简介:摘要:目的 研究保元汤治疗虚劳病的物质基础及作用机制。方法 基于TcmSP数据库建立保元汤化学成分库并按照利宾斯基五法则(ADME)筛选保元汤的有效成分;通过SwissTargetPrediction、TTD、CTD数据库预测有效成分与虚劳病相关的靶点,并导入Metascape数据库以阐明保元汤的作用机制;根据贡献指数分析确定保元汤治疗虚劳病的物质基础。结果 保元汤45个具有良好药代动力学特征和生物活性的有效成分与虚劳病67个靶点协同发挥治疗作用;根据贡献指数分析,Panaxadiol、Tyranton、Kaempferol、quercetin、Calycosin、D-Camphor、formononetin 7个有效成分为保元汤治疗虚劳病的物质基础;对构建的网络分析发现,ABCG2、MTOR、NOS2、CYP2C19和VDR 等靶点主要参与化学致癌作用信号通路、细胞色素P450对外源性化学物质代谢信号通路、HIF-1信号通路和花生四烯酸代谢信号通路。结论 Panaxadiol、Tyranton、Kaempferol、quercetin、Calycosin、D-Camphor、formononetin 7个有效成分作为保元汤的物质基础通过调节ABCG2、MTOR、NOS2、CYP2C19和VDR等靶点以及化学致癌作用、类固醇激素生物合成、HIF-1和花生四烯酸代谢信号通路发挥治疗虚劳病的作用。
简介:摘要网络药理学是药理学的一个分支,通过生物网络构建、网络分析和实验验证预期结果的方法研究药物-基因-靶点-疾病之间复杂的生物网络关系。网络药理学在研究复杂成分药物治疗复杂发病机制疾病中具有独特优势。网络药理学主要在新药研发、药物作用机制、中药及其复方研究、药物重定位和毒理学研究等领域中得到应用,在眼部疾病中主要涉及细菌性结膜炎、视网膜静脉阻塞、糖尿病视网膜病变和视网膜色素变性等疾病。网络药理学在眼科的应用前景主要体现在探寻中药治疗眼科疾病的有效物质、疾病靶点和通路,药物重定位和在眼科基础研究寻找下游靶点3个方面,我们需要加大网络药理学在眼科中的应用范围。本文对网络药理学的概念、研究方法、应用领域、在眼科的应用等研究进展进行综述。
简介:目的通过网络药理学方法,探究黄芪六一汤对2型糖尿病的作用机制.方法本实验以黄芪六一汤治疗糖尿病为指导,运用网络药理学方法对黄芪六一汤治疗糖尿病的主要有效分子进行预测.预测过程中收集化学结构数据、基因组学数据、蛋白组学数据、药理学数据.结果根据网络药理学预测发现,即黄芪六一汤对2型糖尿病治疗的主要有效分子共20个;黄芪六一汤可能直接或间接作用于线粒体以及细胞器膜,并通过与各种离子和物质相结合的方式影响跨膜和转运作用.可能参与了2型糖尿病的氧化磷酸化、脂类代谢、甾体激素合成代谢途径,也参与2型糖尿病引发的心肌收缩和由于神经系统变形或退化引起的帕金森病、阿尔茨海默病、亨廷顿舞蹈症等并发症.结论黄芪六一汤通过细胞间的物质转运,参与能量代谢而达到治疗2型糖尿病的目的.
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨芍药甘草汤治疗胃癌的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出121个靶点为芍药甘草汤与胃癌症的共同基因靶点。结论:芍药甘草汤在治疗胃癌中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要目的运用网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的分子机制。方法通过TCMSP和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)筛选温胆汤的潜在活性成分和作用靶点,通过药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库收集高血压疾病靶点,STRING数据库进行蛋白相互作用分析,采用Cytoscape v3.7.1构建网络,再用ClueGO进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后以适合的分子和靶点进行分子对接。结果共筛选出温胆汤141个潜在活性成分和108个潜在治疗靶点;通过cytoHubba中MCC算法筛选出排位前20的核心靶点,GO分析包含164条显著性条目,包括生物过程133条、分子功能24条、细胞定位7条。KEGG通路富集筛选出7条枢纽通路,且活性成分与靶点间对接良好。结论温胆汤可通过多途径、多靶点治疗高血压,可为其临床应用提供数据。
简介:摘要:目的:基于网络药理学分析真武汤治疗慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的作用机制。方法:采用中药网络药理学分析平台(TCMSP)获取真武汤中候选化合物,采用Swiss Target Prediction平台开展预测候选靶标,采用TCMSP中相应化合物补充靶点,靶点蛋白通过Uniprot数据库转化为基因名;采用CTD、TTD数据库获取CHF相关基因,取真武汤靶标(基因)与CHF相关基因交叉部分形成真武汤治疗CHF潜在靶标,在STRING11.0在线数据库中输入潜在靶标分析蛋白互作过程,在网络可视化软件Cytoscape3.7.1中编辑蛋白互作图形,在Excel中编辑真武汤中药-潜在化合物-潜在靶标网格,通过Cytoscape3.7.1使网格可视;利用DAVID6.7分析基因本体功能(gene ontology,GO)以及利用基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析富集通路及药物-靶点;采用分子对接技术验证关键靶点和化合物的互作机制。结果:经过分析,真武汤中主要有11种预测靶蛋白。Metascape富集分析结果预测为:靶蛋白主要产生调节血液循环、环磷酸鸟苷酸(cGMP)-蛋白激酶G(PKG)生物通路、收缩平滑肌的效果。分析富集GO结果为:有30条路通富集在生物学反应、12条富集在细胞组成成分、12条富集在分子反应种。KEGG分析通路结果为:15条生物通路,真武汤具有通过凋亡生物通路、P53生物通路、PI3K-Akt生物通路、NF-kappaβ生物通路、TNF生物通路等进行干预细胞凋亡、抑制炎性因子基因表达来产生治疗CHF的效果。结论:根据预测结果,真武汤通过多个成分、多个靶点、多条通路、多个选择等复杂过程,产生对CHF的预防和治疗效果,其中主要通过干预细胞凋亡完成作用。
简介:摘要:目的:运用网络药理学方法探讨厚朴三物汤治疗便秘的作用机制。方法:构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:筛选出122个靶点为厚朴三物汤与便秘症的共同基因靶点。结论:厚朴三物汤在治疗便秘中有着多靶点调控、多方面作用的特点。
简介:摘要目的基于网络药理学探讨芍药甘草汤干预紧张性头痛作用机制。方法通过TCMSP筛选得到芍药甘草汤的潜在有效成分与靶点,运用GeneCards、DisGeNET、Drugbank和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取紧张性头痛的作用靶点,得到"芍药甘草汤-紧张性头痛"交集靶点,上传至STRING数据库绘制蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)并进行拓扑分析,借助Cytoscape 3.6.1软件构建"芍药甘草汤-药物成分-靶点-紧张性头痛"可视化网络,并对交集靶点进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果芍药甘草汤与紧张性头痛的交集靶点有51个,拓扑属性分析提示CASP3、JUN、HSP90AA1、MAPK1、STAT3、CCND1、ESR1、RELA、PTGS2、MAPK14等可能是芍药甘草汤干预紧张性头痛的重要潜在靶点。GO富集分析得到876个细胞生物学过程,62个细胞组分,101个分子功能。KEGG通路富集分析得到TNF信号通路、5-羟色胺能突触通路、核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路、多巴胺能突触通路和胆碱能突触通路等25条相关信号通路。结论芍药甘草汤对紧张性头痛的干预作用具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点,可为临床用药提供指导。
简介:摘要目的运用网络药理学方法预测黄连解毒汤抗Hp感染的主要有效成分、靶点及信号通路,挖掘其潜在作用机制,为后续实验研究提供依据。方法应用TCMSP筛选黄连解毒汤中黄连、黄芩、黄柏、栀子4味中药的主要有效成分及其潜在作用靶点。通过GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选Hp感染相关靶点,并取药物和疾病的交集靶点。将交集靶点导入Cytoscape 3.7.2构建有效成分和Hp感染相关靶点网络,并进行拓扑学分析。应用STRING在线分析平台构建靶蛋白相互作用(PPI)网络并进行分析。运用R语言在线检索Bioconductor平台对靶点进行GO功能富集;通过DAVID 数据库对靶点进行KEGG通路富集分析。结果黄连解毒汤中共筛选出85个有效成分,主要包括槲皮素、小檗碱、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素等。对应靶点112个,疾病相关靶点1 960个,药物疾病共同靶点71个。网络中度值最高的有效成分为槲皮素,度值最高的靶点为环加氧酶1(PTGS1)。PPI网络中69个节点中度值较高的靶蛋白包括半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、IL6、MAPK8、原癌基因(MYC)、VEGFA、表皮生长因子受体(EGFR)等。GO功能富集分析共获得89个条目,KEGG通路富集分析共筛选12条存在显著差异的信号通路,其中发挥主要作用的有癌症通路、ErbB信号通路、p53信号通路、凋亡、黏附斑等。结论黄连解毒汤可通过多成分、多靶点、多通路发挥对Hp的治疗作用,可通过抗肿瘤机制调控胃癌进程,本研究可为其有效成分研究和抗Hp机制研究提供依据。
简介:摘要目的基于网络药理学方法探讨增液汤治疗干燥综合征的核心组分及机制。方法采用BATMAN-TCM平台获取增液汤的主要成分及其预测靶点,通过疾病相关的基因与突变位点数据库(DISGeNET)及毒性与基因比较数据库(CTD)获取干燥综合征的靶标基因,并运用Omicshare平台获取增液汤与干燥综合征靶标基因的交集;通过String数据库进行蛋白质相互作用分析,将交集靶点上传到DAVID网站进行GO及KEGG富集分析,应用Cytoscape 3.6.1进行结果分析并将其可视化。结果筛选得到9个增液汤治疗干燥综合征的有效成分,25个核心靶点,DAVID分析得到29个生物过程,25条相关通路。增液汤治疗干燥综合征关键靶点为L-天冬酰胺、甲基麦冬黄烷酮B、二氢麦冬黄酮E,主要作用于PI3K/AKTt通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin, mTOR)通路、Toll样通路等。结论增液汤对干燥综合征的治疗是多成分、多靶点、多通路共同作用的结果,本研究为增液汤治疗干燥综合征作用机制的深入探讨提供了理论依据。
简介:【摘要】:目的:基于网络药理学探讨参附汤治疗慢性心力衰竭的作用机制。方法:本次研究选取本院2020年7月-2021年4月收治慢性心力衰竭患者156例,按照电脑随机法将其分为了对照组(传统组方用药)和实验组(基于网络药理学改良后的组方用药)两组,对比用药疗效。结果:对比综合治疗有效率:实验组综合有效77例(98.72%),对照组综合有效69例(88.46%),(p<0.05)。对比综合治疗满意率:实验组综合满意75例(96.15%),对照组综合满意67例(85.90%),(p<0.05)。结论:经网络药理学研究,参附汤作用机制在于人参二醇、人参皂甙等;川乌碱甲、谷甾醇等药物,临床针对患者病情加减其他药物以此来增加疗效。
简介:摘要:目的:运用网络药理学理论分析香砂六君子汤治疗慢性萎缩性胃炎作用机制。方法:通过TCMSP平台筛选香砂六君子汤的有效成分及作用靶点,通过DisGeNET数据库筛选疾病治疗靶点,获取交集作用靶点,使用Cytoscape软件构建“药物-活性成分-作用靶点”网络,分析获取核心成分,构建靶点蛋白质互作网络并分析获取核心靶点,对交集靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果:得到香砂六君子汤中药有效活性成分176个,作用靶点272个,慢性萎缩性胃炎疾病治疗靶点203个,交集靶点34个,经过网络拓扑分析得到槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、柚皮素、黄芩素等核心活性成分,P53、AKT1、STAT3、VEGFA、IL2、IL6、CASP3、PTGS2等核心治疗靶点,GO分析富集于对细胞凋亡过程的负调节,炎症反应,血管生成,对NO生物合成过程、细胞增殖、基因表达、ERK1和ERK2级联、血管生成的正调控等生物过程,KEGG分析富集于癌症、HIF-1信号、癌症蛋白多糖、黏着斑、PI3K/Akt信号、TNF信号、VEGF信号等通路。结论:香砂六君子汤通过多成分-多靶点-多途径的机制治疗慢性萎缩性胃炎,抑制癌症发生发展可能是其中的关键环节。