简介:摘要目的通过基因共表达网络筛选与结直肠腺癌(COAD)发展相关的关键基因,并初步验证其潜在功能。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载COAD患者基因表达谱和临床信息,包括379例COAD患者及39例对照,Kaplan-Meier分析得到COAD预后相关基因后进行权重基因共表达模块(WGCNA)分析;最终获得关键基因后结合分子实验初步验证其功能及潜在机制;多组均数比较采用Kruskal-Wallis检验、两组均数比较采用Mann-whitney U检验,相关性分析使用Pearson检验。结果共筛出3 170个预后相关基因;WGCNA构建出9个基因模块,其中Brown模块不仅与COAD呈负相关,且与临床分期、TNM分期呈负相关;Brown模块的中心基因C4orf19在COAD肿瘤组织中表达低于对照组[4.37 (4.10~4.49)比2.70 (2.18~3.18),U=684,P<0.01],并且与临床分期(H=9.442,)、T分期(H=9.336)、M分期(U=5 842)和N分期(U=14 572)相关(P均<0.05);免疫组织化学示C4orf19在癌组织组表达低于癌旁组,阳性例数分别为11(27.5%)和35(87.5%),差异有统计学意义(χ2=29.460,P<0.01);沉默C4orf19后,结肠癌细胞增殖(4.494±0.438比3.415±0.453,t=-4.527)、迁移(15.007±0.439比7.583±0.701,t=12.69)及侵袭能力(154.000±4.546比96.667±4.643,t=12.48)高于对照组(P<0.01)。结论WGCNA是一种有效的系统生物学方法,通过此方法识别出新的抑癌基因C4orf19。
简介:摘要目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶链反应法检测C19ORF5蛋白和mRNA的表达情况,探讨C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的相关性。141例患者均行术后化疗,91例采用常规化疗方案(卡培他滨联合奥沙利铂,常规化疗组),50例采用常规方案联合紫杉醇化疗(紫杉醇组),两组均治疗6个疗程。结果癌组织在透射电镜下可见自噬体,C19ORF5蛋白为淡黄色至棕褐色颗粒,表达于细胞质;癌组织C19ORF5蛋白染色强度明显强于正常组织,且Ⅱ期染色强度明显高于Ⅳ期。Ⅰ~Ⅱ期患者C19ORF5蛋白高表达率明显高于Ⅲ~Ⅳ期患者[83.3%(25/30)比17.1%(19/111)],差异有统计学意义(P<0.01)。癌组织C19ORF5 mRNA表达水平明显高于正常组织(1.17 ± 0.45比0.82 ± 0.29),差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织C19ORF5蛋白表达水平与肿瘤分期、癌胚抗原和肝转移有关(P<0.01或<0.05),癌组织C19ORF5蛋白表达水平与淋巴结转移无关(P>0.05)。常规化疗组91例患者中,有效70例(76.9%),无效21例(23.1%);紫杉醇组50例患者中,有效42例(84.0%),无效8例(16.0%),两组有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。在常规化疗组中,有效患者和无效患者化疗前癌组织与化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);有效患者与无效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。在紫杉醇组中,有效患者化疗前癌组织C19ORF5蛋白表达水平明显高于化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平(0.9 ± 0.3比0.5 ± 0.2),有效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平明显低于无效患者(0.5 ± 0.2比0.8 ± 0.2),差异有统计学意义(P<0.05)。结论C19ORF5蛋白的高表达可以提高结直肠癌组织的自噬活性;C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关;C19ORF5蛋白可能通过增强自噬活性提高紫杉醇化疗的敏感性。