简介:摘要目的评估实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)检测无创样本沙眼衣原体的性能。方法以罗氏Cobas® 4800CT/NG作为参照试剂,收集广西壮族自治区皮肤病研究所性病门诊就诊的男性患者尿液样本(248份)及女性患者阴道拭子样本(224份),评估SAT法检测沙眼衣原体的临床性能。结果最终有470份样本纳入统计。罗氏PCR检出阳性60例(12.8%),男性阳性数33例,女性27例;SAT检出沙眼衣原体阳性41例(8.7%),男性阳性数19例,女性22例。SAT试剂应用男性尿液检测的灵敏度为57.58%,特异性为99.06%;女性阴道拭子检测的灵敏度为81.48%,特异性100.00%。结论SAT试剂可以应用于无创样本,但是其应用尿液检测沙眼衣原体上还需要对尿液的核酸提取方法进一步的优化,提高其检测的灵敏性。
简介:摘要目的探讨对泌尿生殖道沙眼衣原体(CT)感染进行检测的过程中,采用实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)获得的效果。方法选取我院2011年10月—2013年10月200例疑似患者,针对所有患者尿样以及拭子标本在同一时间完成SAT检测以及CT培养检测,对检测后表现出差异标本利用PCR方法针对拭子标本实施二次检测,最后由最终的检测结果对SAT技术在实施检测过程中具有的敏感性以及特异性进行详细评估。结果对细胞培养以及PCR最终的实验结果进行相关性分析,最终分别得出SAT技术在对尿样标本进行检测以及对拭子标本进行检测后分别具有的敏感性以及特异性,仔细分析二者最终检测结果的符合率,发现没有显著差异(P>0.05)。结论在对CT试剂盒进行检测的过程中采用SAT技术表现出了诸多的优点,最终的检测结果表现出了较高的敏感性以及特异性,临床针对CT检测工作具有重要的应用意义。
简介:摘要目的研究深圳地区不孕育龄妇女沙眼衣原体(Ct)和解脲支原体(Uu)感染情况以及与不孕症的相关性。方法随机选取本院就诊的581例不孕妇女和162例正常妊娠妇女,取尿液样本进行Ct和Uu实时荧光核酸恒温扩增技术的检测。结果研究组Ct和Uu阳性率分别为24%和33%;对照组阳性检出率为8%和3%,两组间差异有显著性;CTχ2=18.91P<0.05;UUχ2=15.63P<0.05;Ct+Uuχ2=6.7P<0.05。结论女性生殖道Ct和Uu的感染是引起不孕的因素;实时荧光核酸恒温扩增技术是一种简便、快速、经济的病原体的检测技术。
简介:摘要目的分析实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)在妇女生殖道病原体感染诊断中的应用价值。方法我院2015年1月至2017年12月疑似生殖道病原体感染的女性患者200例为研究对象,分别采取免疫层析胶体金检测法、SAT比较沙眼衣原体(CT)的阳性检出率。采用培养法和SAT比较解脲支原体(UU)的阳性检出率,采用SAT检测生殖支原体(MG)的阳性率。结果在CT检测中SAT的阳性率为6%,胶体金阳性率为4%,经卡方检验,χ2=0.01,P>0.05差异无统计学意义。对4份SAT阳性而胶体金阴性的差异样本进行双脱氧酶终止法检测,结果4份均为阳性。在UU检测中SAT的阳性率为35.5%,培养法阳性率为30.0%,经卡方检验,χ2=0.01,P>0.05差异无统计学意义。对4份培养阳性而SAT阴性的差异样本进行双脱氧酶终止法检测,结果1份为阳性,3份为阴性;对15份培养阴性而SAT阳性的差异样本进行双脱氧酶终止法检测,结果14份为阳性,1份为阴性。SAT检测MG的阳性率为3.5%(7/200)。结论培养法是UU检测的临床金标准,然而却存在一定的不足之处,如费时、操作繁琐、敏感性低等,更需要进一步确认。胶体金法检测CT则耗时较长,且检测工艺较为繁琐。采用SAT检测女性生殖道沙眼衣原体、解脲支原体、生殖支原体具有较好的应用效果,检测时间短、成本低,在临床可作为病原体感染判断依据。
简介:摘要目的探讨应用结核分枝杆菌RNA恒温扩增实时荧光检测(SAT-TB)以及SAT-TB联合结核T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)对痰涂片阴性肺结核的诊断价值。方法对2016年12月至2017年12月在四川大学华西医院就诊的101例疑似肺结核患者进行结核分枝杆菌快速培养(MGIT960)、T-SPOT.TB以及SAT-TB检测,分析应用SAT-TB技术以及SAT-TB联合T-SPOT.TB对检测痰涂片阴性肺结核的诊断价值。结果101例疑似肺结核患者中84例临床确诊为肺结核,17例为非肺结核。SAT-TB和T-SPOT.TB检测的灵敏度分别为63.10%和68.42%,特异性分别为94.12%和63.64%,AUC值分别为0.79和0.66。SAT-TB和T-SPOT.TB联合检测的阳性预测值为100%。结论SAT-TB对于痰涂片阴性肺结核的诊断价值较高,联合T-SPOT.TB检测时能有效减少肺结核的漏诊。
简介:【摘要】目的:探讨肺泡灌洗液抗酸染色涂片、结核杆菌培养、实时荧光定量核酸扩增检测技术(GeneXpert MTB/RIF)应用于菌阴肺结核临床诊断工作中的具体效果。方法:172例疑似菌阴肺结核患者均接受肺泡灌洗液抗酸染色涂片、结核杆菌培养、GeneXpert MTB/RIF检测,计算并对比其临床诊断敏感性、特异性、符合率等数据。结果:172例疑似菌阴肺结核患者最终临床确诊肺结核90例,对比可知肺泡灌洗液抗酸染色涂片、结核杆菌培养、GeneXpert MTB/RIF诊断菌阴肺结核敏感性、符合率差异显著(存在统计学意义,P<0.05)。结论:应用肺泡灌洗液GeneXpert MTB/RIF检测辅助诊断菌阴肺结核敏感性、符合率均较高。
简介:【摘要】:新型冠状病毒肺炎是由新型冠状病毒 (2019-nCoV)引起的一种急性的呼吸道传染疾病,可迅速发展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、难以纠正的代谢性酸中毒和出凝血功能障碍,严重威胁患者的生命健康安全。经相关学者对新型冠状病毒毒株的检验研究后,确认通过实时荧光 RT-PCR核酸检测可对新型冠状病毒进行临床诊断,可以早发现、早诊断、早治疗或尽早与其他病毒感染者进行鉴别诊断。
简介:摘要目的探讨结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测(Xpert MTB/RIF)技术诊断艾滋病患者肺结核的应用价值。方法回顾性分析2017年7月至2019年11月上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心收治的226例疑似肺结核的艾滋病患者的临床资料。分别进行痰涂片荧光染色显微镜下检查、BACTEC MGIT 960液体培养(或罗氏固体培养)和Xpert MTB/RIF检测,并分析在艾滋病患者中Xpert MTB/RIF技术诊断MTB感染和利福平耐药的灵敏度和特异度。结果226例疑似肺结核患者中,痰培养阳性94例(41.6%),其中MTB阳性51例(54.3%),非结核分枝杆菌(nontuberculosis mycobacteria,NTM)阳性43例(45.7%)。以痰分枝杆菌培养阳性且结核分枝杆菌分泌蛋白64抗原阳性为金标准,Xpert MTB/RIF技术诊断MTB的灵敏度为72.6%[95%可信区间(confidence interval,CI)66.7%~78.4%],特异度为97.1%(95%CI 95.0%~99.3%)。Xpert MTB/RIF技术诊断痰涂片阳性患者MTB的灵敏度为76.7%(95%CI 67.7%~85.8%),特异度为90.0%(95%CI 83.6%~96.5%)。Xpert MTB/RIF技术诊断痰涂片阴性患者MTB的灵敏度为50.0%(95%CI 41.8%~58.2%),特异度为99.3%(95%CI 97.9%~100.0%)。18例患者同时检测利福平表型和基因型耐药,以表型耐药为金标准,Xpert MTB/RIF技术检测利福平基因型耐药的灵敏度为75.0%,特异度为100.0%。结论艾滋病患者中Xpert MTB/RIF技术诊断肺结核的灵敏度和特异度均较高,且能快速区分MTB和NTM,具有较好的应用价值。
简介:摘要目的建立实时荧光环介导等温扩增(Real-time Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)技术检测皮肤癣的方法,实现皮肤癣菌病的快速实验室诊断。方法通过在NCBI官网查找下载皮肤癣菌中毛癣菌属、小孢子菌属和表皮癣菌属临床分离率较高的菌种rRNA序列(18S rRNA, ITS1, 5.8S rRNA, ITS2和28S rRNA),运用DNASTAR Lasergene软件进行分析比对,寻找出毛癣菌属内高度保守的靶序列,且该段靶序列要与其他属存在差异,运用Primer Explorer V5设计LAMP引物。提取须癣毛癣菌NBRC6202基因组DNA作为模板筛选引物以及建立LAMP检测毛癣菌属的反应体系,以红色毛癣菌ATCC28188基因组DNA作为模板测试其敏感性和稳定性,以毛癣菌属以外的其他真菌、细菌基因组DNA验证LAMP反应体系的特异性。结果筛选的4套引物里,primer2的扩增效果较好,可在22 min检测出须癣毛癣菌,且可以特异地检测出红色毛癣菌、指间毛癣菌、疣状毛癣菌、许兰毛癣菌、紫色毛癣菌。本研究建立的毛癣菌属RT-LAMP检测方法的最低检测限为1 pg/μL;在10 000 pg/μL、100 pg/μL和1 pg/μL三个浓度的分别10次重复检测实验中平均CT值和CV%分别为9.24±0.30,3.29%、10.57±0.54,5.12%、15.95±0.52,3.24%。结论实验建立的毛癣菌属LAMP检测方法在特异性、敏感性和稳定性三方面均表现出优越的性能,能快速准确地检测出毛癣菌属常见菌种,具有良好的临床应用前景。
简介:摘要:目的 探讨 RNA 恒温扩增实时荧光检测技术( SAT-TB )与结核感染 T 细胞斑点实验( T-spot.TB )联 合检 测在结核性胸膜炎( TBP ) 快速 诊断中的 应用 价值。方法 选择 181 例 疑似结核性胸膜炎 患者的胸腔积液作为研究对象,其中明确诊断的结核性胸膜炎患者的胸腔积液标本 102 例 ( TBP 组) 和非结核性胸膜炎患者的胸腔积液标本 79 例(非 TBP 组) ,采用 SAT-TB 及 T-spot.TB 方法进行检测。以临床诊断为标准,采用 ROC 曲线分析比较两种方法单独及联合检测, 分析其敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值 及 一致性( Kappa 值) 。结果 SAT-TB 、 T-spot.TB 、 SAT-TB+T-spot.TB 检测的敏感度分别为 26.47% 、 84.31% 和 87.25% ;特异度分别为 100.00% 、 74.68% 和 100.00% ;阳性预测值分别为 100.00% 、 81.13% 和 100.00% ;阴性预测值分别为 51.30% 、 78.67% 和 85.87% ;一致性( Kappa 值)分别为 0.239 、 0.593 和 0.857 ; ROC 曲线下面积 AUC 分别为 0.632 ( 95% CI : 0.589 ~ 0.675 )、 0.795 ( 95% CI : 0.735 ~ 0.855 )和 0.936 ( 95% CI : 0.904 ~ 0.969 )。诊断价值 SAT-TB+T-spot.TB 高于 SAT-TB 及 T-spot.TB (均 p <0.05 )。结论 SAT-TB 和 T-spot.TB 联合检测对 结核性胸膜炎 患者有较好的临床诊断价值。
简介:【摘要】目的:探讨在实施流感病毒核酸检测中实时荧光定量PCR检验方式运用可行性。方法:选取2018年1月1日~2020年12月31日,我中心收到的300件流感样病例咽拭子作为研究对象;针对流感病毒核酸利用实时荧光定量PCR完成检测,就获得结果进行分析。结果:对于300件流感样病例咽拭子完成检测后,80件获得流感病毒核酸阳性结果;其中56例属于甲型H1N1病毒,15件属于季节性甲3亚型病毒,6件属于季节性甲1型病毒,2件属于乙型病毒,1件属于丙型病毒。结论:实时荧光定量PCR检验方式有效运用,呈现出有效性以及科学性特点,对于流感病毒核酸检测准确性以及快速性可以做出保证,对于流感病毒流行规律可以进行认真分析,对于公共卫生事件突发可以给予充分预防。
简介:摘要目的探讨实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸在疾病诊断中的应用。方法从中国疾病预防控制信息系统选取截至2020年3月5日录入的河南省COVID-19的实验室检测数据和病例基本信息。所有信息都由当地医院和疾控中心录入系统,医院或者区县疾控中心负责采样,河南省各省辖市疾控中心负责核酸检测。结果共纳入6 714份标本,SARS-CoV-2核酸检测阳性率为23.82%。标本来源于3种诊断类型,确诊病例1 200例,疑似病例2 178例,无症状感染者77例,SARS-CoV-2感染核酸确诊率为36.96%(1 277/3 455)。所有诊断类型标本中,鼻拭子、痰液和咽拭子的SARS-CoV-2核酸检测阳性率分别为19.38%、28.59%、23.53%,差异有统计学意义(χ2=15.896,P<0.01)。确诊病例的呼吸道标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率为63.10%。鼻拭子、痰液和咽拭子的核酸阳性率分别为50.80%、58.71%、65.21%,差异有统计学意义(χ2=18.612,P<0.01)。所有诊断类型发病后当天、1周、2周、3周、4周和5周及5周以上呼吸道标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率依次为43.51%、23.98%、22.82%、12.17%、14.46%、13.21%,在确诊病例中的阳性率依次为89.03%、86.57%、52.30%、17.53%、17.69%和24.14%。结论实时荧光RT-PCR方法检测SARS-CoV-2核酸是最有效的早期病原学诊断方式,COVID-19发病后1周内核酸检出率最高,核酸检出时间最晚是发病后38 d。
简介:摘要目的探究荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果。方法选取自2009年1月至2009年12月在我省流感病例900例,采用实时荧光定量PCR对流感病毒核酸进行检测,观察检测阳性率和阳性样本的类型。结果2009年1~12月流行期采集流感样病例900例,流感病毒核酸检测呈阳性247例,阳性率为27.44%;其中,甲型H1N1共215例,甲型H3流感12例,甲通20例。结论荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸科学有效,能够满足临床对流感病毒核酸快速、准确检测的需要,对其结果进行质量控制,能够最大限度保证结果的准确性,可临床进一步推广。
简介:摘要目的建立一种实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增(reverse transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)技术检测寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)的方法,以实现ZIKV的现场快速筛查及诊断。方法通过基因组序列比对,选择ZIKV保守序列设计RT-RAA特异性引物和探针,并用系列稀释的ZIKV重组质粒与毒株核酸验证方法的灵敏性与重复性,通过检测登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等其他虫媒病毒验证方法的特异性。结果建立的RT-RAA方法可在39 ℃恒温条件下30 min内对ZIKV进行高效扩增,检测系列稀释的ZIKV重组质粒,其95%检测限可达到15拷贝/反应,特异性强,与登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒虫媒病毒无交叉反应,且重复性好。结论本研究建立的ZIKV的RT-RAA等温扩增方法,具有反应迅速,无需精密仪器,操作简单等优点,适合于应急快速检测。
简介:摘要:目的:研究恒温核酸扩增在下呼吸道病原菌感染中应用价值,为临床诊治提供依据。方法:收集2023年10月-2024年4月1501例疑似下呼吸道感染患者痰标本,采用微流控恒温扩增芯片法分析病原菌种类及分布情况。结果:恒温核酸扩增芯片法共检出病原菌747例,检出率49.77%,分离培养生化法共检出病原菌482例,检出率32.11%,差异具有统计学意义(P<0. 001)。在各科室中,其中儿科、呼吸科及重症医学科感染下呼吸道感染患者最多。儿科患者感染前5位病原菌分别为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林葡萄加强、肺炎克雷伯菌,呼吸科患者感染前5位病原菌分别为流感嗜血杆菌、耐甲氧西林葡萄球菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌,重症医学科患者感染前5位病原菌分别为耐甲氧西林葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、嗜麦芽窄食单胞菌、鲍曼不动杆菌。结论:恒温核酸扩增芯片法用于呼吸道感染性病原菌的检测高效、便捷,为临床明确病原菌种类和及时诊疗提供了依据。
简介:摘要目的采用环介导恒温扩增技术建立快速检测儿童呼吸道合胞病毒的方法。方法收集福建省立医院2011—2012年儿科疑似急性呼吸道感染患儿的呼吸道分泌物标本137份,同时采用环介导恒温扩增技术(LAMP)和荧光定量PCR技术检测儿童呼吸道分泌物中呼吸道合胞病毒特异性RNA,分析两者的灵敏性和特异性。结果LAMP法在恒温条件下进行,特异性好,其灵敏度和可靠性与荧光定量PCR方法相当。结论LAMP方法具有灵敏度高、特异性强等优点,仅需简易设备就能快速、高效、简便地对病原微生物进行鉴定,是一种快速检测呼吸道合胞病毒的新方法。