简介：据中国农科院最新消息,该院蔬菜花卉研究所蔬菜功能基因组学创新团队与国内外同行合作,发现了一个大片段DNA序列拷贝数变化可以决定黄瓜的性别。相关成果发表于最新一期国际著名学术期刊《植物细胞》。团队首席、中国农科院蔬菜花卉所研究员、深圳农业基因组所副所长黄三文介绍,大片段DNA序列的结构变异（StructuralVariation,简称SV）包括插入/缺失、拷贝数变化和倒位等多种类型,可引起许多人类疾病（如自闭症和精神分裂症）的发生;

简介：请你随便写一个4位数，要求4个数码不能完全相同。（1）首先，把数字按照从大到小的顺序依次放到千位，百位，十位和个位上，得到一个数。

简介：摘要冠心病是一种由遗传和环境因素共同作用所致的复杂性疾病，是全球范围内致死、致残的首要原因。前期以单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms，SNPs)为基础的全基因组相关分析（Genome-wideassociationstudy,GWAS）在冠心病遗传易感性领域取得巨大的突破，但仍不能对冠心病遗传性做出完整的解释，基因拷贝数变异（copynumbervariations,CNVs）逐渐引起学者重视。本文将对近期冠心病CNVs研究所取得的重要进展进行综述，简要分析仍存在的不足及发展趋势，为进一步研究冠心病遗传机制提供线索。

简介：摘要婴儿痉挛症(ISs)是一种年龄相关的癫痫性脑病，与认知障碍、孤独症谱系障碍及精神运动发育迟缓高度相关。目前已发现多种遗传方式，如染色体异常、拷贝数变异(CNVs)、单基因病等均可导致ISs，其中CNVs或结构性染色体重排在ISs的发病机制中起重要作用。现就CNVs与ISs的研究进展进行综述，以期为深入研究ISs发病的分子机制和遗传基础提供参考。

简介：罗氏NimbleGen已与韩国疾病控制与预防中心（KCDC）和Macrogen，Inc．公司签署合作协议，将共同实施一项针对韩国人的为期8个月的高密度CNV研究。该研究分为两个阶段，包括对韩国人口的大规模CNV特征描述，并对包括糖尿病在内的复杂疾病的基因相关研究中常见的CNV进行分析。

简介：目的：探讨结直肠癌（CRC）术后复发患者的线粒体DNA（mtDNA）拷贝数异常与临床病理指标的关系。方法：选取50例术后复发CRC患者及50例初发CRC患者肿瘤、癌旁组织及外周血标本,分别提取基因组DNA,进而计算出mtDNA拷贝数;然后与临床及病理指标相比较分析。结果：无论是复发CRC患者还是初发CRC患者,肿瘤组织内mtDNA拷贝数均明显低于癌旁组织（P〈0.05）,同时其外周血中mtDNA拷贝数明显低于正常健康人（P〈0.05）;mtDNA拷贝数高低与复发CRC患者肿瘤的分化程度及淋巴结转移率密切相关（P〈0.05）,而与性别、年龄、肿瘤浸润深度及远处转移无相关性（P〉0.05）。结论：线粒体DNA拷贝数的降低与复发CRC发生、发展和复发密切相关。

简介：摘要宫颈癌是女性生殖系统最常见恶性肿瘤，是由宿主遗传因素与环境因素相互作用的结果，严重威胁女性生命健康。高危人乳头瘤病毒(HPV)持续感染是宫颈癌的主要致病因素，然而单纯高危HPV感染不足以致癌，宿主遗传特性改变，才能导致宫颈癌的发生。拷贝数变异(CNV)是基因组结构变异，导致基因拷贝数异常的形式之一，包括基因扩增和缺失等。基因CNV可广泛影响致癌基因及抑癌基因表达，从而导致下游信号通路激活与失活，在宫颈癌发生、发展、防治及预后评价中具有至关重要的作用。笔者拟就与宫颈癌密切相关的常见基因CNV的研究现状进行阐述。

简介：摘要胎儿拷贝数变异(CNV)是指长度>1 kb的DNA片段的拷贝数增加或者减少，也包括亚显微水平的染色体片段缺失和重复。CNV所导致的胎儿疾病，被统称为微缺失/微重复综合征(MMS)。通过染色体微阵列分析(CMA)或者CNV测序等技术，可以准确、快速检测出CNV、染色体数目异常，以及嵌合比例≥30%嵌合体，可使MMS检出率相较于染色体核型分析提高1.0%～1.7%。由于在胎儿期多数疾病尚无明显和特征性的影像学异常表现，对胎儿致病性CNV(pCNV)进行判断及其遗传咨询，成为目前产前诊断领域的难点。对于胎儿pCNV判断原则包括：①不能仅凭借CNV片段长度判断pCNV，还需要结合其所处位置、所包含基因突变数量、所包含基因是否具有剂量效应进行评估，一般应进一步检测亲代染色体核型、亲代CNV和结合亲代临床表型等综合评估；②片段长度<1 Mb且亲代中携带相同CNV的胎儿CNV致病作用有限，而对于≥1 Mb的新发突变CNV，则意味着其致病风险更高；③同等大小CNV比较时，缺失型CNV的临床影响比重复型更大。可借助ClinGen网站CNV评分系统，快速判断胎儿pCNV，若CNV评分≥0.99，则判定为pCNV；评分为0.9～0.98，则为疑似pCNV(LpCNV)；评分为-0.89～0.89，则为临床意义未明(VUS) CNV；评分为-0.98～-0.9，则为疑似良性(LB) CNV；评分≤-0.99，则为良性CNV。正常人群中广泛存在着良性CNV，部分pCNV的临床表现可能并不严重，仅当确诊胎儿具有可导致死亡或严重出生缺陷的pCNV时，临床应建议孕妇及时终止妊娠，防止重大出生缺陷患儿出生。

简介：摘要致病性拷贝数变异(pathogenic copy number variation，pCNV)所导致的基因组病，是出生缺陷的一类重要遗传学病因。目前用于检测CNV的技术主要包括染色体微阵列分析以及基于二代测序技术的拷贝数变异测序。近年来，CNV检测技术在产前诊断领域得到了广泛的应用。为规范这类技术的临床应用，我们制订了将CNV检测应用于产前诊断的指南，内容主要包括开展CNV分析进行产前诊断的基本要求、适用范围、临床检测及咨询流程、检测技术流程等，以更好地为患者服务。

简介：摘要目的探讨线粒体DNA（mtDNA）拷贝数与卵母细胞受精结局的关系。方法收集未受精MII期卵母细胞及废弃胚胎，采用Real-timePCR方法定量检测，比较不同受精结局卵母细胞及废弃胚胎mtDNA拷贝数的差异。结果未受精卵母细胞mtDNA拷贝数平均为118466±60538；正常受精（2PN）胚胎mtDNA拷贝数为346743±171601；异常受精（1PN及多PN）胚胎mtDNA拷贝数为256000±78699，三组之间比较均有统计学差异(F=26.63，P<0.05)。结论mtDNA含量是评价卵母细胞质量的重要指标之一。卵母细胞中mtDNA拷贝数可能与受精结局息息相关，卵母细胞受精失败和异常受精可能均与mtDNA拷贝数减少有关。

简介：摘要目的探讨儿童EB病毒（EBV）原发性感染血浆病毒DNA拷贝数特征及其变化规律。方法回顾性病例总结。选择2017年9月1日至2018年9月30日于复旦大学附属儿科医院诊断为EBV原发性感染的571例患儿为研究对象，收集患儿病毒实验室指标及临床信息等资料。根据血浆EBV DNA结果分为阳性组和阴性组，根据EBV DNA载量将阳性组分为高载量组和低载量组。组间差异采用χ2检验、Wilcoxon秩和检验进行比较。结果571例EBV原发性感染患儿中男334例、女237例，初诊年龄3.8（2.2，5.7）岁。阳性组255例（44.7%）、阴性组316例（55.3%）。阳性组发热、肝和（或）脾肿大、转氨酶升高的患儿比例均高于阴性组［235例（92.2%）比255例（80.7%）、169例（66.3%）比85例（26.9%）、144例（56.5%）比120例（38.0%），χ2=15.22、96.80、18.27，均P<0.001］；阳性组中有70例进行了随访，随访时间46（27，106）d，其中68例（97.1%）患儿在28 d内转阴，另2例（2.9%）患儿随访修正诊断为慢性活动性EBV感染。血浆病毒低载量组218例、高载量组37例。高载量组转氨酶升高患儿占比高于低载量组［75.7%（28/37）比56.0%（116/207），χ2=5.00，P=0.025］。外周血白细胞中EBV DNA的阳性率及拷贝数均高于血浆中EBV DNA［84.2%（266/316）比44.7%（255/571）、7.0×107（1.3×107，3.0×108）比3.1×106（1.6×106，6.1×106）拷贝/L，χ2=76.26、Z=15.23，均P<0.001］。结论免疫功能正常EBV原发性感染患儿中，血浆病毒DNA阳性患儿易有发热、肝和（或）脾肿大、转氨酶升高的临床表现。阳性血浆EBV DNA一般在初诊后28 d内转阴，多数血浆病毒高载量患儿有转氨酶升高特征。

简介：摘要目的探讨外周血线粒体DNA拷贝数（mtDNAcn）与肝癌发生风险的关联。方法以东风-同济队列2008年基线调查纳入的27 009名东风汽车公司退休职工为基础，剔除基线DNA缺失、现患恶性肿瘤、失访的人群后，以5%的比例按年龄、性别分层随机抽取子队列人群1 173名，同时选取随访至2018年12月31日队列中发现的全部新发肝癌患者（共154例，其中4例已入选子队列）共同组成肝癌的病例队列。采用实时定量PCR法检测病例队列人群基线外周血mtDNAcn水平。采用限制性立方样条模型和加权Cox比例风险模型评估mtDNAcn与肝癌发病风险的关联。结果本研究最终纳入研究对象1 323例。研究对象的中位随访时间为10.3年。限制性立方样条显示，外周血mtDNAcn与肝癌发生风险之间呈“U”型关联（P非线性<0.001）。将研究对象按子队列人群mtDNAcn的四分位数进行分组，调整年龄、性别、受教育程度、吸烟、饮酒、锻炼、体重指数和慢性肝炎史发现，与Q2亚组人群相比，Q1亚组（HR=2.00，95%CI：1.08~3.70）和Q4亚组（HR=4.11，95%CI：2.32~7.26）人群肝癌的发生风险均显著增加，未发现Q3亚组人群肝癌发生风险显著增加（HR=1.05，95%CI：0.54~2.05）。年龄、性别、吸烟、饮酒、慢性肝炎史与mtDNAcn在影响肝癌的发病风险上无交互作用（P交互>0.05）。结论基线外周血mtDNAcn水平过高或过低均可增加肝癌发生风险，其作用通路有待更多机制研究进一步阐明。

简介：在第六届＂中国胎儿医学大会＂上,来自香港中文大学妇产科系的蔡光伟教授就＂拷贝数变异在产前唇腭裂中的作用：多心队列研究＂这一问题向我们分享了他们在诊断胎儿唇腭裂方面的临床经验。蔡光伟教授指出,每700例活产儿中就有1例是唇腭裂,其中70%是非综合征型,30%是综合征型,并分析了染色体微阵列分析（CMA）在传统染色体分析中的优势。

简介：无

简介：摘要目的通过对产前诊断致病性拷贝数变异（copy number variation，CNV）的病例进行遗传背景及妊娠结局分析，探讨致病性CNV的产前处理方案。方法回顾分析2015年1月至2020年12月在广州市妇女儿童医疗中心接受介入性产前诊断并采用染色体微阵列分析（chromosome microarray analysis，CMA）技术进行检测的病例，收集CMA结果提示为致病性CNV并经夫妇验证的病例，对其产前诊断指征、致病性片段的染色体分布、片段大小等进行分析，并对所有产妇进行电话随访及病历追踪。采用t检验对数据进行统计分析。结果研究期间，共有56例产前诊断为致病性CNV且夫妇双方均进行验证的病例，其中13例（23.2%）致病性CNV遗传自夫妇之一，遗传自母亲8例、父亲5例；余43例均为新发突变。13例遗传性的致病性片段分别定位于22号（3/13）、17号（3/11）、16号（2/7）、1号（2/4）及X染色体（3/6），且所有片段大小均<3 Mb。遗传自父母的CNV片段小于新发突变病例［1.69 Mb（1.36~2.22 Mb）与7.54 Mb（2.11~12.30 Mb），t=3.47，P=0.001］。43例新发突变病例中，7例（16.3%）失访，1例孕37周提示16p11.2微重复，大小0.58 Mb，孕39周阴道分娩，新生儿出生体重2 900 g，至今已8月龄，电话随访未诉异常，余35例（97.2%）均放弃妊娠。13例遗传自父母的病例中，2例失访，6例放弃妊娠，5例继续妊娠分娩后，随访中位年龄为13个月（4~15个月），均未见异常。结论在产前诊断中，致病性CNV不能作为放弃妊娠的唯一依据。

简介：摘要先天性心脏病（简称先心病）的病因及发病机制尚未完全明确。随着微阵列比较基因组杂交技术及二代测序技术的开展，在先心病患儿中检出越来越多的拷贝数变异，并在细胞及动物水平得到致病性验证。本文综述先心病拷贝数变异的研究现状、常见拷贝数变异的心脏表型和遗传学特征以及拷贝数变异在先心病发病中的可能机制。

简介：摘要目的分析神经发育障碍患儿致病性拷贝数变异(pCNVs)的微缺失和微重复特征与患儿临床表型特点，明确神经发育障碍患儿遗传学病因。方法收集2017年1月至2019年11月安徽医科大学第一附属医院以全面性发育落后、智力障碍等神经发育障碍疾病就诊的患儿，应用全基因组拷贝数变异(CNVs)检测明确存在的pCNVs，总结分析患儿临床表型与pCNVs特点。结果31例患儿存在36处pCNVs，其中微缺失片段24个(占66.67%)，微重复片段12个(占33.33%)，片段大小320.00 kb～93.26 Mb，平均11.33Mb。pCNVs易发生在15号染色体，为9例患儿9处(占25.00%)，其次是8号染色体，3例患儿5处(占13.89%)，X染色体，3例患儿4处(占11.11%)。临床表现有运动发育落后的患儿30例(占96.77%)，智力障碍22例(占70.97%)，语言发育落后22例(占70.97%)，伴畸形患儿11例(占35.48%)，特殊面容11例(占35.48%)及癫痫8例(25.81%)，且多种落后与多系统的异常同时存在。结论对不明原因的神经发育障碍患儿，可应用全基因组CNV方法进行检测，明确其遗传学病因；对pCNVs及所包含的功能基因的分析，可揭示神经发育障碍的遗传学发病机制。

简介：摘要目的分析22q11.2不同区域拷贝数变异病例的产前超声表型、拷贝数变异的亲代来源及妊娠结局，并分析基因型-表型的对应关系。方法收集染色体微阵列分析提示为单纯22q11.2区域拷贝数变异的25例产前病例(13例为22q11.2拷贝数缺失，12例为22q11.2拷贝数重复)，分析其产前表型，运用多重连接探针扩增技术对拷贝数变异进行溯源分析，并随访其妊娠结局以及出生后的生长发育情况。结果在25例22q11.2拷贝数变异的病例中，涉及TBX1基因区域拷贝数变异者的超声表型多为心血管系统异常，涉及CRKL基因区域拷贝数变异的表型多为多囊性肾发育不良，远端区域拷贝数变异(涉及SMARCB1基因)的超声表型均为神经系统异常。在25例中，12例(48%)为新发突变，5例失访，12例终止妊娠，8例已出生，其中7例生长发育正常，1例A-D区域拷贝数缺失产前超声提示心血管系统异常，新生儿心脏超声与产前一致，并出现吞咽困难、吸奶无力、生长发育迟缓等情况。结论22q11.2区域拷贝数变异的产前表型多样，与区域内基因的功能相关。颈后透明层增厚可作为22q11.2近端拷贝数变异的早期超声表型，仍需更多的研究来了解各区域拷贝数变异的性质及基因功能，从而为遗传咨询提供帮助。

简介：摘要目的探讨无创产前检测(NIPT)筛查胎儿染色体拷贝数变异(CNV)(主要为染色体微缺失/微重复)的临床价值。方法选择2019年1月至2021年10月，于山西医科大学第一医院接受NIPT，结果提示胎儿染色体缺失或重复，并接受介入性产前诊断的67例孕妇为研究对象。回顾性分析其临床病例资料。对孕妇羊水细胞进行胎儿染色体核型分析及染色体微阵列分析(CMA)，并分析NIPT发现的胎儿染色体CNV与上述介入性产前诊断结果的一致性。本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。所有孕妇对其上述检测均知情同意，并签署临床研究知情同意书。结果①于上述选择的时间段内，接受NIPT筛查的29 479例孕妇中，胎儿染色体缺失或重复为87例，筛查结果胎儿染色体CNV发生率为0.30%(87/29 479)。②介入性产前诊断的67例孕妇中，确诊胎儿染色体CNV为35例，NIPT筛查胎儿染色体CNV的阳性预测值为52.2%(35/67)；29例胎儿的CMA与NIPT筛查结果显示的胎儿染色体CNV基本一致，二者检测胎儿染色体CNV符合率为43.2%(29/67)。结论NIPT筛查胎儿染色体CNV具有可行性。对于NIPT筛查结果为胎儿染色体CNV者，应采取产前诊断方法进一步确诊。

简介：摘要目的探讨无创产前检测(non-invasive prenatal testing，NIPT)对于胎儿染色体拷贝数变异(copy number variations, CNVs)的检测价值。方法收集18 661例接受NIPT检测的孕妇的临床资料，为提示胎儿携带CNVs的孕妇提供羊水染色体核型或/及染色体微阵列分析，并分析结果的一致性。结果在全部样本中，NIPT共提示21三体58例、18三体18例、13三体19例、18/21三体1例。88例孕妇接受了介入性产前诊断，59例的染色体微阵列分析结果与NIPT一致，符合率为67.05%。NIPT还检出CNVs 37例，其中19例(微缺失15例、微重复4例)接受了介入性产前诊断，14例的验证结果与NIPT一致，符合率为73.68%。结论NIPT检测具有较高的灵敏度和准确性，对检测提示的CNVs应考虑进行介入性产前诊断，追溯其亲代起源，为临床提供指导。