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  • 简介:摘要目的研究磁珠法、离心柱法及一步法对新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸提取效率的差异。方法2021年3月5日,在南京大学医学院附属泰康仙林鼓楼医院核酸采样室采集本科室员工咽拭子标本10份,将阳性质控品混入其中,作为模拟阳性标本。用磁珠法、离心柱法及一步法分别提取模拟阳性样本及其稀释样本RNA、人源性标本及其稀释样本RNA,用微量紫外分光光度计测量核酸的纯度(A260/A280比值)及浓度,并进行荧光定量PCR扩增实验,比较其循环阈值(CT)和提取效率。用3种方法提取模拟弱阳性标本,比较其扩增后的CT值差异。服从正态分布的计量资料以x¯±s表示,组间比较采用t检验,多组间比较采用单因素方差分析。结果磁珠法、离心柱法、一步法提取的2019-nCoV核酸均能扩增出阳性结果。磁珠法与一步法提取的RNA扩增CT值差异无统计学意义(t=‒0.995,P=0.376)。离心柱法提取的RNA较另外2种方法提取的RNA扩增后CT值小,离心柱法、磁珠法、一步法提取的模拟阳性样本扩增后ORF1ab基因的CT值分别为29.28±0.06、30.82±0.14、29.79±0.01,差异有统计学意义(F=11.196,P=0.041);E基因的CT值分别为28.52±0.40、27.33±0.78、27.38±0.13,差异有统计学意义(F=3.407,P=0.169);N基因的CT值分别为28.61±1.02、27.24±0.20、27.25±0.47,差异有统计学意义(F=2.880,P=0.020);离心柱法、磁珠法、一步法提取的人源性标本扩增后人源基因CT值分别为19.68±0.36、20.14±0.06和20.58±0.49,差异有统计学意义(F=4.904,P=0.048)。人源性标本稀释2倍即对扩增人源基因CT值有影响,未稀释标本较稀释2倍标本CT值较小,相差2.95±0.22,差异有统计学意义(t=‒3.025,P=0.039)。一步法、磁珠法、离心柱法提取时间分别为(15.00±1.50)、(20.00±1.50)和(40.00±5.5)min,差异有统计学意义(F=688,P=0.027)。结论磁珠法、离心柱法及一步法均可用于2019-nCoV核酸提取,离心柱法提取效率较磁珠法及一步法高。

  • 标签: 新型冠状病毒 核酸类 临床实验室技术
  • 简介:摘要目的通过研究壳多糖酶3样蛋白1(CHI3L1)在原发性肝细胞癌(HCC)外周血、肝癌及配对癌旁组织中的表达水平,探讨CHI3L1在辅助原发性HCC临床管理中的价值。方法回顾性研究。纳入2013至2017年在海军军医大学第三附属医院就诊的HCC患者405例,同时纳入肝硬化患者112例、正常体检(NC)者114例分别作为疾病和健康对照,酶联免疫法(ELISA)检测外周血CHI3L1蛋白水平。收集经病理确诊为原发性肝癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织90对,制成组织芯片,应用免疫组化染色分析HCC患者组织中CHI3L1的表达情况。采用Mann-Whitney U检验或Kruskal Wallis H检验比较各组差异,相关性分析采用Pearson双变量相关分析,癌组织和癌旁组织比较采用配对秩和检验。结果外周血中肝硬化组、HCC组、NC组CHI3L1蛋白中位数(四分位数)分别为195.8(103.3,330.4)、118.2(74.9,201.0)及46.8(30.7,66.4)μg/L,肝硬化组CHI3L1蛋白水平显著高于HCC组和正常对照组(Z=5.186、12.928,P均<0.001),HCC组CHI3L1蛋白水平显著高于正常对照组(Z=10.788,P<0.001),HCC组中CHI3L1水平与是否合并肝硬化无关(Z=-0.286,P=0.775);血清CHI3L1水平与肝纤维化相关标志物[透明质酸(HA)、Ⅲ型前胶原N端肽(PⅢNP)、Ⅳ型胶原蛋白(Ⅳ-C)、FIB-4指数]呈正相关(r=0.202、0.159、0.299、0.221,P均<0.05),与白蛋白(ALB)呈负相关(r=-0.326,P<0.05),与丙氨酸氨基转移酶(AST)、凝血酶原时间(PT)呈正相关(r=0.138、0.160,P均<0.05),与肿瘤直径呈正相关(r=0.284,P<0.05),与中国肝癌的分期方案分期(CNLC)分期相关[晚期组CHI3L1水平为125.2(81.9,228.5)μg/L,高于早期组的112.0(70.2,169.2)μg/L(Z=-2.326,P=0.018)],而与微血管侵犯(Z=-1.531)、肿瘤包膜(χ2=0.818)无明显相关关系(P均>0.05)。73对HCC组织标本中,癌组织CHI3L1表达阳性率为78%(57/73),癌旁组织CHI3L1表达阳性率为83%(61/73),配对分析比较癌组织中染色强度评分1.5(1.5,2.0)和癌旁组织染色强度评分1.5(1.5,2.5)发现癌旁组织染色强度高于癌组织(Z=-2.053,P=0.040)。结论原发性肝细胞癌CHI3L1蛋白的组织来源包括癌组织和癌旁组织,检测血清CHI3L1水平有助于肝癌患者肿瘤负荷评估和疾病分层管理。

  • 标签: 肝肿瘤 肝细胞 壳多糖酶3样蛋白质1 肿瘤分期 组织阵列分析
  • 简介:摘要目的观察溶瘤腺病毒差异显示编码3(DD3)-ZD55-精子相关抗原9(SPAG9)在体外对激素依赖性前列腺癌LNCaP细胞的治疗效果,并探讨作用机制。方法将LNCaP细胞分为4组进行干预,分别为磷酸盐缓液组(PBS)、病毒对照组[ZD55-增强型绿色荧光蛋白(EGFP),10 MOI]、病毒治疗组(ZD55-SPAG9,10 MOI)、DD3启动子调控组(DD3-ZD55-SPAG9,10 MOI)。细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞存活率;Transwell检测细胞迁移和侵袭能;蛋白质印迹法(Western blot)检测SPAG9、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)与基质金属蛋白酶-2(MMP-2)和腺病毒早期区1A基因(E1A)的表达。多组之间采用方差分析,进一步组间比较采用SNK法。结果CCK-8结果,DD3-ZD55-SPAG9组、ZD55-SPAG9组和ZD55-EGFP组LNCaP细胞存活率均显著低于PBS组[(73.80 1.43)%、(73.66 2.19)%、(81.79 2.59)%比100%,F=1038.210,P<0.01],ZD55-SPAG9组与DD3-ZD55-SPAG9组细胞存活率降低更为显著,但两者之间存活率差异无统计学意义(P>0.05)。Transwell迁移结果,DD3-ZD55-SPAG9组、ZD55-SPAG9组和ZD55-EGFP组小室底膜细胞数明显低于PBS组[(52.57±5.57)、(48.67±4.04)、(69.67±6.02)比(109.06±9.54),F=384.466,P<0.05],ZD55-SPAG9组与DD3-ZD55-SPAG9组细胞迁移能力降低更为显著,且两者之间差异无统计学意义(P>0.05)。侵袭实验结果,DD3-ZD55-SPAG9组、ZD55-SPAG9组和ZD55-EGFP组穿透Matrigel胶,进入小室下层的细胞数目明显少于PBS组[(58.33±3.79)、(55.36±7.51)、(78.06±4.36)比(115.67±11.59),F=305.885,P<0.01],提示细胞侵袭能力显著降低,ZD55-SPAG9组与DD3-ZD55-SPAG9组细胞侵袭能力降低更为显著。Western blot结果显示,与PBS组比较,DD3-ZD55-SPAG9组、ZD55-SPAG9组和ZD55-EGFP组内SPAG9蛋白表达下调[(0.32±0.07)、(0.47±0.09)、(0.66±0.05)比1,F=594.522,P<0.01],E-cadherin表达上调[(4.80±0.34)、(3.80±0.35)、(2.81±0.52)比1,F=482.275,P<0.01],Vimentin表达下调[(0.33±0.04)、(0.46±0.06)、(0.53±0.05)比1,F=903.749,P<0.01],MMP-2表达下调[(0.30±0.03)、(0.44±0.05)、(0.60±0.05)比1,F=1 540.940,P<0.01],上述变化在ZD55-SPAG9组与DD3-ZD55-SPAG9组内更为显著。WPMY-1细胞内E1A在DD3-ZD55-SPAG9组内的表达明显低于ZD55-SPAG9和ZD55-EGFP组。结论溶瘤腺病毒DD3-ZD55-SPAG9在体外可以有效降低LNCaP细胞的存活率,并抑制迁移和侵袭,并对正常细胞具有更高的安全性。

  • 标签: 溶瘤腺病毒 前列腺癌