简介:DNAisthegeneticmaterialofvariousorganisms.ExtracellularDNAadsorbedorboundonsurface-activeparticlesinsoilshasbeenshowntopersistforlongperiodsagainstnucleasesdegradationandstillretaintheabilitytotransformcompetentcells.ThispaperreviewssomerecentadvancesonthebindingandtransformationofextracellularDNAinsoils,whichisfundamentaltounderstandingthenatureofthesoil,regulatingbiodiversity,andassessingtheriskofreleasinggeneticallyengineeredmicroorganisms(GEMs)aswellasbeinghelpfulfordevelopmentofthegeneticevolutionaltheoryofbacteria.Severalinfluencingfactors,suchassoilpH,ionicstrength,soilsurfaceproperties,andcharacteristicsoftheDNApolymer,arediscussed.Todate,theunderstandingofthetypeofmolecularbindingsitesandtheconformationofadsorbedandboundDNAtosoilparticlesisstillinitsinfancy.
简介:本文提出DNA序列相似度指标,建立DNA序列比对算法。首先,将水生生物DNA样本序列与现有的基因库中的DNA序列逐项比对;其次,在满足特定阈值条件下,确认样本序列的分类。利用Java编程语言来实现算法,通过MonteCarlo模拟和实际应用,验证算法的有效性。理论结果表明:在满足特定阈值条件下,通过计算DNA序列相似度,能够确定数据库中与未知DNA样本序列最相似的序列,判断样本序列的分类。模拟实验、对比研究和应用结果表明:相似度指标算法在有效判别DNA序列的分类,提高DNA序列匹配成功率,降低程序复杂度等方面具有优良特征。
简介:目前关于落叶木本果树DNA提取的材料多数为植物的叶片,叶片具有试材广泛、容易研磨、DNA产量高、质量好等优点,但也会受到季节、病虫害的影响且不耐贮藏。落叶果树枝条具有取材容易、DNA含量丰富的特点而适合在休眠季节用于提取DNA,进而加速果树分子生物学研究进程。本研究探讨了CTAB法、SDS法对休眠季节不同时期取材的葡萄、桃、樱桃、杏、苹果、银杏、柿子、枣8种落叶果树的一年生枝条DNA提取效果。结果表明:除葡萄外其他多数材料在整个休眠时期均能提出高质量的DNA,所提DNA电泳带纹清晰、亮度高,DNA产率高、质量优,可用于有关分子生物学的后续试验(RAPD分析);再DNA提取方法方面,从DNA产量和质量上来看,SDS法总体上要优于CTAB法。最后对提取中出现中存在过多的酚类、多糖和其他次生物质去除方法进行了讨论。
简介:随着不同转基因生物(GMO)制品的不断商业化,转基因成分检测技术也需不断更新。由于甘蔗红糖为甘蔗汁经高温熬煮浓缩而成,红糖中残留的DNA降解严重、含量低、片段短,且蛋白及糖分杂质含量高,所以甘蔗红糖DNA是比较难以收集并进行分子检测的。为了在转基因甘蔗红糖商业化前建立起转基因甘蔗红糖DNA的提取及分子鉴定技术,本研究以转基因甘蔗和非转基因甘蔗为材料,模仿传统的红糖制作工艺,分别获得了转基因甘蔗红糖与非转基因甘蔗红糖。通过对DNA提取方法进行改进,设计不同扩增片段长度的引物,并对传统PCR与荧光定量PCR进行比较,建立了稳定的甘蔗红糖DNA的提取方法及外源基因分子鉴定技术该技术对转基因甘蔗红糖与非转基因甘蔗红糖进行准确鉴别,为今后转基因甘蔗红糖的商业化所需的转基因食品鉴定提供技术支持,也为后面更为重要的转基因甘蔗白糖DNA的提取及分子鉴定提供借鉴。
简介:竹子射击通过internodes的快速的延伸快速成长。为了验证DNAmethylation是否影响竹子,射击延伸,我们在竹子(Phyllostachyspraecox)的五个发展阶段比较了DNAmethylation层次,包括年轻竹子射击40厘米最后(S1),竹子射击2厘米最后(S2),年轻的叶(Y1),叶(Y2),和老化叶(M),由基于KpnI/MseI和Acc65I/MseI平台使用放大碎片长度多型性(AFLP)。到在竹子射击(S1和S2)的unmethylatedDNA地点的methylated的多型性比率在叶(Y1,Y2和M)比那高。到在S2的unmethylatedDNA地点的methylated的多型性比率最高(32%)。我们的结果建议DNAmethylation在种阶段的竹子极大地变化了,特别在internodes的快速的延伸的舞台。