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  • 简介:腐霉根腐病严重影响着大豆种子发芽植株生长,谷胱甘肽转移酶是植物与生物胁迫非生物胁迫相互作用主要酶,在失活有毒化合物,保护植物细胞免受氧化损伤等方面扮演着十分重要角色。本研究从腐霉菌侵染抗病大豆灰不支黑豆中分离出GmGST26基因,采用生物信息学方法对大豆GmGST26序列特征、结构、大豆GmGST家族基因进化关系及表达数据进行分析;利用荧光定量PCR技术DGE表达谱数据分别对GmGST26基因在不同抗病品种中表达特点及在抗病大豆互作过程中表达模式进行分析。研究结果表明,腐霉菌侵染大豆后GmGST26基因上调表达,GmGST26编码225个氨基酸,等电点为6.92,具有明显GSTs蛋白典型结构域,属于GSTs家族中Tau亚家族,与GmGST7相似性为98.22%,属旁系同源基因。组织特异性表达分析,主要在根部表达,其次为花,该基因在腐霉菌、疫霉菌与大豆互作过程中表达模式为应激反应上调基因,且防卫反应负调控。

  • 标签: 大豆 谷胱甘肽转移酶 分子特征 表达模式
  • 简介:甘蔗是重要糖料作物,也是重要能源作物。由于复杂遗传背景、较低可育性缺乏优异种质资源等因素给甘蔗品种改良带来了很大困难,通过转基因技术为甘蔗品种改良提供了有效途径。而转基因植物遗传稳定性是植物转基因育种过程中一项重要研究课题。本研究通过一次多基因遗传转化,同时将四个目的基因导入甘蔗品种新台糖22号中。通过PCR检测,对转基因甘蔗T_0、T_1T_2代遗传稳定性进行分析;通过外源蛋白快速试纸条检测,对转基因植株四个外源基因中基因(bar抗除草剂基因cry1Ab抗虫基因)蛋白表达进行检测。证明一次四基因遗传转化甘蔗转基因株系,在T_0代出现了部分基因丢失现象,且T_0代甘蔗主茎分蘖可能为不同转基因事件。但如果是四个基因均能完整整合到基因组中株系,则四个基因可以在T_0、T_1T_2代中得到稳定遗传,也可以稳定检测得到外源基因蛋白表达。

  • 标签: 甘蔗转基因 遗传稳定性 基因遗失 试纸条检测
  • 简介:稻米蛋白质含量是水稻(OryzasativaL.)营养品质育种重要内容之一。本研究以珍汕97与南洋占杂交构建重组自交系(RIL)群体为材料,结合其建立了由190个SSR标记组成遗传图谱,利用QTLmap-per1.6对糙米精米中蛋白质含量遗传基础进行了分析,共定位到4个控制糙米含量QTLs2个控制精米含量QTLs。其中,控制精米蛋白质含量2个QTLs与控制糙米蛋白质含量2个QTLs位置一致,这2个QTL(qpc1qpc2)在糙米精米蛋白质含量中均解释了较大表型变异,而且糙米精米蛋白质含量相关系数为0.814,这表明糙米精米蛋白质含量具有相似的遗传基础。研究还发现上位性在糙米精米蛋白质含量遗传中也起很重要作用。其中,在糙米蛋白质含量中,上位性QTLs可以解释42.2%表型变异;在精米蛋白质含量中,上位性QTLs共解释了27.8%表型变异。本研究初步揭示了稻米蛋白质含量遗传基础,为分子标记辅助选择改良稻米品质及蛋白质含量基因克隆提供了有益信息。

  • 标签: 水稻 蛋白质含量 分子标记辅助选择 数量性状位点(quantitative TRAIT locus)
  • 简介:大麦糖化力蛋白质含量是影响大麦品质重要指标,对此类性状进行QTL定位具有重要经济意义。本研究分别采用传统单QTL扫描方法3种贝叶斯LASSO方法实现此类性状QTL精细解析。在对大麦蛋白质含量QTL检测上,单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法检测到了7个QTL,其中2个与单QTL扫描方法检测QTL吻合。在大麦糖化力QTL检测上,传统单QTL扫描方法共检测到了3个QTL,而3种贝叶斯方法除了检测到这3个QTL外,还检测发现了额外2个连锁QTL;表明贝叶斯方法在北美大麦蛋白质含量糖化力QTL检测中可以更加有效地分离处于连锁位置或接近状态QTL进而提高QTL检测效力。

  • 标签: 贝叶斯LASSO QTL 多QTL定位
  • 简介:应用AFLP、SRAP、RAPD、SSR及同工酶等5种标记构建326个标记位点白菜遗传图谱81个DH株系群体,采用MapQTL5软件与MQM作图法对白菜叶片数与单株重进行QTL定位及遗传效应分析。结果表明,通过两个不同年份试验,在10个连锁群上共检测到20个QTL,主要分布在R5、R9连锁群上:控制叶片数有5个,控制单株重有15个;其中,获得两年稳定表达QTL共6个:控制叶片数有1个,控制单株重有5个;另外,估算了单个QTL遗传贡献率和加性效应,发现各QTL加性效应各不相等,各位点遗传贡献率介于9.4%~39.6%之间;控制叶片数控制单株重QTL位点表现为紧密连锁或相似的位置,主要集中在R5连锁群上,这与二者性状表型值相关系数很高相一致。这将为白菜品种改良中产量等性状分子标记辅助选择提供理论依据。

  • 标签: 大白菜 DH群体 白菜叶片数 单株重 QTL
  • 简介:解析穗粒数、小穗数粒重及其QTLs间遗传关联,有利于大麦穗发育遗传标记辅助选择研究。本研究采用SPSS19.0软件分析了25份试验材料小穗数、千粒重穗粒数表型差异,以及不同性状及其QTLs间遗传关联性。结果表明小穗数等3个性状具有显著或极显著差异,育种品种小穗数穗粒数与地方品种没有明显差异,大多数育成品种千粒重显著或极显著高于地方品种,二棱大麦小穗数、穗粒数千粒重没有显著差异,但六棱大麦具有显著或极显著差异;小穗数与穗粒数极显著正相关,偏相关系数为0.835;在试验材料中共检测到4个小穗数QTLs、6个穗粒数QTL6个千粒重遗QTLs,16个QTLs分别位于1H、2H4H等6条染色体上,其中QSn-4HS等8个QTLs具有增效作用、其余QTLs具有减效作用。与标记HVM40-258bp连锁QTL对小穗数穗粒数具有一因多效特性性。小穗数等3个穗部性状分别受遗传效应不同QTLs控制,QTL多效性导致了小穗数与穗粒数关联遗传。

  • 标签: 大麦品种(或品系) 穗部性状差异 SSR标记 关联分析 QTLs检测
  • 简介:植物14-3-3蛋白(GF14蛋白)是一类参与调节植物生命活动过程小分子蛋白。本研究根据高羊茅转录组学测序获得FaGF14-AFaGF14-D基因片段,利用RACE技术得到高羊茅FaGF14-AFaGF14-D基因3’5’cDNA序列,拼接后FaGF14-A基因全长为1153bp,编码260个氨基酸;FaGF14-D基因全长为1291bp,编码266个氨基酸。生物信息学分析结果表明高羊茅FaGF14-AFaGF14-D蛋白都具有典型14-3-3蛋白结构域,包含9个保守琢-螺旋及不保守N-末端C-末端,尤其与禾本科植物GF14蛋白具有较高相似性,位于同一个进化支上,亲缘关系较近。

  • 标签: 高羊茅 FaGF14-A FaGF14-D 克隆 分析
  • 简介:查尔酮合成酶(chalconesynthas,CHS)是黄酮类次生代谢物生物合成途径中一个关键酶。为了解CHS与花青素含量相关性,本研究根据转录组数据,利用RT—PCR技术在甘薯中克隆了一个CHS基因(IbCHS1),并对其表达特征进行了分析。结果表明:IbCHS1基因cDNA长1556bp,包含1个1167bp开放阅读框,编码388个氨基酸。IbCHS1蛋白具有典型植物CHS结构特征,其他植物中类似蛋白具有很高同源性。表达分析显示,IbCHS1主要在紫肉甘薯中表达,其表达水平与不同品种甘薯中花青素含量正相关。

  • 标签: 甘薯 查尔酮合成酶 花青素 基因表达
  • 简介:乙烯作为植物激素在生长、发育、抗逆过程中发挥了其独特调节作用。本文在分子生物学水平上概述了植物中乙烯合成途径信号转导途径机制。乙烯合成由甲硫氨酸开始,经过重要中间代谢产物ACC氧化裂解形成乙烯,其中ACC合成酶催化反应为限速反应,为调控乙烯合成重要环节。乙烯信号转导由内质网上乙烯受体识别乙烯开始,在胞质中经一条保守途径,由EIN3将转录信号传递至细胞核中,最后以ERF类转录因子激活或抑制相关基因表达。ERF转录因子参与防卫反应诱导寄主对病原菌不亲和互作建立,受其调控防卫基因被诱导表达后在随后防卫应答过程中发挥了不同作用。

  • 标签: 乙烯合成 信号转导 诱导抗性
  • 简介:葡萄浆果颜色是由花色素苷量来决定,UFGT控制花色素苷合成,Myb相关基因通过时空表达调节UFGT,从而使花色素苷在葡萄发育不同阶段不同部位表达。不同葡萄品种调节花色素苷合成强度模式差异造成了有色葡萄品种果皮有多种颜色,白色葡萄品种果皮是由于没有花色素苷合成。Myb相关基因家族主要有八个成员,其中MybA三个种类VlmybA1-1,VlmybA1-2VlmybA2以及MybB两个种类VlmybB1-1VlmybB1-2得到了较深入研究。

  • 标签: 葡萄 花色素苷 MYB UFGT 色素形成
  • 简介:针对多浆旱生植物霸王富含多酚多糖类物质特点,在常规异硫氰酸胍方法基础上进行改进,摸索出一种霸王叶根总RNA提取方法。本方法主要通过在提取缓冲液中加入4%β-巯基乙醇以去除多酚物质干扰;用2mol/L醋酸钠(pH4.0)、水饱和酚氯仿:异戊醇(24:1)抽提以去除多糖蛋白物质。采用该方法提取霸王总RNA纯度高、完整性好,电泳条带清晰,OD260/OD280值在1.8~2.0之间,其质量完全可以满足进一步分子生物学研究要求。

  • 标签: 霸王 多酚 多糖 改进的异硫氰酸胍法 RNA提取
  • 简介:为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合6个农艺性状杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行cDNA-SRAP差异表达分析,并对差异表达片段进行克隆测序分析。结果表明:超高亲优势表现为株高〉叶数〉叶厚〉叶长〉叶宽〉叶面积;中亲优势表现为株高〉叶数〉叶面积〉叶长〉叶宽〉叶厚。叶面积叶长、叶宽,叶长与叶宽呈极显著相关。主成分分析将6个农艺性状简化为3个主成分,即叶产量因子、长势因子、叶数因子,提供信息占全部信息量95.99%。6对SRAP引物在Florda301×GDH94及其亲本中共扩增出66条带,其中差异条带32条,占48.48%;差异表达类型分为UNF1、ABF1、UNP1、UNP2、DMP、DMP2六种,分别占:19.20%、8.04%、4.60%、5.75%、2.30%、6.90%。从杂种特异表达片段中分离两条片段分别与GDP-甘露糖4,6-脱水酶蔗糖6-果糖基转移酶同源。本研究结果为烟草农艺性状杂种优势研究提供基础理论参考。

  • 标签: cDNA-SRAP 农艺性状 杂种优势
  • 简介:根据刺五加鲨烯合酶基因2(squalenesynthase,SS2)鲨烯环氧酶基因1(squaleneepoxidase,SE1)DNA序列,通过Southern杂交qRT-PCR法确定SS2SE1拷贝数。以actin为内参照基因,利用qRT-PCR法分光光度法确定不同SS2SE1拷贝数下基因表达量皂苷含量。结果表明,刺五加SS2存在12拷贝,SE1存在1、23拷贝类型及其相互组合6种拷贝数组合基因型。刺五加SS2SE1表达量与皂苷含量均随拷贝数增加而显著提高(p〈0.05),两者间存在极显著正相关关系(P〈0.01)。SS2SE1每增加1个拷贝可使皂苷含量分别提高0.570.42倍。研究结果为进一步揭示刺五加皂苷含量差异形成分子机理奠定了基础。

  • 标签: 刺五加 鲨烯合酶 鲨烯环氧酶 拷贝数 皂苷
  • 简介:SSRSNP被推荐为玉米品种DNA指纹鉴定优选标记技术。本研究选用大面积推广11套玉米杂交种及其亲本作为试验材料,基于SNP芯片分型平台SSR荧光毛细管电泳平台分析比较两种标记在玉米品种真实性鉴定中应用。基于上述两种检测平台获得3072个SNP位点40对SSR引物基因型数据,分析比较各个参数。结果显示:(1)两种标记数据获得率均较高,3072个SNP位点平均数据获得率为98.4%,40对SSR引物平均数据获得率为99.47%。(2)两种标记均具备较高品种区分能力,3072个SNP位点平均MAF(minorallelefrequency)值为0.357,MAF值大于0.30占71%,平均DP(discriminationpower)值为0.515,DP大于0.5占56%;40对SSR引物平均PIC(polymorphisminformationcontent)值为0.605,PIC大于0.51有32对,平均DP值为0.745,DP值大于0.71有29对。(3)两种标记位点鉴定样品杂合率、亲子关系方面结果是一致,样品杂合率均介于0.4~0.6之间,平均杂合率分别为0.5250.514;SNP数据显示符合亲子关系位点百分比介于95.2%~99.9%之间,SSR数据显示符合亲子关系位点介于36~40个之间。综上所述,SSRSNP两种标记在数据完整性、区分品种能力、位点稳定性等方面差别较小。

  • 标签: 玉米 SSR SNP 真实性鉴定
  • 简介:为了探讨脲类细胞分裂素PBU嘌呤类细胞分裂素6-BA对尾叶桉愈伤分化、愈伤组织POD基因表达及酶活性影响,将尾叶桉幼苗下胚轴切段接种在添加PBU+IAA、6-BA+IAAPBU+6-BA+IAA三种激素组合SPCa培养基中,通过统计愈伤组织分化情况、检测POD基因表达差异酶活性变化来开展研究。6-BA+IAA组合条件下,愈伤组织褐化率高达84.71%;PBU+IAA组合下,愈伤组织褐化率为30.56%;PBU+6-BA+IAA组合时,褐化率最低,为24.09%,胚性愈伤组织时比例最高,达47.73%。与6-BA相比,PBU诱导出愈伤POD酶活性显著升高。通过实时定量PCR(real-timequantitativePCR,qPCR)检测6个POD基因表达变化,设6-BA+IAA诱导所得愈伤相对表达量为1,PBU+IAA诱导所得愈伤中BP1,BP4,BP5表达上调,分别为1.88、1.63、2.01;PBU+6-BA+IAA诱导所得愈伤中BP3、BP4、BP6表达上调,分别为1.88、1.96、1.93。从实验结果分析,PBU6-BA有协同效应,通过增强POD酶活性,减轻褐化、促进胚性愈伤分化。PBU6-BA对不同POD同工酶表达影响不同。本研究可为深入研究PBU6-BA协同作用分子机理提供参考。

  • 标签: 尾叶桉 PBU 6-BA POD 基因表达差异
  • 简介:通过增加外源CaCl2钙离子螯合剂EGTA处理后,研究香蕉幼苗在60mmol/LNaCl人工模拟盐胁迫0、4h、8h、12h、24h48h不同时间下,测定其叶片CaMCa^2+-ATPase基因相对表达量。结果表明,在NaCl胁迫过程中,香蕉幼苗在正常生长条件下,其根叶片CaM基因Ca^2+-ATPase基因均有表达。巴西蕉幼苗根在盐胁迫过程中CaM基因没有发生显著变化,但是粉蕉根却发生了显著变化,这可能与粉蕉耐盐性高于巴西有关。随着盐胁迫时间延长,巴西蕉粉蕉幼苗根Ca^2+-ATPase基因相对表达量均呈现先上升后下降趋势。

  • 标签: 香蕉幼苗 盐胁迫 CaM基因 Ca2+-ATPase基因 荧光定量
  • 简介:启动子是调控外源基因在植物体内表达“开关”。随着植物转基因技术广泛应用,无论是基础研究还是应用研究,人们希望能够充分利用启动子来准确控制外源基因在植物体内表达,使目的基因“开”“关”、表达“多”“少”、在“何地”“何时”表达等。能够听从人指挥,以实现植物育种分子设计。因此,快速分离鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究热点难点。本文在互补末端连接反向PCR(CELI—PCR)技术基础上建立起…种快速分离目的基因全长cDNA启动子序列新方法。该方法利用CELI—PCR进行染色体连续步移,获取足够长目的基因及其上游基因组DNA序列,再根据转录起始位点是目的基因转录本启动子分界点,其下游转录本中外显于可通过RT-PCR扩增,而上游启动子序列则不能被RT-PCR扩增这一特点,借助RT-PCR进行cDNA连续步移,直到获得全长cDNA,确定启动子基因5’非翻译区位置,进而精确定位转录起始位点。从而获取目的基因准确启动子序列全长cDNA序列。因此,建立在CELI,PCR基础上RITIS技术,可绕过繁琐构建cDNA库5'-RACE等方法快速分离目的基因全长cDNA启动子序列。

  • 标签: 启动子 全长CDNA 转录起始位点
  • 简介:为了利用关联分析发掘与重要农艺性状相关数量性状基因位点,本研究采用全基因组扫描方法,利用分布在基因组上60对SSR引物,对140份东北三省水稻种质资源进行群体结构连锁不平衡分析。结果表明:本研究中东北粳稻可分为2个类群,线性非线性组合中,都有一定连锁不平衡存在。群体中,19.2%标记位点可以观察到显著LD(P〈0.05),其中第一类群第二类群基于D’统计概率(P〈0.05)支持LD成对位点比例分别为2.1%16.6%。第2类群连锁不平衡衰减(D’〈0.5)所延伸遗传距离变幅为0.32—120.4cM,回归方程为:y=-0.0276ln(x)+0.3994。

  • 标签: 粳稻 种质资源 群体结构 连锁不平衡
  • 简介:为筛选出与黄瓜抗枯萎病相关基因连锁SSR分子标记,以对黄瓜抗枯萎病为单显性基因母本WIS2757感枯萎病父本津研2号及其F1、F2分离群体为试材,通过构建抗、感池对黄瓜枯萎病抗性进行SSR分析。结果表明:通过对278对SSR引物进行筛选,获得在双亲间存在多态性引物102对,进一步通过抗、感池筛选,获得抗感池DNA间有差异引物10对。经F2感病群体验证,共获得9个与黄瓜枯萎病抗性基因(Foc-4)连锁SSR分子标记,并初步将Foc-4基因定位在2号染色体两标记SSR17631SSR00684之间,距基因Foc-4遗传距离分别为1.0cM0.9cM,为进一步开发抗枯萎病分子标记及克隆黄瓜抗枯萎病基因奠定了基础。

  • 标签: 黄瓜 枯萎病 抗病基因 SSR系列标记