基于Oncomine数据库分析P16基因在卵巢癌组织中表达及临床意义

基于 Oncomine数据库分析 P16基因在卵巢癌组织中表达及临床意义

赵思宇

（成都市第五人民医院，成都 611130） 【摘要】目的 探讨 P16基因在卵巢癌组织中的表达及临床意义。方法 收集 Oncomine数据库中关于 P16的信息，利用 Kaplan-Meier Plotter数据库分析 P16与卵巢癌患者预后的关系。结果 Oncomine数据库中共收集了 6项研究，包括 2211个样本，涉及 P16在卵巢癌组织和正常组织中表达的比较。与正常组织比较， P16在卵巢癌组织中高表达（ p<0.05）。 P16低表达的卵巢癌患者总生存期（ OS）（ HR=1.2,95%CI:1.05～ 1.38,p=0.0063）、无进展生存期（ PFS）（ HR=1.25,95%CI:1.09～ 1.42p=0.00093）优于高表达组，但进展后生存期（ PPS）（ HR=0.82,95%CI:0.69～ 0.99,p=0.035）较高表达组差。结论 P16基因在卵巢癌组织中高表达，与卵巢癌的发生、转移及耐药有关； P16基因低表达的卵巢癌患者预后较高表达更好，可能与卵巢癌化疗耐药有关； P16可作为卵巢癌治疗新靶点及预后指标。 【关键词】卵巢癌； P16； Oncomine数据库 卵巢癌（ ovarian cancer， OC）发病隐匿，早期不易被发现，在妇科恶性肿瘤中死亡率最高。肿瘤细胞减灭术以及术后辅以铂类药物为基础的化疗是卵巢癌的标准治疗。近年来，尽管彻底肿瘤细胞减灭术、术后系统化疗和新辅助化疗后间歇性肿瘤细胞减灭术（ NACT+IDS） +化疗的治疗模式使晚期卵巢癌患者近期的疗效提高，但化疗后即使已达到完全缓解（ complete remission， CR）， 5年生存率仍仅 30%～ 40%， 2年内复发率仍高达 70%。如何减少、推迟卵巢癌治疗后复发，提高患者 5年生存率，仍是临床亟待解决的难题 [1]。化疗耐药是卵巢癌系统化疗后维持治疗失败和不良预后的主要原因，高达 80%的患者因铂类耐药而最终复发 [1]。以往研究发现卵巢癌的发生、转移及化疗耐药与 P16关系密切 [2]。 P16基因的突变、丢失，可使细胞失去控制，而导致细胞无限增殖。 P16基因在调节细胞周期、抑制肿瘤及促进细胞的凋亡等过程中发挥了重要的作用 [3, 4]。当前医学大数据研究已在疾病研究、临床决策及医疗服务等方面展现出独有的优势，对基因数据库等平台进行数据挖掘可能进一步揭示 P16在肿瘤中的作用。 Oncomine数据库为全球最大的癌症基因芯片及整合数据挖掘平台，目前已收录了超过 700个基因表达数据集及近 10万个癌症组织和正常组织样本，该数据库平台因质量高被广大科研人员认可。 Kaplan-Meier Plotter数据库是广泛被接受预后分析在线数据库，其涵盖了 2190例卵巢癌样本，可进行预后分析的基因高达 54675个基因，该数据库得出的结果具有客观性。本研究旨在通过在线癌症基因芯片及整合数据挖掘平台数据库对 P16基因在卵巢癌中的表达及预后的情况进行分析，为进一步研究卵巢的发生及耐药机制提供线索。 1 资料与方法 Oncomine数据库提取数据 在 Oncomine数据库（ https://www.oncomine.org/resource/main.html）中按照研究要求进行筛选及数据挖掘，条件：（ 1）“ Cancer Type: Ovarian cancer”;（ 2）“ Data Type： All”；（ 3）“ Gene： P16”；（ 4）“ Analysis Type:Cancer vs Normal Analysis”；临界条件：（ P value<0.05,fold change>2,gene rank=All）。 利用 Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析 通过 Kaplan-Meier Plotter数据库（ http://kmplot.com/analysis/）中的 Ovarian cancer（ mRNA）数据集进行生存分析。条件：（ 1）“ ovarian cancer”；（ 2）“ Gene symbol： P16”；（ 3）“ Split patients by： Auto select best cutoff”；（ 4）“ Survival： OS/PFS/PPS”（ 5）“ Follow up threshold:All”。预后评价指标包括：总生存期（ overall survival,OS）、无进展生存期（ progress free survival ,PFS）和进展后生存期（ post-progressive survival, PPS）。 统计学分析 利用 Kaplan-Meier Plotter数据库采用 Kaplan-Meier法分析 P16基因表达与卵巢癌预后的关系。双侧 p<0.05差异有统计学意义。 结果 常见肿瘤中 P16在的表达 在 Oncomine数据库中共收集了 445项关于 P16在不同肿瘤中与正常组织中表达的比较研究。其中， 118项研究差异有统计学意义（ p<0.05）， 108项研究中 P16基因高表达， 10项研究中 P16基因低表达。见图 1。

参考文献

1. 刘恒炜, 吕立群. 基于Oncomine数据库荟萃分析CD24在卵巢癌中的表达和临床意义[J]. 国际妇产科学杂志, 2019, 46(5):5.

2. 李开国, 王茹月, 杨晓慧,等. 基于Oncomine数据库分析Pygopus2基因在乳腺癌组织中的表达及其临床意义[J]. 中国癌症防治杂志, 2018, 10(6):5.

3. 张涛红, 熊莉莉, 王小伟,等. 基于Oncomine数据库分析ENO1在卵巢癌中的表达及其预后价值[J]. 海南医学院学报, 2019, 25(18):5.

4. 王晓丽, 王丽丽. 基于Oncomine和GEO数据库荟萃分析HMGA1在卵巢癌中的表达及其与预后的相关性[J]. 现代肿瘤医学, 2020, 28(9):6.