简介:以氨基酸组成为特征对膜蛋白的分类,忽略了序列残基之间的相关性信息,而采用传统支持向量机算法作为分类算法,在解决多类问题时会出现分类盲区问题。针对这两种情况,计算蛋白质序列的氨基酸组成、二肽组成以及6种氨基酸相关系数,将三类特征结合,作为膜蛋白序列的特征向量;同时采用模糊支持向量机作为分类器,解决了传统支持向量机在多类数据识别中的盲区问题。测试结果表明,在相同特征输入下,模糊支持向量机分类性能优于传统支持向量机;在相同分类器的情况下,氨基酸组成、二肽组成和相关系数组合的特征选择方法的分类性能优于只使用其中一类或两类特征的方法;而采取组合特征和模糊支持向量机相结合的分类策略,在独立性数据集测试中的整体预测精度达到97%,优于现有的多种分类策略,是目前最有效的膜蛋白分类方法之一。
简介:目的:研究重度室息新生儿及新生儿铗氧铗血性脑病(HIE)血小板a-颗粒膜蛋白(GMP-140)浓度的变化。方法:采用酶联免疫法测定42例重度窒息足月新生儿和20制正常足月新生儿血小板a-颗粒膜蛋白(GMP-140)难度。结果;室息组生后第一天GMF-140浓度为42.7±17.4ng/ml,明显高于对照组,差异有非常显著意义(P<0.001)。发生中重度HIE的GMP-140浓度与无益生HIE者比较.差异有非常显著意义。结论:GMP-140浓度可间接反映血小板活化的情况。血小板活化因子在新生儿HIE中起着重要的病理生理作用。GMP-140维度与HIE关系密切。
简介:摘要目的建立一种快速方便提取大肠杆菌膜蛋白的方法。方法收集临床分离的大肠杆菌,利用TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白,Bradford法测定蛋白浓度,运用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)进行质谱分析,采用CiphergenProteinchip软件采集数据。重复测定20次大肠杆菌的混合标本,评价TritonX-114去污剂法提取大肠杆菌膜蛋白的重复性。结果TritonX-114去污剂法成功提取出了大肠杆菌膜蛋白。重复测定20次大肠杆菌的混合标本,蛋白峰的分子量变异系数均小于0.05%。结论TritonX-114去污剂法可以快速方便的提取大肠杆菌膜蛋白,并具有很好的重复性,这不仅对大肠杆菌耐药机制和治疗方法的研究起着重要作用,也为膜蛋白的快速提取提供了新的思路。