶质瘤患者预后的独立影响因素,风险比(95%CI)分别为1.731(0.804~3.181)、1.605(0.795~2.942)。结论脑胶质瘤组织中OCT4A、OCT4B表达水平异常升高,且与患者病情严重程度密切相关;OCT4A、OCT4B高表达的患者总生存期较短,对脑胶质瘤的治疗效果和预后评估具有一定的预测价值。
简介:药物代谢酶包括参与I相代谢的细胞色素氧化酶CYP450超家族(CYPlAl/2、181、2A6、286、2C8、2C9、2(:19、2D6、2El、3A4/5/7)、乙醛脱氢酶(ALDH)、乙醇脱氢酶(ADH)和参与Ⅱ相代谢的N一乙酰基转移酶(NATl/2)、尿苷三磷酸葡萄糖醛酸基转移酶(UGT)等。其中细胞色素氧化酶P450是一组结构和功能相关的超家族基因编码的同工酶,参与大多数内源性物质(如脂肪酸、维生素、胆酸)的代谢,外源性物质(如药物、毒物)的解毒,前致癌物质(如芳香类物质)的激活等方面发挥重要的作用。因此,药物代谢酶不仅影响外源性物质代谢而与药理毒理学相关,并且影响内源性的脂代谢而与动脉粥样硬化等心血管疾病相关。
简介:C/EBPs增强子结合蛋白是核转录因子,其作用范围广泛,既参与正常的生理代谢过程,又与多种疾病的发生和发展相关,其作用方式多样,对转录有正、负调控作用。C/EBPβ是其第二位成员主要通过对靶细胞基因转录的调节,参与细胞的增殖与分化、肿瘤的发生与凋亡等重要生命活动;其功能受到蛋白酶降解、磷酸化、蛋白质相互作用等多种途径的调控。本文就C/EBPs的调控机理及其与肿瘤的关系综述如下。
简介:摘要:调节性T细胞是机体维持自身耐受性的重要组成部分。CD4+CD25+调节性T细胞(以下简称CDT细胞)来源于胸腺,是一具有免疫调节或免疫抑制作用的细胞亚群。它可以通过细胞接触依赖机制和抑制性细胞因子依赖机制来主动抑制自身免疫T细胞的活化,从而维持自身免疫耐受和防止自身免疫疾病的发生。最近研究发现,转录因子Foxp3对于调节性T细胞的发育是一个关键性的转录因子,并且已作为CD4+CD25+调节性T细胞的特异性标志。关键词:调节性T细胞,CDT细胞,转录因子Foxp3,免疫耐受,自身耐受,自身免疫疾病,免疫调节
简介:摘要目的探讨转录因子激活增强子结合蛋白4(TFAP4)在胃癌中对LINC01235表达的调控作用。方法通过生物信息学分析,获取TFAP4可在胃癌中调控的LINC01235。采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测在胃癌细胞中敲低TFAP4后LINC01235的表达变化。应用染色质免疫共沉淀(ChIP)法验证TFAP4可以结合LINC01235的启动子区域调控其转录。采取双荧光素酶报告实验计算相对荧光活性验证启动子区域的单核苷酸多态性(SNP) rs34667091可以促进转录。对独立样本采用t检验。结果肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌RNA-seq数据进行分析,可见LINC01235的高表达与不良预后明显相关(P<0.01)。JASPAR网站预测TFAP4可以调控LINC01235的表达。在胃癌细胞系中敲低TFAP4的表达后,LINC01235的表达水平随之降低。ChIP实验结果显示,与阴性对照组IgG比较,TFAP4与LINC01235的启动子区域结合富集百分比较高(0.000 299±2.129e-005比0.001 249±1.985e-005,t=32.640,P<0.01),差异有统计学意义。双荧光素酶报告实验结果显示,与正常对照组比较,LINC01235启动子区域的SNPs缺失后,TFAP4与启动子区域结合的相对荧光活性降低(1.000±0.207比0.341±0.031,t=3.151,P<0.05;1.000±0.156比0.157±0.042,t=5.221,P<0.05),差异均有统计学意义。结论LINC01235的表达水平在胃癌中和不良预后呈正相关,TFAP4可以调控LINC01235的转录,LINC01235的启动子区域的SNP rs34667091可作为增强子。
简介:摘 要:TCP蛋白家族是一类植物特有的转录因子家族,它们参与了植物的多种生理生化过程,具有重要的调控作用。根据其代表成员TB1,CYC和PCFs 的首位字母缩写,把含有这段保守氨基酸序列的基因命名为TCP,把这段保守氨基酸序列命名为TCP结构域(Cubas et al.,1999)。TCP结构域中的螺旋-环-螺旋区域(bHLH)含有两个由保守的亲水氨基酸所构成的中性螺旋结构和一个在中间负责连接两个螺旋区域的环结构。目前对TCP转录因子家族的研究主要是模式植物拟南芥、水稻和玉米,对蔬菜和果树尤其是苹果的研究报道还非常少。进一步研究TCP在苹果生长发育和代谢过程方面的功能是下一步的研究重点。
简介:摘要目的观察通过小干扰RNA(siRNA)干扰信号转导与转录激活因子-3(STAT3)的表达对胆管细胞癌生物功能的影响。方法培养胆管细胞癌细胞系人胆管上皮癌细胞(HUCCT1)和人胆管癌细胞(RBE),构建siRNA-710、siRNA-551和siRNA-2021这3个siRNA,使用脂质体3000(lipo3000)转染试剂将siRNA转染胆管细胞癌细胞,然后通过聚合酶链反应(PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测siRNA对STAT3的表达的干扰效果后选择siRNA-551进行后续实验。siRNA-551转染胆管细胞癌细胞48 h后通过细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞增殖、通过流式细胞术检测细胞凋亡率、通过Western blot检测细胞中白细胞介素-6(IL-6)和血管内皮生长因子(VEGF)的表达水平,并采用单因素方差分析实验结果。结果siRNA-551能够显著降低胆管细胞癌细胞中STAT3的mRNA(Messenger RNA)和蛋白质表达。HUCCT1和REB胆管细胞癌细胞转染siRNA-551后,STAT3干扰组胆管细胞癌细胞增殖水平[(74.49±0.96)%、(91.08±5.32)%]低于对照组[(100.00±5.52)%、(100.00±2.82)%,F=62.20、6.57,P<0.05]和NC组[(90.99±1.87)%、(99.74±4.71)%,F=184.57、4.45,P<0.05],差异有统计学意义;干扰组细胞凋亡率[(15.68±1.79)%、(11.30±0.67)%]高于对照组[(6.97±0.76)%、(6.12±0.37)%,F=60.01、138.40,P<0.05]和NC组[(9.21±0.63)%、(6.22±0.21)%,F=34.77、155.96,P<0.05],差异有统计学意义。HUCCT1细胞转染siRNA-551的胆管细胞癌细胞中IL-6和VEGF蛋白相对表达量(0.23±0.07、0.16±0.02)低于对照组(0.62±0.34、0.35±0.15,F=3.78、4.90,P<0.05)和NC组(0.59±0.07、0.47±0.39,F=37.46、2.11,P<0.05),差异有统计学意义;REB细胞转染siRNA-551的胆管细胞癌细胞中IL-6和VEGF蛋白相对表达量(0.22±0.11、0.80±0.08)低于对照组(0.51±0.11、1.89±0.13,F=11.39、151.69,P<0.05)和NC组(0.60±0.34、1.46±0.48,F=3.39、140.20,P<0.05),差异有统计学意义。结论通过siRNA干扰胆管细胞癌细胞中的STAT3表达具有抑癌的效果。
简介:摘要目的探讨重症肌无力(MG)患者外周血CD4+T细胞中转录因子Foxp1 mRNA的表达及他克莫司免疫治疗前后Foxp1 mRNA的表达变化。方法前瞻性选择郑州大学第一附属医院神经内科自2018年1月至2020年1月收治的MG患者26例(MG组)和自2018年1月至2019年6月门诊健康体检者18例(正常对照组)进入研究。采用重症肌无力定量评分(QMGs)评估MG患者的疾病严重程度。于MG患者治疗前、治疗后6个月,正常对照者入组后即刻,抽取受试者外周静脉血15 mL,采用免疫磁珠法分选外周血单个核细胞(PBMC)中的CD4+T细胞,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测2组受试者CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达。采用Spearman相关性检验分析MG患者CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达与QMGs评分、血清抗乙酰胆碱受体(AchR)抗体浓度的相关性。结果26例MG患者中眼肌型MG(oMG)10例,全身型MG(gMG)16例;伴胸腺瘤7例,胸腺增生2例,胸腺正常17例。与正常对照组(1.051±0.364)比较,MG组患者CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达(0.692±0.257)明显下降,差异有统计学意义(P<0.05)。gMG患者CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达较oMG患者明显下降,差异有统计学意义(P<0.05)。MG患者接受他克莫司单药治疗6个月后CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达较治疗前明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。相关性分析显示MG患者治疗前CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达与QMGs评分呈负相关关系(r=-0.438,P=0.025)。结论MG患者CD4+T细胞中Foxp1 mRNA的表达下降,其表达水平与疾病严重程度呈负相关,且在一定程度上可以反应他克莫司免疫治疗的疗效。
简介:摘要目的探讨人脑胶质瘤组织中锌指样转录因子4(KLF4)的表达及其对肿瘤细胞活性的影响。方法收集2018年3月至2019年5月河南省南阳市第二人民医院收治的74例初发恶性胶质瘤患者术中切除的胶质瘤组织标本,收集同期手术切除的50例良性脑膜瘤组织,以及31例因头部外伤手术切除的正常脑组织。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测组织中KLF4 mRNA表达水平。选取脑胶质瘤U-87MG细胞,构建KLF4低表达脑胶质瘤细胞模型,分为空白对照组、KLF4-NC组、KLF4-siRNA组。MTS细胞增殖检测试剂盒检测细胞增殖能力,蛋白质印迹法检测E-钙黏蛋白、波形蛋白、紧密连接蛋白1(ZO-1)表达水平。结果低级别胶质瘤、良性脑膜瘤、正常脑组织中KLF4 mRNA相对表达量分别为0.26±0.04、0.13±0.02、0.11±0.02,均低于高级别胶质瘤的0.34±0.06,差异均有统计学意义(t值分别为8.381、15.720、15.984,均P<0.05);良性脑膜瘤、正常脑组织中KLF4 mRNA相对表达量低于低级别胶质瘤,差异均有统计学意义(t值分别为13.771、14.239,均P<0.05)。细胞培养各时间点,KLF4-siRNA组U-87MG细胞增殖能力均低于空白对照组和KLF4-NC组,差异均有统计学意义(均P<0.05);空白对照组与KLF4-NC组U-87MG细胞增殖能力之间差异无统计学意义(P>0.05)。KLF4-siRNA组E-钙黏蛋白、ZO-1蛋白相对表达量分别为0.82±0.10、0.79±0.11,均高于空白对照组的0.24±0.08、0.39±0.05和KLF4-NC组的0.26±0.05、0.42±0.09,差异均有统计学意义(均P<0.01);KLF4-siRNA组波形蛋白相对表达量为0.31±0.08,低于空白对照组的0.90±0.08和KLF4-NC组的0.92±0.05,差异均有统计学意义(均P<0.01);空白对照组与KLF4-NC组间E-钙黏蛋白、波形蛋白、ZO-1蛋白表达水平差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论人脑胶质瘤组织,尤其高级别胶质瘤中KLF4表达水平升高。下调KLF4表达可能抑制胶质瘤细胞增殖和上皮间质转化的发生,降低细胞活性。
简介:摘要目的探索转录因子(transcription factors, TFs)和结肠癌预后的联系,通过TCGA和GEO双数据库构建预后模型,从而量化患者的风险并指导临床治疗决策。方法本研究运用TCGA和GEO数据库中结肠癌的转录组和临床数据,先将转录组数据进行基因注释并计算基因表达量,对TCGA和GEO中TFs行差异性分析(| log2FC| >1,P-Value(Fdr)<0.05)。取双数据交集的差异TFs行相关预后分析(P<0.01)。利用COX多因素分析计算出预后相关TFs的风险系数和其风险值,应用"survival"和"glmnet"包进行COX模型构建TFs预后模型。绘制出序列集和验证集的生存曲线(P<0.001)及ROC曲线(AUC>0.75),对风险值的分布进行可视化。按风险值分组后计算GSEA富集分析,构建基因集网格,进行靶基因预测,最后进行GO和KEGG的通路富集分析。结果取TCGA和GEO数据库两者交集的387个表达差异的TFs绘制热图,火山图及TFs相关的森林图,按照COX多因素分析构建出结肠癌预后模型=0.310×HSF4+0.137×IRX3-0.127× ATOH1+0.290×OVOL3+0.137×HOXC6+0.155×SIX2+0.092×ZNF556-0.444×CXXC5+0.429×TIGD1+0.413×TCF7L1。通过富集分析,结果显示这些预后因子可能直接或间接作用于癌通路,如基础细胞癌与癌症信号通路、局部组织与细胞黏附及细胞外基质等。结论构建的TFs对结肠癌预后模型可量化结肠癌预后风险,其高风险组是结肠癌预后的独立风险因素,该模型是一种评估结肠癌预后的新方式。