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  • 简介:摘要目的探讨新型免疫佐剂CpG-DNA的性能和初步应用。方法取BALB/c小鼠(SPF)30只为研究对象。按照随机数字表法,分为两组,分别给予HBsAg为HBsAg组与HBsAg+CpG-DNA为HBsAg+CpG-DNA组,每组15只。CpG-DNA与抗原取混合后,对小鼠进行皮下、背部注射。于加强免疫一周进行细胞毒T细胞功能检测。结果在强化免疫后,HBsAg组显著升高(P<0.05)。结论CPG-DNA对HBsAg具有较强的免疫原性,可诱导机体产生较强的免疫作用,其为一种潜能较大的免疫佐剂。

  • 标签: 新型免疫佐剂 CpG-DNA HBsAg
  • 简介:目的:脓毒症是感染因素介导的全身炎症反应综合征,至今无有效的治疗手段。细菌Cp6DNA是引起脓毒症的主要病原分子。CpGDNA通过与TLR9结合,介导单核/巨噬细胞的活化,是介导脓毒症发生的重要途径。本研究以CpGDNA为靶点,从中药中定向分离具有拮抗CpGDNA和治疗脓毒症作用的活性物质。方法:(1)应用生物传感器技术、建立以CpGDNA为靶点的筛选抗炎中药的技术平台并对78种中药进行筛选;(2)利用生物传感器技术、硅胶柱层析、离子交换柱层析技术,从大黄中定向分离与CDGDNA具有较高结合活性的组分,并对得到的组分进行初步的活性评价,确定活性组分;(3)在体外实验中,测定活性组分与CpGDNA、lipidA的结合能力,观察活性组分对LPS、CpGDNA刺激小鼠RAW264.7细胞分泌炎症介质的抑制作用,在体内实验中,观察活性组分对致死剂量热灭活大肠杆菌攻击小鼠的保护作用。(4)利用反相HPLC技术对活性组分进行制备分离,获得活性单体化合物;(5)在体外实验中,检测单体化合物与CpGDNA和lipidA的结合能力.观察化合物对LPS、CpGDNA刺激小鼠RAW264.7细胞分泌炎症介质的抑制作用。结果:(1)建立了以CpGDNA为靶点应用生物传感器筛选抗炎中药的技术平台;从78种中药中筛选出大黄等14种中药与CpGDNA具有较高结合能力;(2)利用生物传感器技术、硅胶柱层析、离子交换柱层析等技术从大黄水提物中定向分离得到与CpGDNA有较高结合活性大黄D组分;(3)在体外,大黄D组分与CpGDNA、LipidA均具有较高的结合活性,对CpGDNA及LPS刺激小鼠RAW264.7细胞分泌TNF-α有显著的抑制活性,并呈现良好的量一效关系。在体内,大黄D组分对致死剂量的热灭活大肠杆菌攻击小鼠有显著的保护作用,并呈现良好的量-效关系;(4)通过反相HPLC从D组分中分离得到单体

  • 标签: CPGDNA 大黄水提物 分离制备 活性物质 抗CpG RAW264.7
  • 简介:Toll样受体在对抗外来病原微生物的天然免疫应答中发挥中心作用.新发现的一种分子识别模型受体Toll样受体-9(TLR9),能特异性识别CpGDNA并起动信号转导级联反应,在不同种类中的TLR9具有对序列识别的特异性.本文概述国外在TLR9识别作用机制和生物学活性研究中已取得的进展,并提出了今后研究的发展方向.

  • 标签: TOLL样受体-9 CPG DNA 识别 信号传到级联反应
  • 简介:TounderstandtheDNA-methylationmediatedgenesilencingmechanisms,weanalyzedincellcultureofthepromoterfunctionoftheMAGE-A1gene,whichisfrequentlydemethylatedandover-expressedinhumanhepatocellularcarcinoma.WehaveestablishedthecorrelationoftheDNAmethylationofthepromoterCpGislandwithexpressionstatusofthisgeneinapaneloftheestablishedlivercancercelllines.ThecrucialCpGdinucleotide(s)withintheminimalpromotersubjectedtothecontrolmediatedbyDNAmethylationwithprofoundbiologicalfunctionswasalsodelineated.Furthermore,anovelsequence-specificDNA-proteininteractionatthe-30CpGdinucleotideupstreamofthegenewasfoundhavingavitalparttoplayintheDNAmethylationmediatedtranscriptionsilencingoftheMAGE-A1gene.OurresultswouldnotonlyprovidenewinsightsintotheDNAmethylationmediatedmechanismsovertranscriptionoftheMAGE-A1gene,butalsopavethewayforfurtherdefiningthecross-talkamongDNAmethylation,histonemodificationandchromatinremodelingindetail.

  • 标签: 二核苷酸 甲基化 转录 基因沉默 蛋白质 脱氧核糖核酸
  • 简介:Toll样受体家族的TLR9(Toll—LikeReceptor9)是巨噬细胞识别CpGDNA的模式识别受体,它可通过激活单核/吞噬细胞系统信号转导,活化NF—κB、AP-1,从而大量释放TNF-α、IL-1、IL-6和IL.12等多种前炎症细胞因子,引起急性炎症反应、脓毒症甚至休克、死亡。TLR9是Ⅰ型跨膜蛋白质,分为胞外区、跨膜区和胞内区三部分。TLR9胞外区由25个富含亮氨酸的重复序列(leucine—richrepeats,Lmrs)组成,与识别CpGDNA有关。其中的LRR2、5、8、ll序列后跟随有插入氨基酸序列,可能是与CpGDNA的结合位点或参与结合CpGDNA。但是,迄今为止,TLR9是如何识别CpGDNA、其识别位点在何处还不清楚,更不清楚TLR9识别CpGDNA的分子机制。因此,明确TLR9与CpGDNA的结合位点对阐明CpGDNA介导炎症的发生机制,并将其作为可能的新的药物靶点进行疾病防治具有重要意义。为此,在前期偶然发现转染TLR9胞外段LRRs能够抑制宿主菌生长现象的基础上,设计一系列实验,通过细菌生长抑制实验、细胞因子释放抑制实验和亲和力的测定,基本确定能够与CpGDNA高亲和力结合的TLR9胞外段LRR,在TLR9胞外段各个LRR中,LRRll是最有可能与cpGDNA结合的位点。

  • 标签: TOLL样受体家族 CPGDNA 功能片段 模式识别受体 生长抑制实验 前炎症细胞因子
  • 简介:摘要目的探讨HBsAg阳性母亲C基因型HBV DNA CpG岛的类型、长度、CG位点等的分布特点及其与HBV宫内传播的关系,为HBV宫内传播机制研究提供新视角。方法连续收集2011年6月至2013年7月太原市第三人民医院妇产科住院分娩的HBsAg阳性母亲及其新生儿,通过面对面问卷调查及电子病历收集流行病学资料,采用电化学发光法和荧光定量PCR分别检测母亲及新生儿HBV血清学标志物及血清HBV DNA。以新生儿出生24 h内乙型肝炎(乙肝)疫苗/乙肝免疫球蛋白注射前股静脉血HBsAg和/或HBV DNA阳性判定为HBV宫内传播。将HBV宫内传播者中HBV DNA载量≥106 IU/ml(满足克隆测序要求)的22例母亲及其新生儿作为宫内传播组,从未发生宫内传播者中随机选取HBV DNA载量≥106 IU/ml的22例作为对照组,以HBV DNA测序分型结果为C基因型的39例母亲进行HBV DNA CpG岛分布预测等分析。结果39例HBV C基因型的母亲中,宫内传播组19例,对照组20例。39例C基因型者HBV DNA均含有传统CpG岛Ⅱ、岛Ⅲ,而对照组中有传统CpG岛Ⅰ以及新型CpG岛Ⅳ、岛Ⅴ;HBV宫内传播组和对照组母亲携带的HBV DNA CpG岛Ⅱ、岛Ⅲ长度和CpG岛Ⅱ CG位点个数分布不同,差异有统计学意义(P<0.05),HBV宫内传播组中CpG岛Ⅱ长度≥518 bp且其CG位点个数≥40个(11/19)的比例明显高于对照组(2/20),差异有统计学意义(P<0.05);位于X基因启动子区的CpG岛Ⅱ长度和CG位点个数大于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。HBV宫内传播组中大部分母亲(12/19)携带的HBV DNA CpG岛Ⅱ完全覆盖了Xp区,明显多于对照组(5/20),且其HBV DNA Xp区CG位点个数大于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HBsAg阳性母亲C基因型HBV DNA CpG岛分布与宫内传播有关,CpG岛Ⅱ长度长、CG位点个数多可能会增加HBV宫内传播的发生风险。

  • 标签: 乙型肝炎病毒 C基因型 CpG岛 宫内传播
  • 简介:隐马尔科夫过程是20世纪70年代提出来的一种统计方法,以前主要用于语音识别,1989年Churchill将其引入计算生物学,目前HMM是生物信息学中应用比较广泛的统计方法。本文对马尔科夫过程和HMM进行了简明扼要的描述,并对其在CpG岛位置判别中的应用做了概括介绍。

  • 标签: 马尔科夫链 HMM CPG岛
  • 简介:摘要目的探讨骨髓基质细胞抗原2(BST2)基因在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达水平及其与DNA甲基化水平和患者预后的关系。方法共纳入3组GBM样本[美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库(35例)、基因表达综合(GEO)数据库中GSE22891队列(50例)、中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库(105例)]及非肿瘤对照脑组织(NTB)(TCGA数据库10例、GSE22891队列6例、CGGA数据库5例用于基因表达水平比较,GSE63347队列25例、GSE22891队列4例以及CGGA数据库8例用于甲基化数据比较)。利用公共数据库中GBM基因表达芯片和DNA甲基化芯片数据,通过GBM与NTB间BST2基因表达水平比较、生存分析、生物信息学分析等,获得BST2基因在GBM中的表达状态以及其与非CpGDNA甲基化、GBM分子亚型[CpG岛甲基化表型(G-CIMP),非G-CIMP的前神经元型、神经元型、经典型和间质型]、患者总生存(OS)时间以及功能基因表达谱之间的关系。结果与NTB样本比较,BST2 mRNA在GBM中呈高表达状态(mRNA表达数据采用Z-score标准化)(TCGA数据库比GSE63347队列:-0.97±1.14比-2.32±0.21,t=3.74,P<0.05;GSE22891队列:9.03±1.28比7.18±0.22,t=3.42,P<0.05;CGGA数据库:-0.43±1.11比-0.62±0.35,t=2.09,P<0.05)。TCGA数据库中,BST2 mRNA在不同肿瘤分子亚型中均高表达(G-CIMP为-1.96±0.94,非G-CIMP的前神经元型为-1.74±0.88,神经元型为-0.83±0.98,经典型为-0.71±1.18,间质型为-0.55±1.01),与NTB样本(-2.32±0.21)比较,差异均有统计学意义(均P<0.05);BST2 mRNA在神经元型、经典型及间质型肿瘤之间表达差异均无统计学意义(均P>0.05),但均高于G-CIMP和非G-CIMP的前神经元型(均P<0.05)。BST2非CpGDNA甲基化水平与其mRNA表达负相关(TCGA数据库:r=-0.30,P<0.05;GSE22891队列:r=-0.54,P<0.05;CGGA数据库:r=-0.29,P>0.05)。生存分析表明,非G-CIMP且非前神经元型患者的BST2 mRNA表达水平与OS呈负相关(HR=1.18,95% CI 1.00~1.39,P<0.05),而在G-CIMP及前神经元型的亚组中,BST2 mRNA表达与患者OS无相关性(HR=1.08,95% CI 0.84~1.40,P>0.05)。生物信息学分析表明,在TCGA数据库非G-CIMP且非前神经元型的样本中,高表达BST2的GBM样本显著富集于与免疫反应负性调控和核因子κB(NF-κB)通路激活相关的功能基因簇。结论BST2基因在GBM中表达上调,可能与非CpGDNA低甲基化改变有关;该基因可能成为评估非G-CIMP且非前神经元型GBM亚型临床预后的潜在生物标志物。

  • 标签: 胶质母细胞瘤 膜糖蛋白类 DNA甲基化 分子分型 骨髓基质细胞抗原2
  • 简介:摘要目的探讨多巴胺受体D2(DRD2)基因启动子区CpGDNA甲基化水平与持续性姿势-知觉性头晕(PPPD)发病的关系。方法对自2017年1月至6月在烟台市烟台山医院神经内科确诊的43例PPPD患者(试验组)于收治时采集血样,对同期收治的未予选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)类或5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂(SNRI)类药物治疗的、且随访3个月以上头晕症状未再发而排除PPPD诊断的45例急性前庭外周性眩晕患者(对照组)于随访时采集血样,应用重亚硫酸盐测序法进行DRD2基因启动子区CpG岛甲基化水平的检测并比较2组间的差异。结果试验组DRD2基因启动子区CpG岛的甲基化阳性率(58.1%)明显高于对照组(15.6%),CpG岛位点甲基化率(0.15±0.18)明显高于对照组(0.04±0.10),差异均有统计学意义(P< 0.05)。结论PPPD发病可能与患者DRD2基因启动子区CpGDNA甲基化水平增高有关。

  • 标签: 持续性姿势-知觉性头晕 多巴胺受体D2基因 DNA甲基化 CpG岛
  • 简介:VertebrategenomesarecharacterizedwithCpGdeficiency,particularlyforGC-poorregions.TheGCcontent-relatedCpGdeficiencyisprobablycausedbycontext-dependentdeaminationofmethylatedCpGsites.ThishypothesiswasexaminedinthisstudybycomparingnucleotidefrequenciesatCpGflankingpo-sitionsamonginvertebrateandvertebrategenomes.Thefindingisatransitionofnucleotidepreferenceof5'Tto5'Aattheinvertebrate-vertebrateboundary,indi-catingthatalargenumberofCpGsiteswith5TsweredepletedbecauseofglobalDNAmethylationdevelopedinvertebrates.Atgenomelevel,weinvestigatedCpGobserved/expected(obs/exp)valuesin500bpfragments,andfoundthathigherCpGobs/expvalueisshowninGC-poorregionsofinvertebrategenomes(exceptseaurchin)butinGC-richsequencesofvertebrategenomes.WenextcomparedGCcontentatCpGflankingpositionswithgenomicaverage,showingthattheGCcontentislowerthantheaverageininvertebrategenomes,buthigherthanthatinvertebrategenomes.Theseresultsindicatethatalthough5'Tand5'AaredifferentininducingdeaminationofmethylatedCpGsites,GCcontentisevenmoreimportantinaffectingthedeaminationrate.Inallthetests,theresultsofseaurchinaresimilartovertebratesperhapsduetoitsfractionalDNAmethylation.CpGdeficiencyisthereforesuggestedtobemainlyaresultofhighmutationratesofmethylatedCpGsitesinGC-poorregions.

  • 标签: DNA甲基化 无脊椎动物 比较基因组 CPG基序 GC含量 网站
  • 简介:Oligodeoxynucleotides(ODN)containingunmethylatedCpGdinucleotidesincontextsofuniquesequence(CpGmotifs)isactiveasadjuvantininductionofcellularandhumoralimmuneresponsesinyoungmice.Todate,thereareonlylimitedreportsabouteffectofCpGODNonimmuneresponsesagainsthepatitisB(HB)infectioninagedmice.Ourstudiesdemonstratedthereweresignificantincreasesinsecretingoftotalanti-HBIgG,IgG1andIgG2a,aswellasofIL-12andIFN-γ,whenCpGODNswereinjectedtogetherwithhepatitisBantigeninagedmice.Moreover,CpGODNcouldstimulateproliferationofspleenlymphocytesinadose-dependentmanner.Takentogether,theresultsweobtainedindicatethattheaddingofCpGODNintothevaccineantigenmightbeusefulindevelopmentofmoreeffectivevaccinationforinducinganti-HBvirusresponsesintheelderly.

  • 标签: 老鼠 乙肝疫苗 免疫增强作用 CPG 免疫学
  • 简介:无论是高贵优雅的气质淑女,还是青春逼人的靓丽少女,皮草衣都能轻松满足你的需求,打造属于你的个人风格。皮草衣奢华、高贵的属性,致使根根皮草就像分子般进行着扩散运动,时时飘散出独特出众的女性魅力。

  • 标签: DNA 潮流 个人风格 扩散运动 女性魅力 皮草
  • 简介:<正>陈老师是女老师,有点胖,戴副眼镜,唐山人。初二时,新开历史课,她教我们历史。中国历史开课不久,讲到类人猿,给我印象最深。不是我尤其喜欢类人猿,而是因为陈老师的口音。

  • 标签: 历史课 陈老师 唐山人 女老师 DNA 我自己
  • 简介:AventadorLP700-4还是延续了Lamborghini的一贯设计风格,显得粗犷而霸气,浑身充满了如蛮牛般的力量。而从整体感觉上,我们也能从其身上看到Murcielago、Renventon以及SestoElementoConcept的影子。

  • 标签: MURCIELAGO DNA 传承 设计风格 整体感
  • 简介:乔皮奇体质不好,老是感冒发烧。“太影响学习了,”乔皮奇生自己的气,“如果我能不生病就好了!”

  • 标签:
  • 简介:<正>2006年NBA选秀大会已经尘埃落定一个多月了,然而还是有一些东西值得我们津津乐道地去分析一番,这其中当然免不了大家关注的外籍军团。自从2002年以来,5年里NBA诞生了姚明、博古特、巴格纳尼三位外籍状元,毫无疑问,NBA选秀的国际化已经成为不可阻挡的历史洪流。而有些可惜的是,我们在第二轮仍然无法看到中国球员唐正东的名字。尽管大唐本人一直为他的NBA之梦而不懈地努力,然而残酷的竞争却让我们不得不去尊重这一个事实。或许在明年或者后年的选秀会上,中国球员会有更多的表演空间,因为届时我们将会看到易建联、孙悦这样的身影。

  • 标签: 巴格纳尼 博古特 易建联 状元秀 孙悦 唐正东
  • 简介:Objective:Hepatocellularcarcinoma(HCC)isacommonmalignancyassociatedwithhighmorbidityandmortalityratesworldwide.EarlydiagnosisplaysanimportantroleintheimprovementofHCCprognosis.Methods:Inthisstudy,weconductedacomprehensiveanalysisofHCCDNAmethylationandgeneexpressiondatasetsinTheCancerGenomeAtlas(TCGA),toidentifyaprognosticsignatureforHCCdiagnosisandsurvivalprediction.First,weidentifieddifferentialmethylationCpG(dmCpG)sitesinHCCsamplesandcomparedthemwiththoseinadjacentnormallivertissues;thiswasfollowedbyunivariateanalysisandSureIndependenceScreening(SIS)inthetrainingset.Therobustnessoftheidentifiedprognosticsignaturewasevaluatedusingthetestingset.ToexplorethebiologicalprocessesinvolvedinHCCprogression,wealsoperformedfunctionalenrichmentanalysisforoverlappinggenesbetweengenescontainingdmCpGsites(DMGs)anddifferentialexpressiongenes(DEGs)inHCCpatients,usingdatafromtheDatabaseforAnnotation,Visualization,andIntegratedDiscovery(DAVID).Results:Asaresult,weidentifiedfiveCpGsitesthatweresignificantlyassociatedwithHCCsurvivalthroughunivariateanalysisandSIS.Univariateanalysisofclinicalcharacteristicsidentifiedageandriskfactors(includingalcoholconsumptionandsmoking)asindependentfactorsthatindicatedHCCsurvival.Multivariateanalysisindicatedthattheintegratedprognosticsignature(weightedcombinationofthefiveCpGsites)thattookageandriskfactorsintoconsiderationresultedinmoreaccuratesurvivalprediction.Conclusions:ThisstudyprovidesanovelsignatureforpredictingHCCsurvival,andshouldbehelpfulforearlyHCCdiagnosisandpersonalizedtreatment.

  • 标签: HEPATOCELLULAR carcinoma METHYLATION PROGNOSIS PROGNOSTIC SIGNATURE