简介:摘要目的探索环状RNA(circRNA)circ_0000517是否通过miR-1258/高迁移率族蛋白1(high-mobility group box 1,HMGB1)调节胃癌细胞的增殖、周期和迁移。方法选取2018年1月至2019年10月于中国人民解放军总医院接受手术的胃癌患者37例,收集37对胃癌组织标本和相邻的正常组织标本(癌旁组织)。实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和Western blot法分别检测胃癌组织中circ_0000517、miR-1258和HMGB1蛋白表达。在胃癌HGC-27细胞中转染si-NC(si-NC组)、si-circ_0000517(si-circ_0000517组)、miR-NC(miR-NC组)、miR-1258模拟物(miR-1258组)、anti-miR-NC(anti-miR-NC组)、anti-miR-1258(anti-miR-1258组)、si-circ_0000517+anti-miR-1258(si-circ_0000517+anti-miR-1258组),另将未转染的HGC-27细胞设为对照组(Con组)。应用细胞计数试剂盒8(cell counting Kit-8,CCK-8)法、集落形成实验和流式细胞术测定HGC-27细胞增殖、周期变化,划痕实验和Transwell实验测定HGC-27细胞迁移变化。荧光素酶活性检测分析circ_0000517和miR-1258、miR-1258和HMGB1的靶向结合。结果胃癌组织中circ_0000517和HMGB1蛋白的表达水平高于癌旁组织,miR-1258表达水平低于癌旁组织,差异有统计学意义[(4.33±0.16)比(0.98±0.12),(0.67±0.05)比(0.12±0.01),(0.25±0.05)比(0.97±0.15),t值分别为101.89、65.61和27.70,P值均<0.05]。在胃癌HGC-27细胞中沉默circ_0000517后,与Con组或si-NC组相比较,si-circ_0000517组circ_0000517和HMGB1蛋白表达水平明显降低,miR-1258表达水平及G0-G1期细胞比例明显升高,差异具有统计学意义(F值分别为2370.38,141.50,2497.63和26.32,P值均<0.05);si-circ_0000517组S期细胞比例、细胞活性和集落形成数均低于Con组或si-NC组,差异有统计学意义(F值分别为123.72、92.75和600.68,P值均<0.05)。沉默circ_0000517后,si-circ_0000517组HGC-27细胞的划痕愈合率比Con组或si-NC组减少了约51.69%或53.36%,迁移细胞数比Con组或si-NC组降低了约58.29%或57.89%。circ_0000517、miR-1258和HMGB1互补序列及荧光素酶活性检测显示,miR-1258组WT-circ_0000517及WT-HMGB1的荧光素酶活性均明显低于miR-NC组[(0.35±0.02)比(0.99±0.09),(0.16±0.01)比(1.01±0.09),t值分别为20.83和28.16, P值均<0.05]。miR-1258过表达后,miR-1258组miR-1258的表达及G0-G1期细胞比例高于Con组或miR-NC组,差异有统计学意义(F值分别为2221.87和15.61,P值均<0.05);HGC-27细胞的HMGB1蛋白表达、S期细胞比例、细胞活性、集落形成数、划痕愈合率和迁移细胞数低于Con组或miR-NC组,差异具有统计学意义(F值分别为42.56、73.32、28.50、229.72、88.34和407.64,P值均<0.05)。在胃癌HGC-27细胞中抑制miR-1258后,anti-miR-1258组miR-1258的表达水平低于Con组或anti-miR-NC组(F=757.24,P<0.05); si-circ_0000517+anti-miR-1258组HMGB1蛋白表达、S期细胞比例、细胞活性、集落形成数、划痕愈合率和迁移细胞数均高于si-circ_0000517组,G0-G1期细胞比例低于si-circ_0000517组,差异有统计学意义(F值分别为145.04、343.39、145.74、892.23、151.58、430.73和66.58,P值均<0.05)。结论沉默circ_0000517通过靶向miR-1258下调HMGB1,抑制胃癌细胞增殖和迁移,并阻滞细胞周期。
简介:摘要目的通过检测分析胃癌细胞中circ_0009910表达,初步探讨其在胃癌细胞中的作用机制。方法用qRT-PCR检测胃癌细胞系BGC823、SGC7901、AGS、MGC803、MKN45中的circ_0009910表达水平,在BGC823、AGS细胞中采用circ_0009910 siRNA转染敲降circ_0009910,验证转染效果;在circ_0009910敲降的BGC823、AGS细胞中,用MTT法检测细胞增殖、平板法检测集落形成、Transwell检测迁移和侵袭、western-blotting检测上皮间质转化(EMT),采用SPSS 18.0软件进行统计学分析。结果BGC823、SGC7901、AGS、MGC803、MKN45中的circ_0009910相对表达水平为(7.238±0.895)、(5.023±0.786)、(4.184±0.356)、(8.561±1.026)、(3.478±0.301),较正常胃癌显著升高(P<0.01),siRNA转染敲降circ_0009910后,BGC823、AGS细胞活力、集落形成数目、迁移和侵袭能力与对照组相比均明显降低(P<0.01),N-cadherin、Snail蛋白的相对表达降低,而E-cadherin表达增加。结论circ_0009910在胃癌细胞中高表达,可促进胃癌细胞增殖、集落形成、迁移和侵袭及EMT。
简介:无
简介:摘要目的探讨circ_0000253作为骨肉瘤(osteosarcoma,OS)诊断和预后生物标志物的价值。方法GEO数据库筛选OS中差异表达的circRNAs,预测和circRNA存在结合位点的微小RNA(MicroRNA,miRNA)进一步构建ceRNA网络,GO和KEGG分析筛选靶基因。qRT-PCR检测112例OS患者癌组织和癌旁组织、OS细胞及正常成骨细胞中circ_0000253、miR-578及TGFβ2的表达水平。分析circ_0000253对OS的诊断价值及其对预后的影响,探讨circ_0000253表达水平与患者临床病理参数的关系。进一步干预细胞中circ_0000253和miR-578的表达,流式细胞术检测细胞凋亡,MTT实验检测细胞增殖活力。结果OS组织中circ_0000253表达水平显著高于癌旁组织(t=11.17, P<0.001)。circ_0000253表达与Enneking分期和组织分级和远处转移显著相关(均P<0.05)。circ_0000253可作为OS的一个有效诊断指标(AUC=0.84,P<0.001)且高表达circ_0000253的患者预后较差。Circ_0000253可能通过miR-578/TGFβ2网络对OS进行调控。敲减circ_0000253能降低细胞增殖活力,诱导细胞凋亡,而该作用能被miR-578 inhibitor部分挽救(均P<0.05)。结论circ_0000253可作为OS的新的诊断和预后生物标志物,对OS的靶向治疗也有积极意义。
简介:摘要目的探讨胃癌患者血清hsa_circ_0000437表达水平及其临床价值。方法选取2018年10月至2020年12月南通大学附属医院经病理确诊的80例胃癌患者(男57例,女23例);50例胃良性疾病患者(男28例,女22例)及80名健康对照者(男46例,女34例)。收集血清样本,同时收集上述胃癌患者中35例患者手术后血清样本。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测血清hsa_circ_0000437表达水平。采用Mann-Whitney U检验比较不同组间、胃癌患者不同分期及手术前后血清hsa_circ_0000437水平的差异,采用χ²检验分析胃癌患者血清hsa_circ_0000437水平与其临床病理特征之间的相关性。化学发光法检测癌胚抗原(CEA)、糖类抗原199(CA199)、糖类抗原724(CA724)。运用受试者工作特征(ROC)曲线及其曲线下面积(AUC)评估hsa_circ_0000437、CEA、CA199以及CA724的诊断效能。Kaplan-Meier生存曲线分析hsa_circ_0000437表达水平与患者预后的关系。结果胃癌、胃良性疾病患者和健康对照者血清hsa_circ_0000437表达水平分别为2.252(1.235,4.765)、1.598(1.139,1.982)及1.000(0.818,1.385),胃癌患者高于胃良性疾病和健康对照者(P均<0.001),胃良性疾病患者高于健康对照者(P<0.001)。胃癌患者术后血清hsa_circ_0000437的表达水平低于手术前(P<0.001)。胃癌患者血清hsa_circ_0000437的表达水平在肿瘤T分期、N分期、肿瘤分化程度差异均有统计学意义(P=0.043、P=0.025和P=0.013)。胃癌患者区别于健康对照者,hsa_circ_0000437、CEA、CA199和CA724 AUC分别为0.863、0.619、657和0.608,4项指标联合检测AUC为0.892,敏感度高达97.5%(78/80)。Kaplan-Meier生存曲线显示血清hsa_circ_0000437高表达患者的总体生存率明显低于血清hsa_circ_0000437低表达患者(P=0.008)。结论hsa_circ_0000437可能是胃癌辅助诊断和预后判断的一个生物学指标。
简介:摘要目的观察骨肉瘤组织和细胞株中环状RNA circ_0000880表达,及其对骨肉瘤细胞增殖的影响。方法选取经病理确诊的骨肉瘤的标本共16例,采用circRNA高通量测序技术检测表达差异的circRNA。提取骨肉瘤及其癌旁组织总RNA,依据circ_0000880序列,设计divergent primer,扩增包含backsplice junction区域片段,随后连接入pGM-T载体进行测序鉴定。采用SYBR Green荧光定量PCR,分别检测骨肉瘤及其癌旁组织,骨肉瘤细胞MG63、SAOS-2、U2OS及正常人成骨细胞hFOB1.19中circ_0000880的表达水平。将circ_0000880小干扰RNA(siRNA)和circ_0000880 NC慢病毒转染至骨肉瘤细胞后检测细胞中circ_0000880的表达水平,并通过细胞计数试剂盒(CCK-8)及克隆形成实验检测对骨肉瘤细胞增殖的影响。两样本两组间比较用t检验。结果采用circRNA高通量测序技术检测结果显示骨肉瘤组织及细胞中circ_0000880的表达显著上调,并通过测序鉴定证实circ_0000880在骨肉瘤组织中存在、且为环状RNA。反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)结果显示circ_0000880在骨肉瘤组织中的表达量(2.032±0.165)显著高于其癌旁组织(1.105±0.155,t=16.393,P<0.05)。circ_000088在骨肉瘤细胞系MG63(2.252±0.140)、SAOS-2(2.134±0.176)、U2OS(2.011±0.226)中表达量均显著高于正常人成骨细胞(1.000±0.092,F=71.299,P<0.05)。转染circ_0000880 siRNA的MG63细胞中circ_0000880表达量明显下降(0.646±0.058),转染circ_0000880 NC的MG63细胞中circ_0000880表达水平(1.005±0.121)与空白组(1.000±0.201)比较差异无统计学意义(F=17.977,P<0.05)。CCK-8及克隆形成试验结果显示,与空白组和阴性对照组比较,转染circ_0000880 siRNA的骨肉瘤细胞增殖能力显著受到抑制。结论骨肉瘤组织及细胞中circ_0000880表达显著上调,敲低circ_0000880表达可显著抑制骨肉瘤细胞的增殖能力。
简介:摘要目的探讨血浆外泌体环状RNA(circRNA)hsa_circ_0022417在胃癌中的表达及其临床意义。方法选取临床明确诊断胃癌初诊患者60例,慢性胃炎患者30例(疾病对照组)和同期健康体检者30名(健康对照组),分别检测各组血浆外泌体中hsa_circ_0022417的表达水平以及血清CEA、CA19-9的表达。采用ROC曲线评价各项指标诊断胃癌效能。分析血浆外泌体hsa_circ_0022417的表达与胃癌患者临床病理参数的关系。结果胃癌组血浆外泌体hsa_circ_0022417的相对表达水平高于慢性胃炎组和健康对照组,差异有统计学意义[(1.89±0.15)比(0.93±0.08)比(0.75±0.07),F=9.96,P<0.05]。胃癌组织中hsa_circ_0022417的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义[(2.78±0.24)比(1.18±0.11),t=6.08,P<0.05],并且其表达水平与血浆外泌体表达水平呈正相关(r=0.72,P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血浆外泌体hsa_circ_0022417、血清CEA、CA19-9单指标诊断胃癌的曲线下面积分别为0.79、0.68和0.66,3种指标联合检测诊断胃癌的曲线下面积为0.86。血浆外泌体hsa_circ_0022417的相对表达量与肿瘤大小(χ2=6.42,P<0.05)、分化程度(χ2=5.83,P<0.05)、临床分期(χ2=7.14,P<0.01)及淋巴结转移(χ2=5.17,P<0.05)均有关。结论外泌体hsa_circ_0022417在胃癌患者血浆中高表达,对临床胃癌辅助诊断和早期筛查具有重要意义。
简介:摘要目的探讨circ_0000267对胃癌细胞体外增殖、迁移、侵袭、凋亡及体内生长的影响。方法体外构建敲低circ_0000267和过表达miR-661的胃癌细胞株,采用qRT-PCR检测胃癌组织和细胞中circ_0000267、miR-661和NGAL mRNA表达,采用克隆形成、Transwell小室和流式细胞仪实验检测细胞增殖、迁移、侵袭及凋亡,Western blot检测相关蛋白表达,通过在线预测结合双荧光素酶实验和RNA pull down实验验证circ_0000267、miR-661和NGAL之间的靶向关系,裸鼠成瘤实验观察敲除circ_0000267对胃癌细胞体内生长的影响。结果circ_0000267在胃癌组织和细胞中高表达;敲低circ_0000267能够抑制胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭,促进细胞凋亡;circ_0000267靶向miR-661,抑制miR-661能够部分逆转敲低circ_0000267对胃癌细胞的影响;NGAL是miR-661的靶基因,过表达miR-661通过抑制NGAL调控胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭及凋亡;敲低circ_0000267靶向miR-661抑制胃癌细胞中NGAL的表达;敲低circ_0000267抑制胃癌细胞的体内生长。结论circ_0000267可能通过调控miR-661/NGAL的表达调控胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭及凋亡,并抑制肿瘤在体内生长。
简介:摘要目的评估血浆外泌体源环状RNA(circRNA)hsa_circ_0064910在胃癌中的诊断效能,分析其与胃癌患者临床病理特征的相关性。方法回顾性研究,纳入2019年10月至2020年12月在河南大学第一附属医院入院治疗的60例胃癌患者,30例慢性胃炎患者(疾病对照组)以及同期健康体检的30名健康者(健康对照组)作为研究对象。收集胃癌患者的一般资料,包括肿瘤大小、分化程度、TNM 分期、有无淋巴结转移等。临床治疗前收集患者血液标本,逆转录聚合酶链反应分别检测3组对象血浆外泌体中hsa_circ_0064910的表达水平,电化学发光法检测同一研究对象血清CEA、CA19-9的表达水平。利用受试者工作特征(ROC)曲线评价hsa_circ_0064910单独诊断及其与CEA、CA19-9联合检测在胃癌患者中的诊断效能。同时分析血浆外泌体hsa_circ_0064910在胃癌患者术前术后的表达差异,以及与胃癌患者临床病理特征的关系。结果胃癌患者血浆外泌体中hsa_circ_0064910的相对表达水平(0.97±0.12)高于慢性胃炎患者(0.47±0.06)(t =2.97,P<0.001)及健康对照组(0.43±0.05)(t =3.23,P<0.001)。ROC曲线分析显示hsa_circ_0064910单指标诊断胃癌的曲线下面积(AUC)为0.778,联合CEA、CA19-9指标诊断胃癌的曲线下面积(AUC)为0.841,高于CEA(AUC=0.673)、CA19-9(AUC=0.653)单指标及联合检测的诊断效能。临床资料分析表明血浆外泌体hsa_circ_0064910的相对表达量与肿瘤大小(χ²=7.545,P<0.01)、临床分期(χ²=4.571,P<0.05)及淋巴结转移(χ²=6.907,P<0.01)等密切相关。胃癌患者术后血浆外泌体hsa_circ_0064910的相对表达量明显下降(1.21±0.21比0.62±0.11,t =2.463,P<0.01)。结论外泌体源hsa_circ_0064910在术前胃癌患者血浆中相对表达量较高,有望成为胃癌筛查新型无创分子标志物。
简介:摘要目的探讨circ LARP4在肝癌组织中表达水平及其对肝癌细胞增殖、周期和侵袭的影响及其分子机制。方法选取2019年1月到2022年1月我院手术切除的71例肝癌组织和对应的癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肝癌组织和癌旁组织circ LARP4表达水平。分别采用circ LARP4短发卡RNA(shRNA)和circ LARP4过表达慢病毒感染Huh7细胞,构建对照组和circ LARP4组细胞系。分别采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和异体移植瘤检测细胞增殖能力;采用流式细胞术测定细胞的周期变化;采用Transwell测定细胞的侵袭能力;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析细胞增殖、周期和侵袭相关的蛋白表达水平。采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析circ LARP4的靶基因,采用荧光定量PCR分析circ LARP4对其靶基因表达水平的影响。结果癌旁组织中circ LARP4表达水平(1.37±0.16)明显高于肝癌组织(0.41±0.16),差异有统计学意义(t=35.110,P<0.05)。对照组细胞48 h和72 h吸光度值(1.37±0.16;2.02±0.06)明显高于circ LARP4组(0.81±0.10;1.48±0.09,差异有统计学意义(t=7.520、12.371,P<0.05)。对照组细胞在裸鼠中生长速度明显高于circ LARP4组细胞,差异有统计学意义(F=11.710,P<0.05)。对照组细胞细胞核增殖抗原(Ki-67)蛋白表达水平(1.72±0.18)明显高于circ LARP4组细胞(0.85±0.09),差异有统计学意义(t=11.920,P<0.05)。对照组细胞G0/G1期细胞比例(49.24±3.12)明显低于circ LARP4组细胞(63.07±2.26),差异有统计学意义(t=9.486,P<0.05)。对照组细胞S期细胞比例(16.35±1.59)明显低于circ LARP4组细胞(27.07±4.48),差异有统计学意义(t=5.959,P<0.05)。对照组细胞细胞周期D1(Cyclin D1)表达水平(1.35±0.09)明显高于circ LARP4组细胞(0.77±0.11),差异有统计学意义(t=11.130,P<0.05)。对照组细胞侵袭数量(142.71±23.91)明显高于circ LARP4组细胞(75.86±8.99),差异有统计学意义(t=6.927,P<0.05)。对照组细胞基质金属蛋白酶(MMP)-3表达水平(1.08±0.16)明显高于circ LARP4组细胞(0.49±0.14),差异有统计学意义(t=7.269,P<0.05)。circ LARP4与miR-367存在潜在结合能力。对照组细胞miR-367表达水平(1.28±0.15)明显高于肝癌组织(0.54±0.10),差异有统计学意义(t=35.110,P<0.05)。结论circ LARP4通过靶向miR-367,进而调节着肝癌细胞的增殖、周期和侵袭等恶性细胞生物学行为。
简介:AbstractBackground:Previous studies have demonstrated that various circular RNAs are involved in the malignant proliferation of cancers, such as liver cancer, lung cancer, breast cancer, and others. The potential role of circular RNAs in glioblastoma, however, is still uncertain. In this study, we aimed to study the potential role of hsa_circ _01844 in glioblastoma.Methods:Using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) method, hsa_circ_01844 expression was measured in five glioblastoma samples and five normal brain samples. To evaluate the potential function of hsa_circ_01844 in glioblastoma, hsa_circ_01844 was overexpressed in glioblastoma cell lines (U251 and U87 cells). Using these two cell lines, in vitro experiments including the flow cytometry assay, 3-(4, 5-dimethylthiazol-2-yl)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide assay, Transwell assay, and cell apoptosis assay were performed to investigate the role of hsa_circ_01844 in glioblastoma. Student t test and one-way analysis of variance were used for statistical analysis.Results:The expression of circular RNA hsa_circ_01844 was lower in glioblastoma tissues when compared with the normal brain tissues by RT-PCR method (0.034 ± 0.036 vs. 1.630 ± 0.891, P < 0.001). Using two glioblastoma cell lines, we found that overexpression of hsa_circ_01844 in glioblastoma cells suppressed their proliferation, colony formation, migration, and increased the apoptotic rate compared with empty vector group and blank control group (all P < 0.05).Conclusion:Hsa_circ_01844 shows decreased expression in glioblastoma and its overexpression induces apoptosis and inhibits proliferation, migration, and invasion of glioblastoma cells.
简介:摘要目的探讨hsa_circ_0005982在结直肠癌中的表达及功能。方法60对结直肠癌及癌旁组织标本取自2016年9月至2018年2月期间在首都医科大学附属北京朝阳医院接受手术治疗的60例结直肠癌患者,利用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测人结直肠癌组织中hsa_circ_0005982的表达水平,并分析其与患者临床病理特征的相关性。利用受试者工作特征(ROC)曲线评价hsa_circ_0005982的诊断价值。转染小干扰RNA(siRNA)敲降hsa_circ_0005982的表达水平,并进行细胞功能实验,探索hsa_circ_0005982对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。组间比较采用配对t检验。结果Hsa_circ_0005982在结直肠癌组织中显著上调,差异倍数为4.77±5.56(t=6.438,P<0.01),且其表达水平与患者性别(χ2=0.231,P>0.05)、年龄(χ2=0.020,P>0.05)、肿瘤部位(χ2=0.071,P>0.05)、肿瘤大小(χ2=1.111,P>0.05)、分化程度(χ2=0.317,P>0.05)以及肿瘤浸润深度(χ2=0.659,P>0.05)均无明显相关,但与脉管侵袭(χ2=4.019,P<0.05)、淋巴结转移(χ2=8.148,P<0.01)、远处转移(χ2=5.918,P<0.05)以及TNM分期(χ2=7.703,P<0.01)均显著相关。ROC曲线显示曲线下面积(AUC)为0.788,提示hsa_circ_0005982有望成为结直肠癌诊断生物标志物。敲降hsa_circ_0005982后结直肠癌细胞增殖能力显著下降[5 d细胞活力值:0.93±0.06比1.15±0.08,t=4.909(SW480细胞);1.08±0.06比1.31±0.07,t=6.469(HCT116细胞)] (P<0.05)。敲降hsa_circ_0005982后结直肠癌细胞迁移和侵袭能力均显著降低[迁移细胞数:(357.00±36.59)个比(856.67±41.86)个,t=11.090(SW480细胞);(314.00±46.29)个比(719.00±38.04)个,t=80.470(HCT116细胞);侵袭细胞数:(200.33±32.62)个比(644.00±39.74)个,t=22.590(SW480细胞);(263.33±33.02)个比(1125.67±38.02)个,t=41.910(HCT116细胞),P<0.05]。结论Hsa_circ_0005982在结直肠癌组织中上调,且可促进结直肠癌细胞增殖,迁移和侵袭。
简介:摘要目的观察骨肉瘤中环状RNA circ_0052012表达和沉默环状RNA circ_0052012表达对骨肉瘤细胞增殖和侵袭的影响。方法实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)方法检测2017年10月至2018年12月郑州大学第一附属医院确诊的31对骨肉瘤标本癌组织和癌旁正常组织circ_0052012表达水平。使用针对circ_0052012的小干扰RNA(siRNA)转染骨肉瘤细胞系MG63,将体外培养的MG63细胞分为空白组(未转染)、阴性对照组(转染阴性对照si-NC)和沉默组(转染si-circ)。采用细胞增殖实验和Transwell实验,检测沉默RNA circ_0052012表达对MG63细胞增殖和侵袭的影响。采用生物信息学方法预测circ_0052012与微小RNA(miRNA,miR)-7的结合位点,利用双荧光素酶报告实验、RT-qPCR技术和Pearson相关分析,验证circ_0052012对miR-7的靶向调控作用及其在骨肉瘤中表达水平的相关性。两组间数据比较采用t检验,多组间数据比较采用单因素方差分析(ANOVA)。结果骨肉瘤组织中circ_0052012的表达水平显著高于对应癌旁正常组织,差异有统计学意义(2.452±1.061比1.007±0.644,t=10.180,P<0.01),且circ_0052012表达水平与骨肉瘤TNM分期、远处转移呈明显正相关(P<0.05)。在骨肉瘤细胞系MG63中,培养24、48、72 h后,circ_0052012沉默组细胞的增殖(0.297±0.012、0.607±0.074、0.797±0.067)均明显低于空白对照组(0.407±0.035、0.820±0.070、1.287±0.050)和阴性对照组(0.383±0.012、0.853±0.064、1.240±0.092),差异有统计学意义(24 h,t=-5.154、-9.192,P<0.01;48 h,t=-3.635、-4.391,P<0.05;72 h,t=-10.170、-6.778,P<0.01)。沉默组细胞的侵袭能力(39.400±6.066)也明显低于空白对照组(132.600±8.620)和阴性对照组(126.000±10.950),差异有统计学意义(t=-19.770、-15.460,P<0.01)。双荧光素酶报告实验证实circ_0052012与miR-7靶向结合,且在骨肉瘤组织中的表达呈明显负相关(r=-0.661,P<0.05)。通过抑制miR-7,可部分逆转沉默circ_0052012对MG63细胞增殖和侵袭的抑制作用。结论在骨肉瘤细胞中,沉默circ_0052012可通过上调miR-7表达,抑制细胞的增殖和侵袭。
简介:摘要目的探索SOX13基因来源的环状RNA hsa_circ_0004777的特征分析及功能预测。方法探究了hsa_circ_0004777的基本特征,包括验证反向剪接位点,RNase R消化实验,细胞内RNA的胞质胞核分布,蛋白翻译潜能的预测。此外,使用生物信息学方法,预测hsa_circ_0004777结合的微小RNA(microRNA,miRNA)以及miRNA的靶基因,并且构建了circRNA-miRNA-mRNA的网络图。再对预测到的miRNA的靶基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集分析和信号通路富集分析。结果hsa_circ_0004777的形成是由SOX13基因第4号外显子反向剪接至第2号外显子,hsa_circ_0004777能抵抗RNase R处理,主要分布在细胞质。生信预测hsa_circ_0004777通过作为hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-637、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-145-5p、hsa-miR-384、hsa-miR-660-5p、hsa-miR-942-5p、hsa-miR-331-3p这8个miRNA的海绵来发挥作用;hsa_circ_0004777潜在结合的8个miRNA的靶基因在对聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、DNA模板、骨骼肌细胞分化等生物过程显著富集。结论成功探索了SOX13基因来源的环状RNA hsa_circ_0004777的特征,并且从circRNA-miRNA-mRNA网络图中预测了它的功能,为进一步研究hsa_circ_0004777奠定了基础,也为更深入研究SOX13提供了思路。
简介:摘要目的探讨hsa_circ_0000231在舌鳞状细胞癌(tongue squamous cell carcinoma,TSCC)发生、发展中的作用机制。方法收集2014年12月至2017年12月在南通大学附属医院和南通大学附属肿瘤医院收治并进行手术的舌癌患者60例(男32例,女28例,年龄36~84岁),唾液标本来自同时期的10例舌癌患者,以及10名健康志愿者(男5名,女5名,年龄40~75岁),3株舌癌细胞为TSCC常用工具细胞(CAL-27、Tca-8113、HN-4)。采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测60对新鲜配对TSCC组织、10对唾液标本及3株TSCC细胞系中的hsa_circ_0000231的表达;结合随访资料,分析hsa_circ_0000231相对表达量与患者临床病理特征及预后的关系。选择敲低效率最高的细胞行蛋白免疫印迹法(WB)、细胞计数试验(cell counting kit-8,CCK-8)、克隆形成、Transwell侵袭和划痕试验,研究TSCC细胞的增殖、侵袭、转移及上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的能力;使用Wnt/β-catenin通路激活剂LiCl与TSCC细胞共培养,WB检测并研究Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白的表达变化。裸鼠成瘤实验比较皮下移植瘤的生长。使用SPSS 25.0统计分析软件行数据分析,组间比较采用t检验和χ2检验。结果hsa_circ_0000231在TSCC患者组织、唾液标本及细胞系CAL-27、Tca-8113和HN-4中高表达,配对癌旁组织、健康人唾液标本及正常人类口腔黏膜细胞(human oral keratinocytes,HOK)中低表达(P值均<0.05)。单因素分析显示hsa_circ_0000231表达水平、肿瘤分化程度和T分级与TSCC患者的生存预后相关(P值均<0.05)。多因素Cox风险回归模型分析显示hsa_circ_0000231表达水平(χ2=5.77,P=0.016)和T分级(χ2=5.27,P=0.029)是TSCC患者预后不良的独立影响因子。WB显示,敲低hsa_circ_0000231表达可以显著提高CAL-27和Tca-8113细胞中EMT相关蛋白即E-钙黏蛋白的表达,并降低Snail、N-钙黏蛋白和波形蛋白的表达。与阴性对照组相比,干扰组细胞中Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白β-catenin、C-myc、Bcl-2、MMP-9和CyclinD1的表达被抑制,使用Wnt/β-catenin通路激活剂LiCl与干扰组TSCC细胞共培养后,干扰组细胞中上述蛋白的表达趋势被逆转;细胞功能学证实敲低hsa_circ_0000231表达可以显著抑制CAL-27和Tca-8113细胞增殖、侵袭和转移能力;使用LiCl逆转了hsa_circ_0000231促进CAL-27和Tca-8113细胞迁移和侵袭的能力。裸鼠成瘤实验显示使用LiCl处理过的皮下移植瘤的质量和体积明显大于hsa_circ_0000231敲低组。结论hsa_circ_0000231是TSCC的独立预后因子,hsa_circ_0000231可以通过激活Wnt/β-catenin通路促进舌癌细胞的增殖、侵袭和转移。
简介:摘要目的探讨卵巢癌(ovarian cancer,OC)中环状RNA circ_0020123表达水平,进而评估circ_0020123水平对卵巢癌的诊断价值。方法收集2016年10月至2017年3月在杭州市临平区妇幼保健院进行诊治的卵巢癌患者55例,收集血清进行高通量基因表达测序分析。采用实时荧光定量PCR技术测定卵巢癌患者和健康对照组血清中circ_0020123水平,通过绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC),评估circ_0020123水平对卵巢癌的诊断效能。通过t检验探讨circ_0020123表达与卵巢癌患者临床特征的相关性。绘制生存曲线分析卵巢癌患者血清circ_0020123水平与预后生存的关系。Western blot检测自噬相关蛋白LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ、p62表达水平。结果与健康人血清(1.00±0.25)相比,circ_0020123在卵巢癌患者血清(1.24±0.23)中表达明显上调(t=5.23,P<0.001)。ROC曲线显示circ_0020123对卵巢癌标本的检测具有较高的诊断性能(AUC=0.757 9,P<0.001)。t检验与logistics综合分析显示circ_0020123高表达明显与FIGO分期(t=5.46,P<0.001)和肿瘤大小(t=6.37,P<0.001)相关。生存资料测定显示,circ_0020123高表达组的5年总生存期明显短于circ_0020123低表达组(P=0.019)。在细胞中敲减circ_0020123能下调自噬相关蛋白LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ的表达(0.45±0.05)(t=9.31。P=0.001),且上调p62的表达(1.94±0.11)(t=12.62,P<0.001)。结论circ_0020123是一个重要的卵巢癌相关环状RNA,为卵巢癌患者提供了一个潜在的诊断、预后的生物标志物和治疗靶点。
简介:AbstractBackground:Although increasing abnormal expression of circular RNAs (circRNAs) has been revealed in various cancers, there were a small number of studies about circRNAs in gastric cancer (GC). Here, we explored the expression and function of a novel circRNA, circ_0049447, in GC.Methods:A total of 80 GC tissues and non-tumorous tissues were collected from the First Affiliated Hospital of China Medical University. And all cells were cultured with 10% fetal bovine serum and incubated at 37°C and 5% CO2. The expression of circ_0049447 was quantified by real-time polymerase chain reaction. The biological function of circ_0049447 on proliferation, migration, invasion, and epithelial-mesenchymal transition (EMT) was evaluated by cell counting kit-8 (CCK-8), colony formation assay, transwell migration and invasion assay, and Western blotting. Luciferase report assay was used to verify the direct binding between circ_0049447 and predicted microRNA (miRNA). Furthermore, a xenograft mouse model was used to validate the function of circ_0049447 in vivo.Results:We demonstrated that circ_0049447 was downregulated in GC (P < 0.001). The area under the receiver operating characteristic curve reached 0.838, while sensitivity was 82.3% and specificity was 77.2%. CCK-8 and colony formation assay showed that overexpression of circ_0049447 could inhibit the proliferation (P < 0.05). Transwell migration and invasion assay showed upregulated circ_0049447 could impede migration in GC cells (P < 0.05). In addition, overexpression of circ_0049447 could impede GC cell EMT. Upregulation of miR-324-5p in GC specimens and direct binding between miR-324-5p with circ_0049447 proven by luciferase reporter assay indicated that circ_0049447 may inhibit GC by sponging certain miRNA.Conclusion:Circ_0049447 acts as a tumor suppressor in GC through reducing proliferation, migration, invasion, and EMT, and it is a promising biomarker for diagnosis.
简介:摘要目的探讨pSS患者外周血中环状RNA(circRNA)hsa_circ_0019413的表达,以及在pSS疾病发生发展中的作用。方法对4例pSS患者和4名健康对照者的外周血的circRNA变化进行微阵列筛选。以实时定量反转录-PCR(qPCR)验证30例pSS患者和30例对照者外周血中circRNA hsa_circ_0019413的表达差异。建立受试者工作特征曲线(ROC曲线),对外周血中circRNA hsa_circ_0019413的潜在诊断价值进行了分析,并将circRNA hsa_circ_0019413的表达水平与pSS患者临床指标进行相关性分析。结果①通过微阵列分析,在2组之间差异表达437个circRNA[差异倍数(FC)≥2.0,P<0.05],其中上调circRNA 365个,下调circRNA 72个;②通过qPCR验证发现pSS患者circRNA hsa_circ_0019413表达水平高于健康对照组,2组间差异具有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析表明pSS外周血中circRNA hsa_circ_0019413具有潜在诊断价值[AUC=0.883,95%CI(0.782,0.984),P<0.01];③相关性分析显示circRNA hsa_circ_0019413的表达水平与pSS患者病情评估指数EULAR干燥综合征疾病活动度指数(ESSDAI)、ANA滴度呈正相关(r=0.721,P=0.012;r=0.625,P=0.040),而与IgG、ESR无相关性。结论外周血中的circRNA hsa_circ_0019413可能参与pSS发生发展,可能成为pSS诊断的生物标志物。
简介:摘要目的探讨下调环状RNA(circRNA)circ-BTG2与肾癌细胞增殖和迁移的相关性及其机制。方法脂质体转染阴性对照无义序列及circ-BTG2抑制剂至肾癌786-O细胞,命名为对照组和实验组。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测转染后细胞中circ-BTG2的表达。四甲基偶氮唑蓝(MTT)实验检测786-O细胞的活性。Transwell迁移实验检测786-O细胞的迁移情况。qRT-PCR和Western blotting检测Grb2协同结合蛋白2(Grb2-associated binding protein-2,GAB2)信使RNA(mRNA)的表达。结果对照组和实验组786-O细胞中circ-BTG2的表达分别为(1.70±0.20)和(0.44±0.09),实验组circ-BTG2表达被明显抑制(t=5.69,P<0.01)。与对照组相比,实验组786-O细胞增殖能力明显降低(P<0.05)。对照组和实验组的迁移细胞数分别为(94.91±15.34)个和(25.48±6.60)个,实验组迁移细胞数明显减少(t=4.16,P<0.01)。对照组和实验组786-O细胞中GAB2 mRNA的表达分别为(2.86±0.24)和(1.27±0.18),实验组GAB2 mRNA表达被明显抑制(t=5.25,P<0.01)。与对照组相比,实验组GAB2蛋白表达降低。结论下调circ-BTG2通过调控癌基因GAB2表达抑制肾癌786-O细胞的增殖和迁移。