简介:摘要目的探索SOX13基因来源的环状RNA hsa_circ_0004777的特征分析及功能预测。方法探究了hsa_circ_0004777的基本特征,包括验证反向剪接位点,RNase R消化实验,细胞内RNA的胞质胞核分布,蛋白翻译潜能的预测。此外,使用生物信息学方法,预测hsa_circ_0004777结合的微小RNA(microRNA,miRNA)以及miRNA的靶基因,并且构建了circRNA-miRNA-mRNA的网络图。再对预测到的miRNA的靶基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和信号通路富集分析。结果hsa_circ_0004777的形成是由SOX13基因第4号外显子反向剪接至第2号外显子,hsa_circ_0004777能抵抗RNase R处理,主要分布在细胞质。生信预测hsa_circ_0004777通过作为hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-637、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-145-5p、hsa-miR-384、hsa-miR-660-5p、hsa-miR-942-5p、hsa-miR-331-3p这8个miRNA的海绵来发挥作用;hsa_circ_0004777潜在结合的8个miRNA的靶基因在对聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、DNA模板、骨骼肌细胞分化等生物过程显著富集。结论成功探索了SOX13基因来源的环状RNA hsa_circ_0004777的特征,并且从circRNA-miRNA-mRNA网络图中预测了它的功能,为进一步研究hsa_circ_0004777奠定了基础,也为更深入研究SOX13提供了思路。
简介:摘要目的探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) SOX21-AS1及SOX21在宫颈癌中的表达及其临床意义。方法收集宫颈脱落细胞学标本共43例,其中正常23例,宫颈癌20例。采用实时定量聚合酶链反应( real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测所有标本中SOX21-AS1及SOX21的表达水平,分析SOX21-AS1及SOX21的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征的关系及其对宫颈癌的诊断价值。结果宫颈癌组SOX21-AS1和SOX21的表达水平均显著高于正常对照组,差异有统计学意义(P=0.000)。相关分析显示,SOX21-AS1与SOX21的表达量呈显著正相关(P=0.000)。SOX21-AS1与SOX21的lncRNA表达量均随年龄增大、FIGO分期增高、出现淋巴结转移及浸润深度增加而增高,其中SOX21-AS1表达量与淋巴结转移及FIGO分期增高关系最密切(P=0.001;P=0.025);SOX21表达量与FIGO分期增高关系密切(P=0.027)。与之相反,SOX21-AS1随组织学分级增高表达下降,组间差异有统计学意义(P=0.008)。受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析SOX21-AS1及SOX21表达在宫颈癌中诊断价值,结果显示:二者曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.911(95%CI:0.826~0.996)和0.946(95%CI:0.879~1.000)(P=0.000);敏感性分别为70%和95%,特异性分别为100%和87%。结论SOX21-AS1及SOX21在宫颈癌中异常高表达,对宫颈癌具有一定的诊断价值,有望成为宫颈癌诊疗新的生物标志物。
简介:摘要 作为化学学科一大独有的特色标志,化学方程式既是化学教学的重头戏也是化学教学的拦路虎。一方面,化学方程式是化学教学中的一个重要部分,化学中化学反应的表示、反应原理的解释以及物质的化学性质说明都离不开化学方程式,它是学生学好化学形成正确的科学思想和积极的学习态度的重要基础;另一方面,同时亦是化学教学中的难点之一,学生往往在学习化学方程式时采用死记硬背的方法,加之不能清楚地理解化学方程式所要表达出来的微观结构蕴意,使得初三学生在初接触化学学科时困难重重,学习兴趣降低,对接下来的化学学习造成了负面的影响。本文主要采用文献法和个案研究法,通过阅读大量的参考文献,阐述化学方程式的含义,强调化学方程式的基础性和重要性;在此基础上,学习与分析有关化学方程式的教学案例,从中领悟总结出适合中学生学习化学方程式的方法。
简介:EvolutionaryevidencesuggeststhatSox3,amemberofthehigh-mobility-group(HMG)familyoftranscriptionfactors,isanancestralprecursorofSryandisinvolvedinsexdeterminationsimilartoSry.However,thereislimitedinformationregardingtheSOX3geneoftheblackrockfish(Sebastesschlegeli).Inthisstudy,wefirstisolatedSOX3genefromthegonadsofS.schlegelibyhomologycloning.Thefull-lengthofS.schlegeliSOX3(SsSOX3)cDNAwas1386bp,comprisinga906-bpopenreadingframe,whichencodesapeptideshowing93.6%and93.9%homologywiththeSox3proteinsofEpinepheluscoioidesandOryziaslatipe,respectively.ComparisonofthecDNAsequenceoftheSsSOX3genewiththecorrespondinggenomicDNAfragmentrevealedthattheSsSOX3geneconsistsofasingleexon.PhylogeneticanalysisdemonstratedtheevolutionaryrelationshipofSsSOX3withotherknownSOXB1genesinfishandtetrapods.ThepromoterregioncontainsbindingsitesofseveraltranscriptionalfactorsthatmightparticipateintheregulationofSsSOX3expression.Quantitativereal-timePCRanalysisindicatedthatSsSOX3wasexpressedinalltheinvestigatedlarvaldevelopmentalstagesfrom1to35daysafterbirthandthelevelofexpressiongraduallydecreasedasthedevelopmentproceeded.SsSOX3exhibitedsexuallydimorphicexpressioninadultgonads,withhighexpressionintheovarybutlowexpressioninthetestis.InsituhybridizationrevealedthatSsSOX3wasstronglyexpressedinoocytesandfollicularcellsofovariesbutslightlyexpressedingermcellsoftesticulartissues.Therefore,thisstudysuggeststhatSsSOX3playsanimportantroleinoogenesisandovarydifferentiationinS.schlegeli.
简介:[摘 要] 目的 将小鼠Sox2基因、穿膜肽TAT以及小分子泛素样修饰蛋白SUMO融合并转入大肠杆菌中进行表达,最终获得大量具有高效穿膜活性的Sox2蛋白。 方法 利用PCR技术扩增得SUMO-TAT融合基因,并插入到pET-3c载体。再通过扩增获得小鼠Sox2基因,将其与pET3c-SUMO-TAT基础载体连接,构建得重组表达载体pET3c-SUMO-TAT-Sox2,然后转化到Rosseta(DE3)表达菌中,经IPTG诱导表达,使用Ni-NTA亲和层析进行分离纯化。 结果 成功构建了pET3c-SUMO-TAT-Sox2原核表达载体,经终浓度为1 mmol /L的IPTG诱导4 h后表达约为57kDa的融合蛋白,以包涵体形式存在,Western Blotting检测显示良好特异性,经300 mmol/L咪唑洗脱可获得纯度较高的SUMO-TAT-Sox2融合蛋白。 结论 得到大量带有穿膜肽TAT的融合蛋白Sox2,为今后利用重编程因子融合蛋白诱导体细胞重编程为iPS细胞奠定基础。