简介:IntheapplicationofRNAitechnology,itisanessentialsteptodesignsiRNAapplicabletotargetgene.Atpresent,therearemanyresearchesandconclusionsonsiRNAdesign.ThispaperaimstotheinfluencesofmRNAsecondarystructureorsiRNAantisense-strandsecondarystructureonsiRNAsilenceefficiency.Thepaperalsodiscussestheproblemsandsetsoutfurtherinsightsintheresearch.
简介:SmallRNA(sRNA)-mediatedpost-transcriptionalregulationdiffersfromprotein-mediatedregulation.Throughbasepairing,sRNAcanregulatethetargetmRNAinacatalyticorstoichiometricmanner.Sometheoreticalmodelswerebuiltforcomparisonoftheprotein-mediatedandsRNA-mediatedmodesinthesteady-statebehaviorsandnoiseproperties.ManyexperimentsdemonstratedthatasinglesRNAcanregulateseveralmRNAs,whichcausescrosstalkbetweenthetargets.Here,wefocusonsomemodelsinwhichtwotargetmRNAsaresilencedbythesamesRNAtodiscusstheircrosstalkfeatures.Additionally,thesequence-functionrelationshipofsRNAanditsroleinthekineticprocessofbase-pairinghavebeenhighlightedinmodelbuilding.
简介:Longnon-codingRNAs(lncRNAs)refertoagroupofRNAsthatareusuallymorethan200nucleotidesandarenotinvolvedinproteingeneration.Instead,lncRNAsareinvolvedindifferentregulatoryprocesses,suchasregulationofgeneexpression.DifferentlncRNAsexistthroughoutthegenome.LncRNAsarealsoknownfortheirrolesindifferenthumandiseasessuchascancer.HOTAIRisanlncRNAthatplaysaroleasanoncogenicmoleculeindifferentcancercells,suchasbreast,gastric,colorectal,andcervicalcancercells.Therefore,HOTAIRexpressionlevelisapotentialbiomarkerfordiagnosticandtherapeuticpurposesinseveralcancers.ThisRNAtakespartinepigeneticregulationofgenesandplaysanimportantroleindifferentcellularpathwaysbyinteractingwithPolycombRepressiveComplex2(PRC2).Inthisreview,wedescribethemolecularfunctionandregulationofHOTAIRanditsroleindifferenttypesofcancers.
简介:Recently,RNAprocessinghasemergedasanovelpathwaythatmaycontributetothemaintenanceofgenomestability[1].Alternativesplicingisakeymolecularmechanismforincreasingthefunctionaldiversityoftheeukaryoticproteomes,butitalsooftenalteredincancer.Mountingevidenceindicatesthatalternativesplicing,theprocessthatallowsproductionofmultiplemRNAvariantsfromeachgene,contributestotheheterogeneityofthedisease[2].Althoughthemechanismofalternativesplicingvariantincancerisunclear,thecancer-specificalternativesplicingvariantshavebeenobservedinavarietyofhumancancersandcancercelllinesandhavebeenconnectedtotumorgenesis.
简介:摘要目的探讨艾滋病患者的血小板减少和血HIV-RNA数量的关系,方法对2009年12月-2013年4月笔者所在中心收治的200例AIDS患者的临床资料进行统计分析,观察艾滋病患者血中血小板减少症与血HIV-RNA拷贝数的关系及治疗前后血小板计数及血HIV-RNA拷贝数的变化情况,使用SPSS18.0软件对收集的数据进行分析。结果艾滋病患者中细胞计数<100×106/L中血小板减少症的发生率为17.50%,根据WHO血小板减少分级,35例艾滋病患者中I度10人,血小板均值为85±13,II度为8人血小板均值68±10,III度为6人45±3,IV度11人,18±5,HIV-RNA数量分别为2.88±1.41,3.05±1.41,3.53±1.41,5.34±1.41,log,copies/ml,(组内P>0.05,组间P<0.05),35例艾滋病血小板减少患者在HAART初次启动的0、24周,外周血HIVRNA水平分别为(4.12±1.41),≤1.69log,copies/ml,血小板数量分别为78±20、123±15)个/ul,(组内P>0.05,组间P<0.05);统计学分析显示艾滋病患者中血小板减少症患者的血小板减少程度在治疗前与血HIV-RNA数量呈负相关,治疗后血小板数量增加的程度与血HIV-RNA数量呈负相关,结论AIDS相关血小板减少与血HIV-RNA数量有着密切关系,临床可通过血小板计数判断血HIV-RNA的拷贝水平,预测AIDS患者病情的发展程度。通过采用抗逆转录病毒治疗,可改善AIDS相关血小板减少患者的预后。
简介:目的:检测前列腺癌及癌旁正常前列腺组织中RNA结合蛋白QKI-5的表达情况并分析其临床意义。方法:收集前列腺癌及与之匹配的癌旁组织124例,通过免疫组化染色、Westernblot、实时PCR方法检测其QKI-5的表达水平,并分析QKI-5的表达与前列腺癌临床病理特征的关系。结果:前列腺癌组织中QKI-5蛋白及mRNA表达水平均明显低于癌旁正常前列腺组织,并且随着Gleason评分的增高而降低(P〈0.05)。前列腺癌组织中QKI-5的表达与其Gleason评分(r=-0.939,P〈0.05)、TNM分期(r=-0.913,P〈0.05)、血清PSA值(r=-0.743,P〈0.05)均密切相关。结论:QKI-5在前列腺癌的发生发展过程中可能起抑癌基因的作用,并可能作为前列腺癌的诊断、病情分析和预后评估的参考指标。
简介:昆虫的embryonic以后开发高度依赖于ecdysteroid荷尔蒙20-hydroxyecdysone。万圣节前夕基因更鬼(spok,cyp307a2)被记录了在果蝇melanogaster和Bombyxmori涉及ecdysteroidogenesis。我们这里描述克隆和万圣节前夕基因的描述更鬼(Lsspok,Lscyp307a2)在小棕色的planthopperLaodelphaxstriatellus,hemipteran昆虫种。LsSPOK有三个保存昆虫的P450主题,也就是说Helix-K,PERF主题和heme有约束力的领域。Lsspok的时间、空间的表示模式被量的聚合酶链反应评估。通过fouth中间形态和早第五中间形态的阶段,Lsspok显示出二表情在秒天和第五天的第四中间形态的美女的山峰,和二马槽在第一天第四和第五中间形态。在白天5第四中间形态的美女上,Lsspok清楚地在prothoracic腺被定位的胸有高抄本水平。在美女阶段的Lsspok的双strandedRNA的饮食的介绍成功地将目标基因击倒,蜕皮激素的减少的表达式水平受体(LsEcR)基因,引起的nymph的致命性和推迟的开发。在Lsspok-dsRNA-exposed美女的20-hydroxyecdysone的摄取没增加Lsspok表示水平,但是几乎完全救LsEcRmRNA水平并且在幸存和发展上减轻否定效果。因此,我们的数据建议ecdysteroidogenic小径在昆虫被保存,LsSPOK为在在L的ecdysteroidogenesis的特定的步负责。striatellus。
简介:目的:比较分析长链非编码RNA(lncRNA)在乳腺癌组织与外周血中的表达情况,筛选出参与乳腺癌发生、复发及转移过程中重要的lncRNA。方法利用芯片技术分别检测并筛选乳腺癌组织与外周血差异表达的lncRNA及mRNA,应用生物信息学方法,包括基因本体论(geneontology,GO)和Pathway分析,分析乳腺癌组织与外周血中lncRNA及mRNA的表达谱。分析得到乳腺癌外周血与癌组织中共同表达与特异表达的lncRNA,并且进一步分析差异基因可能调控的相关通路,进而发现参与乳腺癌发生发展和转移过程的lncRNAs。结果笔者发现在乳腺癌组织和外周血中共同上调的lncRNA有7条(包括RP11-707G14.7、RP11-771K4.1、XLOC013658、RP11-201A3.1、RP11-298H24.1、BM151951、XLOC011403),共同下调的lncRNA有12条(LOC100506035、PWRN1、MAGI2-AS3、RP11-67L3.2、CTC-454M9.1、AC017006.2、AC002456.2、RP11-430B1.2、RP11-945C19.4、RP11-839D17.3、CTA-407F11.8、LINC00420)。GO和Pathway分析结果表明在乳腺癌患者外周血和组织中均差异表达的基因主要参与调控免疫反应与TGF-β通路等。结论lncRNA在乳腺癌组织和外周血中呈差异表达,可能参与到乳腺癌的发生、发展以及复发转移中,有可能成为临床诊断与治疗乳腺癌的新靶点。
简介:前列腺特异性抗原(PSA)是目前诊断前列腺癌最常用的指标。然而,当PSA处于灰区(4--10ng/ml)时,它则缺少足够的敏感性与特异性,给诊断带来了困难。因此,需要一种新的肿瘤标志物来弥补PSA的这一缺陷。最近,随着基因相关技术的发展,长链非编码RNA(lncRNA)有可能成为新的诊断前列腺癌的标志物。它们在基因的转录,转录后以及基因调控的表观遗传学上都有着不同的功能,因此它们在肿瘤的发生与发展中扮演了重要的角色。在前列腺癌中,已经有越来越多的lncRNA的异常表达被检测出。由于这些lncRNA独特的性质,也许会带来一些新的无创而高效的检测前列腺癌的方法。它们中的一些,像是PCA3和MALAT-1都已经投入临床的使用,而其他更多的则还处于基础研究中。相比PSA,一些lncRNA已经被证实了在某些情况下具备对前列腺癌更强的诊断效能。而随着认识的逐渐加深与技术的持续发展,lncRNA有可能在未来成为替代PSA的检测前列腺癌的更好的标志物。
简介:
简介:目的探讨微小RNA(miR)-181a对唾液腺腺样囊性癌(SACC)细胞增殖能力的体内外作用影响。方法通过过表达或沉默miR-181a在SACC-LM和SACC-83细胞中的表达。实时荧光定量PCR检测转染后SACC细胞株中miR-181a的表达水平。MTT法检测miR-181a对SACC细胞体外增殖能力的影响。Westernblot检测转染后生长因子因子表达的改变。裸鼠皮下移植瘤模型检测miR-181a对SACC细胞体内增殖能力的影响。采用SPSS17.0软件对数据进行统计学处理,以P<0.05为差异具有统计学意义。结果实时荧光定量PCR结果示,转染后SACC-LM细胞中miR-181a表达升高(t=-9.198,P=0.012),而SACC-83细胞中miR-181a表达降低(t=-7.241,P=0.019);SACC-LM细胞增殖能力降低(t=-4.58,P=0.045),而SACC-83细胞增殖能力提高(t=3.016,P=0.03);SACC-LM细胞中转化生长因子β2(TGF-β2)、神经生长因子(NGF)和血管内皮生长因子(VEGF)的表达水平均下调,而SACC-83细胞中TGF-β2、NGF和VEGF的表达水平均升高。裸鼠皮下移植瘤模型结果显示,miR-181amimics组移植瘤瘤体明显小于mimicsNC组(t=-4.692,P=0.043)。结论miR-181a能抑制SACC细胞体内体外的增殖能力。
简介:摘要目的观察分析血清HCV-RNA、抗-HCV抗体及肝脏酶谱联合诊断治疗丙型肝炎的临床意义。方法以2014年3月~2015年1月期间,住院部所收治的丙型肝炎患者共计100例作为研究对象,对血清HCV-RNA、抗HCV抗体、以及ALT检测指标对应关系进行分析。结果100例丙型肝炎患者中,HCV抗体检出阳性共计97例,阳性检出率为97.00%,其中血清HCV-RNA检出阳性患者为77例,另有3例患者HCV抗体检出结果为阴性,但血清HCV-RNA检出2例患者为阳性。血清HCV-RNA检出阳性与阴性组患者ALT异常检出率数据对比存在显著差异,P<0.05,具有统计学意义。HCV抗体检出阳性与阴性组患者ALT异常检出率数据对比不存在显著差异,P>0.05,不具有统计学意义。结论血清HCV-RNA、抗HCV抗体及肝脏酶谱联合诊断治疗丙型肝炎临床意义确切,可供临床应用与参考。