简介:摘要目的基于16SrRNA测序分析肾结石患者结石及尿液微生态结构。方法选取2016年3月至2020年3月本院收治的肾结石患者102例为研究对象,均行经皮肾镜取石术。采用16SrRNA测序技术检测结石标本和尿液标本中的微生物信息,根据结石成分将标本分为碳酸磷灰石组、草酸钙组、磷酸铵镁组、尿酸组,分析各组样本菌群的多样性和丰富度。结果结石标本中菌群门水平以变形菌门、厚壁菌门、放线菌门为主,科水平以肠杆菌科、黄单胞菌科、假单胞菌科为主,属水平以寡养单胞菌属、假单胞菌属、短波单胞菌属为主;变形菌门是四组结石标本中的优势菌门(>55%),磷酸铵镁组中放线菌门和无壁菌门是仅次于变形菌门的优势菌(>8%),碳酸磷灰石组、草酸钙组中厚壁菌门和放线菌门是仅次于变形菌门的优势菌(>8%),尿酸组中拟杆菌门和放线菌门是仅次于变形菌门的优势菌(>5%);在属水平中,磷酸铵镁组中的优势菌是奇异变形杆菌、寡养单胞菌属、棒状杆菌属,碳酸磷灰石组是假单胞菌属、寡养单胞菌属、金黄杆菌属,草酸钙组是假单胞菌属、寡养单胞菌属、短波单胞菌属,尿酸组是寡养单胞菌属、假单胞菌属、金黄杆菌属。尿液标本中菌群门水平以变形菌门、厚壁菌门、无壁菌门为优势菌(>13%),属水平以假单胞菌属、支原体属、克雷伯氏菌属为优势菌(>8%);结石标本和尿液标本α多样性指标比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论肾结石患者结石标本中寡养单胞菌、金黄杆菌和短波单胞菌含量较高,而尿液中则以假单胞菌属、支原体菌属、乳酸杆菌属为优势菌。
简介:测定了相手蟹属(Sesarma)红螯相手蟹(S.haematocheir)和褶痕相手蟹(S.plicata)线粒体16SrRNA基因部分片段的序列,二者的序列长度相同,均为533bp,且A、T、G、C的含量相似,分别为198bp(37.1%),206bp(38.6%),84bp(15.8%),45bp(8.4%)和200bp(37.5%),205bp(38.5%),81bp(15.2%),47bp(8.8%);二者的序列有49处差异,其中21个位点为转换、22个位点为颠换和6个缺失/插入位点。进一步对20种相手蟹属蟹类的长度为361bp的16SrRNA基因同源序列进行分析,发现AT的含量为78.6%~82.9%,明显高于GC的含量,且存有91个变异位点。从NJ树和遗传距离来看,在分布于中国的3种相手蟹中,无齿相手型(S.dehaani)和红螯相手蟹的亲缘关系最近(d=0.0151),而它们与褶痕相手蟹的亲缘关系则较远(d=0.0924/0.09231。分布于中国的相手蟹和分布于北美的相手蟹之间存在着较大的遗传距离(差异),表明它们之间有着较远的亲缘关系,互为单系起源。
简介:目的了解大连2所医院临床分离革兰阴性菌中介导高水平氨基糖苷类抗生素耐药的16SrRNA甲基化酶基因armA、rmtB的流行情况,并研究其耐药机制。方法收集临床分离的耐阿米卡星的革兰阴性杆菌134株。PCR法筛选2种甲基化酶基因armA及rmtB;PCR产物进行测序。质粒提取、接合试验及转化试验确定armA及rmtB基因定位。琼脂稀释法测定阳性菌株、结合子和转化产物对阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素3种氨基糖苷抗生素的MIC值。结果134株耐药菌株中,21株鲍曼不动杆菌检出armA基因,5株大肠埃希菌和5株肺炎克雷伯菌检出rmtB基因。质粒抽提试验及接合试验rmtB阳性菌获得成功。接合子及转化产物DH5a(pMDarmA)均获得高水平耐氨基糖苷类抗生素的特性。结论大连2所医院检测到16SrRNA甲基化酶基因armA和rmtB阳性菌株。armA基因存在于鲍曼不动杆菌中;rmtB基因位于大肠埃希菌及肺炎克雷伯菌的质粒上。armA和rmtB可以导致细菌对氨基糖苷类抗生素的高水平耐药。
简介:【背景】米尔顿姬小蜂是一种入侵我国台湾地区的植食性小蜂,能够严重影响水果的产量和食用价值。目前在我国大陆没有分布,由于其个体微小,与近似种区别较小,通过传统的形态学分类方法难以鉴定,因此有必要研究其基因片段序列,探讨分子鉴定方法。【方法】利用PCR方法扩增并测定了米尔顿姬小蜂线粒体16SrRNA和COI基因的部分序列,并对各序列的碱基组成进行了分析。然后根据COI基因部分序列,利用DNAMAN的MaximumLikelihood方法构建了米尔顿姬小蜂与膜翅目其他科的系统发育树。【结果】16SrRNA基因的PCR扩增产物为426bp,COI基因的PCR扩增产物为488bp。通过测序获得米尔顿姬小蜂16SrRNA和COI基因部分序列,序列分析表明,16SrRNA和COI基因的A+T含量均较高,存在较强的A+T偏向性。系统发育树显示,米尔顿姬小蜂与蚜小蜂科的Encarsiaberlesei亲缘关系最近,与姬小蜂科的Chrysocharisnautius、C.eurynota亲缘关系较远。【结论与意义】本研究为米尔顿姬小蜂的分子鉴定提供了依据。
简介:目的了解医院分离的多重耐药鲍曼不动杆菌16SrRNA甲基化酶基因分布情况,为临床合理应用抗菌药物提供依据。方法采用Phoenix100微生物全自动鉴定系统进行菌株鉴定及药敏试验;采用PCR方法检测armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD基因。结果46株鲍曼不动杆菌中armA基因阳性36株,阳性率78.3%,未检出rmtA、rmtB、rmtC、rmtD基因。药敏试验结果显示医院分离的多重耐药鲍曼不动杆菌对多黏菌素全部敏感,对四环素、阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素、甲氧苄啶-磺胺甲唑耐药率分别为13.0%、80.4%、91.3%、95.7%、95.7%,对其他测试药物耐药率100%。结论医院分离鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类抗菌药物耐药性已非常严重,携带armA基因是导致氨基糖苷类耐药的原因之一,延缓鲍曼不动杆菌多重耐药性已刻不容缓。
简介:目的了解食源性变形杆菌的氨基糖苷类耐药基因情况。方法收集2011—2014年石家庄市售各类食品中分离到的对阿米卡星和庆大霉素至少有一种耐药的变形杆菌124株,用PCR、测序和基因库在线比对方法分析6种氨基糖苷类修饰酶基因与3种16SrRNA甲基化酶基因。结果124株变形杆菌中氨基糖苷类修饰酶耐药基因aacC2、aacA4、aadA1和aphA6的检出率分别为95.2%(118/124)、80.6%(100/124)、73.4%(91/124)和5.6%(7/124);16SrRNA甲基化酶耐药基因rmtB检出率为87.1%(108/124)。aacC1、aadB、armA和rmtC基因均未检出。结论aacC2型氨基糖苷类修饰酶基因与rmtB型16SrRNA甲基化酶基因流行是食源性变形杆菌对氨基糖苷类抗生素耐药的重要原因。
简介:目的探讨应用聚合酶链反应(PCR)检测慢性非细菌性前列腺炎(CPPS)患者前列腺液中细菌16SrRNA基因,并常规检查患者前列腺液中白细胞的数目,与CPPS患者的临床治疗效果做相关性分析。方法以细菌16SrRNA基因为靶序列,设计引物及寡核苷酸探针,采用PCR法检测标准菌株及135例CPPS患者前列腺液中细菌16SrRNA基因,结合患者前列腺液中白细胞的数目进行对比分析。结果135例CPPS患者中细菌16SrRNA基因检测结果阳性为78例,阳性率为57.78%。细菌16SrRNA基因阳性组患者经抗生素治疗的有效率84.6%,阴性组有效率52.6%;细菌16SrRNA基因阳性组患者疗效明显优于阴性组。按白细胞数分组疗效比较,不同组间疗效没有差异。结论大部分CPPS患者的前列腺液中可以检测到细菌16SrRNA基因,提示细菌感染在CPPS的发病中有重要作用。但是,其前列腺液中白细胞数目对CPPS患者判断病情、估计预后无统计学意义。
简介:目的了解6种编码16SrRNA甲基化酶的基因在氨基糖苷类抗生素耐药革兰阴性菌中的流行情况。方法收集本院2007年10~12月分离的211株阿米卡星和庆大霉素耐药革兰阴性菌,采用PCR检测其中6种甲基化酶基因(armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD和npmA)的分布。对16SrRNA甲基化酶基因阳性的菌株,用ERIC-PCR进行同源性分析。结果211株阿米卡星和庆大霉素耐药革兰阴性菌中,91.5%(193/211)被检出16SrRNA甲基化酶基因,其中133株含armA(133/211,63.0%),60株含rmtB(60/211,28.4%)。阿米卡星MIC≥512mg/L、庆大霉素MIC≥128mg/L的104株肠杆菌科细菌中,甲基化酶基因检出达100%,且armA和rmtB的检出相仿(分别为49与55株)。阿米卡星MIC≥512mg/L、庆大霉素MIC≥128mg/L的94株铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌中,甲基化酶检出94.7%(89株),以armA(84株)为主。未检测到rmtA,rmtC,rmtD和npmA基因。ERIC-PCR结果显示该类基因并非单克隆传播。结论几乎所有临床分离的阿米卡星MIC〉512mg/L的革兰阴性菌中都能检出armA或rmtB基因。
简介:1七月的一天,帕梅拉接到了个奇怪的电话。先是一个男人问道:“请问是帕梅拉·德布斯吗?”在得到了肯定回答后,那个男人说:“你等等,有人要和你讲话。”接着电话那端传来一个女孩细细的声音:“奥莉,是你吗?”帕梅拉的心猛然一震,这个世界上只有一个人叫她“奥莉”,她禁不住惊呼:“老天!你是谁?”女孩嘤嘤地啜泣着,轻轻说道:“奥莉,我好想你。”“尼娜?!你是尼娜吗?”帕梅拉不敢置信地大叫道。这时那个男人接过了电话,他声音有些沉重地说:“对不起,德布斯女士。刚刚和你讲话的是小女普丽西达,最近她出现了一些异常,不断说起一些奇怪的人和奇怪的事,她提到了您,并说是您的妹妹……”
简介:Weexperimentallydemonstratea16×16reconfigurablynonblockingopticalswitchfabricusingaBenesarchitecture.Theswitchfabricconsistsof562×2Mach–Zehnderinterferometerbasedelementaryswitches,witheachintegratedwithapairofwaveguidemicroheaters.Theaverageon-chipinsertionlossis~5.2dBforbothofthe'all-cross'andthe'all-bar'states,withalossvariationof1dBoverallroutingpaths.Thecrosstalkforallswitchingstatesisbetterthan-30dB.Theswitchingtimeoftheswitchelementisabout22μs.Theswitchingfunctionalityisverifiedbytransmissionofa40Gb∕squadraturephase-shiftkeyingopticalsignal.
简介:以EM223-16/16-DC.RLY模块元件级的维修实例,阐述了此模块的工作机制,并且通过抄板,将完整的电路图绘制下来,以便各位同行相互学习和交流。
简介:Objective:ToinvestigatetheexpressionofHPV16mRNAinnormalhumankeratinocytestransfectedwithpSV2-neo/16.Firsthumankeratinocyteswereculturedintheserum-freemediumM154.Second,theplasmidpSV2-neo/16wastransfectedintothehumankeratinocytesusingatransfectingreagent.Third,RT-PCRandSouthernBlottingwereusedtodetecttheexpressionofHPV16mRNAandDNAinthetransfectedkeratinocytes,respectively.Results:TheexpressionofHPV16mRNAwassuccessfullyamplifiedandan110bpwasditectedbyRT-PCR.A7.9kbfragmentwasconfirmedinthetransfectedkeratinocytesbySouthernBlotanalysis.Conclusion:HPV16mRNAandDNAweresuccessfullydetectedinthehumankeratinocytes.