南宁市疾病预防控制中心 广西壮族自治区南宁市 530000
2020年初,新型冠状病毒开始肆虐全球,国家通过核酸检测进行新型冠状病毒的筛查,全民抗疫,取得了新型冠状病毒防控工作的胜利。在抗疫中,我们所有人都做过核酸检测,大家采集后的咽拭子,都经历了什么样的旅程呢?在微生物领域,核酸检测仅仅能做新型冠状病毒吗?今天,我来揭开核酸检测的神秘面纱。
首先介绍核酸检测基于的理论基础。不同的生命体,具有不同的遗传物质,或者是DNA,或者是RNA,或者是两者都有。不管是哪种遗传物质,它们都是由碱基组成的,不同的病原体碱基的排列顺序在某些部位具有特异性。这就犹如我们人类的指纹,每个人的指纹都是独一无二的。侦探利用指纹的这个特性,确定犯罪分子。我们利用遗传物质中特异性的片段,可以确定病原体。
做核酸检测的第一步大家都经历过,就是标本的采集。新冠疫情期间,医生用拭子在我们咽喉部擦拭,就是在采集咽拭子。其他常见的标本类型还有血液、鼻咽拭子、肛拭子、痰液、尿液、粪便、疱疹液、脓液、胸腔积液、腹水等等。根据检测目的的不同,采集不同的标本。比如怀疑呼吸道病原体感染,可以采集咽拭子、鼻咽拭子、痰液等;怀疑肠道病原体感染,可以采集肛拭子、粪便;怀疑登革热病毒感染,可以采集血液、尿液。所以,核酸检测可以测的病原体是非常多的。
标本采集完成后,会有专业人员运送到核酸检测实验室。标本在实验室旅途的第一站是“标本处理室”,不同的标本,实验室给予的“礼遇”是不一样的。拭子标本通常需要在震荡仪上充分振荡,就像小朋友在游乐场玩蹦床。在振荡的过程中,拭子上面黏附的细胞啊,病原体啊,就会脱落下来,为后面的实验做准备。血液标本不能振荡,不然血细胞会破裂影响检测。血液标本需要放入离心机中离心,就像儿童乐园中的旋转木马,但是是高速旋转的,目的是分离出血细胞和血浆。痰液标本需要消化,粪便标本需要重悬、离心。同时,每个标本的信息都要录入系统,给予一个号码,就像我们每个人的身份证一样,确保结果不张冠李戴。
第二站,标本游览到“核酸提取区”。顾名思义,就是把核酸提取出来。在过去,核酸提取都是手工操作,低效、复杂、容易出现问题环节,导致假阴性或假阳性。现在,自动化核酸提取已经非常普遍,具有高效、快速、污染少、纯度高的特点。目前实验室常用的是磁珠法。磁珠法的优点有:操作简单、用时短,整个提取流程只有四步,裂解、结合、洗涤、洗脱,在不同的试剂孔中进行,大多可以在30分钟左右完成。
磁珠法是怎么把核酸提取出来的呢?既然核酸是藏在细胞或病原体的里面,那么第一步就是要把细胞或病原体打开,这不像我们开门用钥匙,而是利用化学试剂,把细胞或微生物的包膜或其他保护核酸的成分裂解,这样,核酸就溜到外面了。与此同时,蛋白质、脂质等物质也会游离出来。为了把核酸与其他不需要的物质分开,接着加入磁珠,因为磁珠能吸附游离出来的核酸,而不吸附其他物质。这时候,就可以用洗涤液清洗掉不需要的物质,而核酸还是会牢牢地吸附在磁珠上。最后,把吸附在磁珠上的核酸洗脱下来,就得到了我们想要的核酸。
核酸提取出来了,但是光有核酸是不能进行检测的,还需要核酸检测试剂。试剂的配置在“试剂配置间”进行,为了防止试剂被污染,标本是不能到“试剂配置间”观光的。目前检测核酸的试剂是商品化的。使用非常方便。比如要测新型冠状病毒,就选用新型冠状病毒核酸检测试剂盒,试剂盒中的成员一般有:聚合酶链反应液,里面含有扩增核酸所需的原材料(各种碱基),缓冲液,以及一些金属离子;酶混合液,就相当于建筑工,将不同的碱基按配对的原则进行组合延伸;引物、探针,相当于侦探,侦查到病原体的特异性片段,确保检测的特异性和灵敏度。严格按照试剂盒说明书配制所需的用量,然后分装到核酸检测所用的管子中,俗称“八连管”。然后将“八连管”拿到“核酸提取区”。
在“核酸提取区”,要做的是“加样”。“加样”就是把提取好的核酸加入到配置好的试剂中,专业的称呼叫“加模板”。这个时候要非常的谨慎小心,一来确保加样准确,二来防止阴差阳错。然后给八连管盖上盖子。这个时候,整个反应体系就完成了。猜猜它的总体积有多大呢?非常小哦,一般是25微升到50微升,相当于半滴水或者1滴水的体积,真的是微量反应。
核酸检测需要用到的仪器是核酸扩增仪,现在常用的核酸扩增仪是“荧光PCR仪”,按照使用试剂的说明书设置好反应程序。经过变性,把DNA双链打开;退火,引物结合到DNA的单链上;延伸,特异性片段的合成。一般一个半小时左右,实验就结束了。仪器会自动分析和保存结果,专业人员根据扩增曲线和相关的参数,对结果进行判定,发放检测报告,实验结束。
相信看到这里,你一定对核酸检测是怎么做的有了一定的了解。核酸检测还在朝着更简单更快捷的方向发展,以后我们在家都能自己检测,越来越经济方便,实现高效的自我健康管理。