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19 个结果
  • 简介:为了学习简历,活跃代谢物由导出海绵的未耕作的共生者生产了,海绵Gelliodesgracilis的共生者的一个metagenomicDNA图书馆被构造。DNA的平均尺寸在图书馆插入是20kb。这个图书馆用纸圆盘assaying为抗菌素活动被屏蔽。二克隆对小球菌tetragenus显示了抗菌剂活动。这二克隆的代谢物通过HPLC被分析。结果证明他们的代谢物与主人E的那些相当不同。包含向量pHZ132的关口iDH5α和主人。这研究可以介绍一条新途径给探索简历海绵共生者的活跃代谢物。

  • 标签: 海绵 共生体 生物活性 代谢物 生物化学
  • 简介:Inthisstudy,theentiremitochondrialDNA(mtDNA)controlregion(CR)ofPholisfangiwasamplifiedviapolymerasechainreactionfollowedbydirectsequencing.ThelengthofthemtDNACRconsensussequenceofP.fangiwas853bpinlength.Inaccordancewiththerecognitionsitesaswerepreviouslyreportedinfishspecies,themtDNACRsequenceofP.fangicanbedividedinto3domains,i.e.,theextendedterminalassociatedsequence(ETAS),thecentralconservedsequenceblock(CSB),andtheCSBdomain.Inaddition,thefollowingstructureswereidentifiedinthemtDNACRsequenceofP.fangi:2ETASsintheETASdomain(TASandcTAS),6CSBsinthecentralCSBdomain(CSB-FtoCSB-A),and3CSBsintheCSBdomain(CSB-1toCSB-3).ThesedemonstratedthatthestructureofthemtDNACRofP.fangiwassubstantiallydifferentfromthoseofmostotherfishspecies.ThemtDNACRsequenceofP.fangicontainedoneconservedregionfrom656bpto815bp.Similartomostotherfishspecies,P.fangihasnotandemrepeatsequencesinitsmtDNACRsequence.PhylogeneticanalysisbasedonthecompletemtDNACRsequencesshowedthattherewerenogeneticdifferenceswithinP.fangipopulationsofthesamegeographicaloriginandbetweenP.fangipopulationsofdifferentgeographicalorigins.

  • 标签: 线粒体DNA控制区 结构 系统学 DNA序列 MTDNA 聚合酶链反应
  • 简介:Mercury(Hg)isoneofthecommonlyencounteredheavymetals,whichiswidespreadininshoresedimentsofChina.InordertoinvestigatethetoxicityofHgonmarineinvertebrates,westudiedtheeffectsofthedivalentmercuricion(Hg2+)(attwofinalconcentrationsof0.0025and0.0050mgL-1,preparedwithHgCl2)onmetallothionein(MT)content,DNAintegrity(DNAstrandbreaks)andcatalase(CAT)inthegillsandhepatopancreas,antioxidantenzymeactivitiesofsuperoxidedismutase(SOD),catalase(CAT)andglutathioneperoxidase(GPx),inthehemolymph,gillsandhepatopancreasoftheportunidcrabCharybdisjaponicaforanexperimentperiodupto15d.TheresultsindicatedthatMTwassignificantlyinducedafter3d,withapositivecorrelationwithHg2+doseandtimeinthehepatopancreasandanegativecorrelationwithHg2+doseandtimeinthegills.WhileCATinthehemolymphwasnotdetected,itincreasedinthehepatopancreasduringtheentireexperiment;SODandGPxinthethreetissueswerestimulatedafter12h,bothattainedpeakvalueandthenreducedduringtheexperimentalperiod.Meanwhile,DNAstrandbreakswereallinducedsignificantlyafter12h.TheseresultssuggestedthedetoxificationstrategiesagainstHg2+inthreetissuesofC.japonica.

  • 标签: DNA链断裂 过氧化氢酶 氯化汞 整性 螃蟹 日本蟳
  • 简介:为实现深远海潮汐动态变化信息的实时监测,在历元差分模型基础上进行星差分,设计并实现了基于星历元差分的精密单点定位算法.利用1Hz静、动态实测GPS数据验证结果表明,静态观测下Z、F、Z方向的历元坐标差均小于1cm,各坐标分量精度(RMS)优于0.16cm;海洋浮标低动态下,与成熟的GAMIT/TRACK软件解算结果比较,二者在X、F、Z方向的坐标差较差均小于2cm,各坐标分量较差精度(RMS)优于0.5cm.

  • 标签: 全球定位系统 精密单点定位 星间历元间差分模型 精度分析 TRACK
  • 简介:Aciladivaricata(Hinds,1843)andA.mirabilis(AdamsandReeve,1850)arecommonbenthicbivalvesinChina.Anumberofresearchershaveproposedthatthelatterspeciesisajuniorsynonymoftheformerspecies.Becauseofmorphologicalsimilarities,itisdifficulttodistinguishthesetwospeciesbasedonvisualexaminationonly.Forbetterunderstandingoftheirtaxonomy,themitochondrialCOIgenefragmentsoffiveindividualsofA.divaricatafromtheEastChinaSeaandsixindividualsofA.mirabilisfromtheYellowSeaweresequencedinthisstudy.ThephylogeneticrelationshipsoftheobtainedCOIsequences,togetherwithnineteensequencesofthreespeciesofthegenusNucula,wereanalyzed.Thepairwiseintra-andinter-specificdistancesfortheCOIsequencesrangedfrom0.002to0.017andfrom0.128to0.134,respectively,andnooverlapwasfound.Phylogenetically,A.divaricataandA.mirabilisformdistinctcladesandclusterintoasistertoallotherNuculaspecies.TheresultsindicatedthatA.divaricataandA.mirabilisaretwodistinctspecies.Thedifferencesinthemorphologyanddistributionbetweenthetwospecieswerebrieflydiscussed.

  • 标签: 线粒体 物种 杆菌 防风 DNA 系统发育关系
  • 简介:Inthispaper,wetooktheleadinstudyingonspecificityofthemicrosatelliteDNAlociandapplicabilityofmicrosatelliteDNAprimersinprotozoa.Inordertostudycharactersofmicrosatellitesinfree-livingprotozoa,eightmicrosatellitelociprimersdevelopedfromTrypanosomacruzi(MCLE01,SCLE10,MCLE08,SCLE11,MCLF10,MCLG10,MCL03,MCL05)wereemployedtoamplifymicrosatelliteinfourfree-livingprotozoa,includingBododesignis,EuglenagracilisFACHB848,ParameciumbruziseandTetrahymenathermophilaBF1.IntheamplificationsystemsofP.bruzise,fourloci(SCLE10,SCLE11,MCLF10,MCL03)wereamplifiedsuccessfully,andfouramplificationfragmentswereinpropersize.IngenomeofE.gracilisFACHB848,fiveofeightprimersbroughtfiveclearamplificationbands.InB.designis,three(No.4,5and7)ofeightlociproducedclearandsharpproductswithoutstutterbands,whereasnobandsappearedinT.thermophilaBF1.Further,eight300-500bpamplificationfragmentswereclonedandsequenced.Nevertheless,allsequencedproductsdidnotcontaincorrespondingmicrosatellitesequence,althoughBodoisinthesameorderandhasthenearestphylogeneticrelationwithTrypanosomaamongthesefourspecies.Thus,themicrosatelliteDNAprimerscannotbeappliedamongorderormorefartaxa,andthespecificityofmicrosatelliteDNAisveryhighinprotozoa.TheresultsofthisstudywillcontributetoourunderstandingofmicrosatelliteDNAinprotozoa.

  • 标签: 原生动物 DNA分析 锥虫 多行性 水生生物
  • 简介:海湾平面平衡形态规律的研究是砂质海岸稳定与演变研究的重要内容。简要回顾了岬海湾平面形态规律的研究进展,着重介绍了研究海湾平衡形态的五个模型。通过评述平衡形态模型的优缺点,指出机理分析和经验拟合相结合应该为以后海湾平面平衡形态规律的研究发展方向,并论述了我国岬砂质海湾平面平衡形态研究的重要意义。

  • 标签: 岬间海湾 平衡形态模型 海岸演变
  • 简介:Saccharina是最重要的无热水设备生活水兵褐之一海藻的类。在这研究,我们分析了S的transcriptome。装饰用的梨树,它属于1000植物(OneKP)工程,由使用定序技术的下一代的高产量的DNA。未加工的数据的大约5.16GB被产生,并且有454bp的平均长度的65536脚手架与肥皂denovo汇编方法被装配。总共,19040unigenes被强风识别;25734脚手架被聚类进37基因本体论功能的组;6760脚手架被分类进25个轮牙范畴,以及被分到306条KEGG小径的2665脚手架。unigenes的多数比另外的cyanobacteria,海洋的硅藻,和植物包括棕色的水藻和硅藻展出了更多的类似到水藻。Saccharina装饰用的梨树有突出的能力积累象Br那样的卤素,我从海水经由halogenation处理。我们在S获得了42不同钒依赖者haloperoxidases(vHPO)。装饰用的梨树transcriptome数据,包括钒依赖者iodoperoxidase(vIPO)的5个片断和钒依赖者bromoperoxidase(vBPO)的37个片断。识别fulllengthS的复杂分析。装饰用的梨树vBPO1和S。装饰用的梨树vBPO2在在海洋的海藻的vBPOs和vIPOs之间的棕色的水藻和强壮的关系的种类之中揭示了vBPO的重要性。这研究将提高我们生物特征的理解和S的经济价值。装饰用的梨树种类。

  • 标签: DNA测序技术 过氧化物酶 粳稻品种 基因本体论 高通量 转录
  • 简介:依据国际海洋法公约对海洋划界的"中间"线要求和定义,剖析了中间线(中轴)和比例线法的原理,相应剖析并讨论了中间线法缺点所在,指出严密实现地球椭球面上自然图形比例线方法是海上划界技术的新的趋势,介绍了地图代数在中间线法、比例线法上的基础性工作。

  • 标签: 海洋划界 中间线 比例线 中轴 度量空间 地图代数
  • 简介:结合2015年某海洋测绘任务特点,对跨海水准测量的误差来源进行了认真分析,做出了利用跨海水准测量实现岛屿高程传递的技术方案设计。针对跨海水准测量存在的3种重要误差来源,利用辅助设备测量全站仪和觇板高度、适当增加测角测回数提高垂直角测量精度、精心策划测量步骤减小大气垂直折光误差等手段,有效消除和减小了误差项影响,最后通过平差得到了高差单位权中误差为±2.69mm的测量成果,满足了三等水准测量要求,实现了海洋岛屿的大跨度高程传递。

  • 标签: 海洋测绘 跨海水准 误差分析 辅助测高 测角精度 大气折光误差
  • 简介:卫星星历的计算涉及三种近点角,利用近点角的几何关系,借助计算机代数系统推导出近点角的差异极值点及对应的差异极值符号表达式,并将其表示为关于偏心率e的幂级数形式。分别取偏心率e=0.01、e=0.1和e=0.2(小偏心率)为例,将近点角的差异明确在数值上面。结果表明,近点角的差异极值的绝对值与偏心率e密切相关,近似为偏心率e的一倍或者两倍的关系。这些分析结果可为研究近点角之间的关系、卫星星历计算以及卫星精密定轨提供理论基础。

  • 标签: 平近点角 偏近点角 真近点角 差异极值 极值点 符号表达式
  • 简介:在本研究中,我们首次通过基因组上游第一次步移克隆到了雨生红球藻中crtO基因的3个不同大小的5’上游侧翼序列1.1kb,1.9kb和2.2kb。利用生物信息学方法分别预测并比较了这3个不同大小的5’上游侧翼序列,结果发现,三者具有与高等植物相类似的顺式作用元件,如脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G1-box,GAG-motif,l-boxandATC—motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE)等等,但是三者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中crtO基因调控方式的多样化。

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5’上游侧翼学列 雨生红球藻 crtO
  • 简介:单细胞淡水绿藻-雨生红球藻能够在一定条件积累一种次生类胡萝卜素-虾青素,因而在生长后期藻体变为深红色。其中,IPP异构酶在雨生红球藻中的虾青素合成过程中发挥了重要作用。在本研究中,我们首次通过基因组上游步移克隆到了雨生红球藻中IPP异构酶基因的两个不同5’上游侧翼序列,大小分别是1.8kb和2.5kb。利用生物信息学方法分别对这两个不同5’上游侧翼序列进行了序列分析,结果发现,二者具有某些相同的顺式作用元件,如可能的脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box,GAG-motif,I-boxandATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、水杨酸反应元件(TCA-element)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)、缺氧特异反应中的增强子类似元件(GC-motif)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE),但是二者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中IPP异构酶基因转录调控方式的多样化。

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5’上游侧翼学列 雨生红球藻 IPP异构酶基因
  • 简介:单细胞淡水绿藻—雨生红球藻能够在一定条件积累一种次生类胡萝卜素—虾青素,因而在生长后期藻体变为深红色。其中,IPP异构酶在雨生红球藻中的虾青素合成过程中发挥了重要作用。在本研究中,我们首次通过基因组上游步移克隆到了雨生红球藻中IPP异构酶基因的两个不同5’上游侧翼序列,大小分别是1.8kb和2.5kb。利用生物信息学方法分别对这两个不同5′上游侧翼序列进行了序列分析,结果发现,二者具有某些相同的顺式作用元件,如可能的脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box,GAG-motif,I-boxandATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、水杨酸反应元件(TCA-element)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)、缺氧特异反应中的增强子类似元件(GC-motif)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE),但是二者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中IPP异构酶基因转录调控方式的多样化。更多还原

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5′上游侧翼学列 雨生红球藻 IPP异构酶基因
  • 简介:在本研究中,我们首次通过基因组上游第一次步移克隆到了雨生红球藻中crtO基因的3个不同大小的5’上游侧翼序列1.1kb,1.9kb和2.2kb。利用生物信息学方法分别预测并比较了这3个不同大小的5’上游侧翼序列,结果发现,三者具有与高等植物相类似的顺式作用元件,如脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G-box,GAG-motif,I-boxandATC-motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE)等等,但是三者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中crtO基因调控方式的多样化。更多还原

  • 标签: 虾青素 顺式作用元件 5’上游侧翼学列 雨生红球藻 crtO
  • 简介:测定了相手蟹属(Sesarma)红螯相手蟹(S.haematocheir)和褶痕相手蟹(S.plicata)线粒体16SrRNA基因部分片段的序列,二者的序列长度相同,均为533bp,且A、T、G、C的含量相似,分别为198bp(37.1%),206bp(38.6%),84bp(15.8%),45bp(8.4%)和200bp(37.5%),205bp(38.5%),81bp(15.2%),47bp(8.8%);二者的序列有49处差异,其中21个位点为转换、22个位点为颠换和6个缺失/插入位点。进一步对20种相手蟹属蟹类的长度为361bp的16SrRNA基因同源序列进行分析,发现AT的含量为78.6%~82.9%,明显高于GC的含量,且存有91个变异位点。从NJ树和遗传距离来看,在分布于中国的3种相手蟹中,无齿相手型(S.dehaani)和红螯相手蟹的亲缘关系最近(d=0.0151),而它们与褶痕相手蟹的亲缘关系则较远(d=0.0924/0.09231。分布于中国的相手蟹和分布于北美的相手蟹之间存在着较大的遗传距离(差异),表明它们之间有着较远的亲缘关系,互为单系起源。

  • 标签: 红螯相手蟹 褶痕相手蟹 16S RRNA 系统发生
  • 简介:对湛江东海岛潮带表层沉积物中酸可挥发性硫化物(AVS)和同步提取重金属(SEM)的含量及其分布进行了研究。研究表明,东海岛潮带表层沉积物中AVS含量夏季平均为0.449μmol/g,冬季为1.816μmol/g,大多数站位AVS含量冬季高于夏季;AVS平均含量总体呈南、北区较高,东、西区较低的区域分布规律。潮区沉积物可提取重金属SEM总量夏季在0.56μmol/g-4.60μmol/g之间,冬季处于0.65μmol/g-2.21μmol/g之间;各重金属平均含量大小为Zn〉Cr〉Pb〉Cu〉Cd,其中Cd含量占SEM总量不到1%,Zn含量则在70%以上,SEMZn是控制着SEM分布的主要模式。联合利用(∑SEM/AVS)与(∑SEM-AVS)法和生物毒性阈值法综合评估重金属对沉积环境的影响,东海岛潮带大部分区域沉积物中(∑SEM-AVS)处于0-5之间,重金属潜在生物毒性较强的区域为通明海区(7号站和8号站所在),具有较强潜在生物毒性的重金属为夏季通明海区的Zn。

  • 标签: AVS SEM 表层沉积物 潮间带 东海岛
  • 简介:对湛江东海岛潮带表层沉积物中酸可挥发性硫化物(AVS)和同步提取重金属(SEM)的含量及其分布进行了研究。研究表明,东海岛潮带表层沉积物中AVS含量夏季平均为0.449μmol/g,冬季为1.816μmol/g,大多数站位AVS含量冬季高于夏季;AVS平均含量总体呈南、北区较高,东、西区较低的区域分布规律。潮区沉积物可提取重金属SEM总量夏季在0.56μmol/g~4.60μmol/g之间,冬季处于0.65μmol/g~2.21μmol/g之间;各重金属平均含量大小为Zn>Cr>Pb>Cu>Cd,其中Cd含量占SEM总量不到1%,Zn含量则在70%以上,SEMZn是控制着SEM分布的主要模式。联合利用(∑SEM/AVS)与(∑SEM-AVS)法和生物毒性阈值法综合评估重金属对沉积环境的影响,东海岛潮带大部分区域沉积物中(∑SEM-AVS)处于0~5之间,重金属潜在生物毒性较强的区域为通明海区(7号站和8号站所在),具有较强潜在生物毒性的重金属为夏季通明海区的Zn。

  • 标签: AVS SEM 表层沉积物 潮间带 东海岛
  • 简介:我们曾报道了短梗霉菌产生的高纤维素酶产量98。在这项研究中,羧甲基纤维素酶(CMCase)在培养的细胞。短梗霉98的纯化至均一,与酶的最大产量为4.51U(mg蛋白)-1。SDS-PAGE分析表明,纯化的酶的分子量为67.0kda。具有相当的敏感性为40℃纯化的酶的最适温度,比从其他真菌的cmcases低得多。该酶的最佳pH值为5.6,和活动的个人资料被稳定在一个范围内的酸度(pH5,0-6.0)。这种酶被激活Na+,Mg2+,Ca2+,K+,Fe2+和Cu2+,然而,它是由Fe3+,Ba2+,Zn2+,Mn2+和银离子抑制。公里和纯化的酶的Vmax值4.7mgml-10.57pmolL-1min-1(mg蛋白)1,分别。只有大小不同的低聚糖,羧甲基纤维素(CMC)释放与纯化的酶水解后。该基因编码的酶是A.霉98个克隆,其中包含一个开放阅读框(eu978473)意义。推导的蛋白质含有酶超家族的保守结构域(糖基水解酶家族5)。的N-末端氨基酸序列的纯化的酶是m-a-p-h-a-e-p-q-s-q-t-t-e-q-t-s-s-g-q-f,这与从克隆的基因推导一致。这表明,纯化的酶是由克隆纤维素酶基因在酵母编码。

  • 标签: 羧甲基纤维素酶 出芽短梗霉 基因克隆 海洋酵母 纯化 SDS-PAGE分析