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  • 简介:摘要生物中大量数据信息促进了生物信息的发展,序列数据的日益增多对分析处理数据的算法、模型要求越来越高。在生物信息中,动态规划算法是最为常用的一种方法,也是最基本的优化方法。其目的就是解决多阶段决策问题和对复杂空间进行优化。动态规划在序列比对、基因识别、结构预测生物分子探针优化问题上起着重要的作用。本文对生物信息中动态规划的6种算法进行了简单分析,并对比各自的优缺点。

  • 标签: 生物信息学 算法 动态规划
  • 简介:随着信息化网络的普及和广泛应用,图书馆图书资料数字化网络的建设也日新月异,利用先进的图书馆学理念,服务于中医药信息科学就显得尤为必要。“今天我们应更加解放思想,与时俱进,充分吸收和利用包括西医学在内的一切现代科学技术和理论,更加全面有效地继承中医药精华,创新发展中医药学术”。

  • 标签: 图书资料 医药信息学 现代科学技术 信息化网络 数字化网络 中医药
  • 简介:公安信息地位由被动附属型转变为主动引领型,公安信息活动实践在不断变革,一种公安信息工作模式正在形成。与实践发展相比,公安信息学科建设相对落后,公安信息理论体系还未完全形成,基础理论研究比较薄弱。因此,当务之急,首先应突破常规,重新构建公安信息学科和专业课程体系;其次强化公安信息基础理论研究,以理论研究推动应用研究;最后应保持公安信息学科适应性发展态势。

  • 标签: 公安情报学 学科建设 理论研究 适应性发展 启示
  • 简介:目的:对精子发生RNA结合蛋白Boule基因启动子区结合蛋白进行生物信息分析。方法:从基因参考序列数据库获取Boule基因启动子区序列,使用TFSEARCH程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测。结果:成功获得长度为2kb的人Boule基因启动子区序列。该启动子区Thresholdscore〉90的共有60个转录因子结合位点,涉及sox家族、GATA结合蛋白家族、热休克因子家族、锌指蛋白Kruppel家族、POU家族、runt家族、同源异型框基因家族、TALE类同源结构蛋白家族、转录因子螺旋环螺旋家族、IKAROS家族、FOX家族11个家族的转录因子和3个TATAbox。结论:Boule基因表达的调控是在一定时间或空间上、一种或多种调节蛋白作用的复杂过程。调控Boule基因表达的转录因子绝大部分与胚胎发育、性别决定、个体生长密切相关。

  • 标签: Boule基因 启动子 转录因子
  • 简介:目的:对人类PPARγ基因5'-非翻译区进行生物信息的分析。方法:通过搜索网络数据库,得到PPA脚基因翻译起始点上游约2kb的序列。运用PROMOTERSCAN分析该序列可能的启动子区域,利用在线分析软件EMBOSS、MethPrimer和CpGIslandSearcher分析该序列潜在的CpG岛,运用TFSEARCH软件分析该序列潜在的转录因子结合位点。结果:人类PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游反向链2425到2175区具有启动子活性,在启动子上具有TATA盒。PPARγ基因5'-非翻译区转录起始位点上游2kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19个转录因子的潜在结合位点,不存在CpG岛。结论:该实验为后续的PPARγ基因的转录调控研究奠定基础。

  • 标签: 生物信息学 PPARΓ 启动子 转录调控
  • 简介:纤维蛋白原相关蛋白(FREPs)是一类包含纤维蛋白原样结构域(FBG)的糖蛋白,广泛存在于脊椎动物和无脊椎动物中。本文利用生物信息方法对海葵基因组中存在的FREPs进行搜索,得到了33条较为可靠的同源序列,并进行了多序列比对和构建系统进化树分析。

  • 标签: 海葵 纤维蛋白原相关蛋白 先天性免疫 进化
  • 简介:目的通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础。方法首先利用microRNA(miRNA)芯片技术分别检测胎龄16d、19d和21d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),最后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGGPathwayanalysis)。结果miRNA-126*表达量在胎龄16d、19d和21d3组胎肺组织间逐渐上升。miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上。信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中。结论本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础。

  • 标签: miRNA-126* 生物信息学 肺发育 大鼠
  • 简介:类黄酮(Flavonoids)是植物体内一类重要的次生代谢产物,它以结合态(黄酮苷)或自由态(黄酮苷元)形式存在于水果、蔬菜、豆类和茶叶等许多植物中,对植物的生长发育有着重要的调节作用。查尔酮合成酶(Chalconesynthase,CHS,EC2.3.1.74)是植物类黄酮合成途径的第一个关键酶,在调控类黄酮的生物合成以及类黄酮的成分起着决定作用。本研究基于番茄全基因组测序数据,利用生物信息方法,鉴定了查尔酮合成酶基因家族成员,分析其内含子一外显子的结构特征、系统发育关系,序列结构的保守性以及染色体上的分布。研究表明:查尔酮合成酶(S1CHS)是含有8个成员的多家族基因,蛋白质序列编码位于160(S1CHS05)~438(S1CHS08)个氨基酸之间;相似性在33.7%(S1CHS02和S1CHS06)~92.0%(S1CHS04和S1CHS07)之间,表明这些序列之间具有较高的遗传多样性;此外,结构分析发现这些基因均含有较少的内含子(0~2个);序列比对表明这些基因具有较高的保守性;它们不均匀分布在番茄的1、5、6、9和12号染色体上。该研究不仅有助于未来了解该基因家族的进化起源提供参考,而且可为我们进一步分析该基因家族成员的功能奠定基础。

  • 标签: 番茄 查尔酮合成酶 生物信息学 表达分析
  • 简介:昆虫化学感受蛋白是昆虫体内在长期进化过程中形成的一类保守性强、低分子量的酸性可溶蛋白。本研究依据GenBank公布的BmCSP16基因的CDS区序列,运用反转录RT-PCR方法克隆BmCSP16基因,与表达载体pET-30b(+)连接,并在大肠杆菌BL21(DE3)中正确表达;运用生物信息方法预测BmCSP16蛋白结构表明:有4个半胱氨酸,并形成2个二硫键,6个α螺旋折叠成近球状结构,具有昆虫化学感受蛋白的典型结构特征。

  • 标签: 家蚕 化学感受蛋白 反转录RT-PCR 结构预测
  • 简介:对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693bp,含有1个297bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。

  • 标签: 沙冬青 AmLEA5 生物信息学分析 表达模式 亚细胞定位
  • 简介:摘要为了解决初中信息技术教学中好学生“吃不饱”,中等生“提不高”,后进生“吃不了”等实质性问题,本人根据任务驱动和因材施教的教育原理,提出了分层导学法的教学模式,来改进初中信息技术的课堂教学,从而有力地促进不同层次的学生获得信息技术和信息素养等方面的综合协调发展。

  • 标签: 初中信息技术分层导学法因材施教
  • 简介:摘要笔者就高中信息技术这门学科的特点谈谈使用学案导的一点体会,这种教学模式提倡将课前自学、课中研、课后整三位合为一体,倡导利用学案导教学手段来进行教学,注重培养学生自主学习的意识和能力。

  • 标签: 高中信息技术学案导学教学模式
  • 简介:一、问题的提出2012年浙江省普通高考考试说明(理科综合)生物考试能力要求中,提出了考查的四项能力:理解与表达能力、实验与探究能力、获取与处理信息的能力和综合运用能力。但是没有明确的可测量的、可操作的指标,只是隐含在各类高考题中考察。

  • 标签: 能力分析 处理信息 PISA 生物学 测试 评价
  • 简介:第一次世界大战期间,作为美国政府首次开展的大规模公共关系活动,公共信息委员会的战争宣传取得了极大成功,造就了一批美国公共关系研究的重要先驱人物,推动了战后现代公共关系研究的兴起和发展。

  • 标签: 美国 第一次世界大战 公共信息委员会 现代公共关系学
  • 简介:高考结束后,我对未来产生了深深的迷茫感甚至是恐惧感。翻着厚厚的招生手册,想着自己高不成低不就的省排名——河南省574名,我第一次感到自己面临着一场严肃而神圣的抉择。人生可以有很多选项,每一次选择都可能决定你一段时间甚至是一生的道路。

  • 标签: 新闻 英语 恐惧感 河南省
  • 简介:见过很多师范院校都拿“高为师,身正为范”为校训,后来在北师大学习时,看到其校训是启功先生书写的“为人师,行为世范”,当时没有觉得两句话有什么不一样,认为只不过是因为启功先生,因为北师大。但工作中遇到的几个故事,却让我越来越领悟到“为人师”远远超出“高为师”,认识到“为人师”才是我们每一位为师者毕生的追求,

  • 标签: 人师 师范院校 身正为范 北师大 校训 启功
  • 简介:一、对教师的教、学生的事倍功半的反思我是一位教学比较严谨的教师,每次上课我都做好充分准备,尽量不漏掉每个细节,字、词、句、段、篇面面俱到,可做练习的时候,题型稍有变化,有些孩子就束手无策,部分孩子考试成绩不太理想,事倍功半,辛苦和成绩不成正比,

  • 标签: 考试成绩 教学比较 教师 孩子 学生 上课
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