简介:人的造血作用用控制干细胞区别的技术被评估,二维的胶化基于电气泳动的proteomics,和功能的基因组学。我们提供神经胶质成熟因素鲸鱼群妈(GMFG)是cytokine应答的蛋白质在的第一份报告导致erythropoietin并且刺激导致因素的造血的系开发的granulocyte殖民地。从全球功能的基因组学分析的结果显示GMFG拥有几个另外的特征:造血的织物特定的基因表示,与高分数的造血作用特定的抄写因素集中的一个倡导者,和有一个原始血/免疫者系统的可能的分子的coevolution。根据我们的调查结果,我们假设那GMFG是可以调停的造血特定的蛋白质人的造血的干细胞的pluripotentiality和系承诺。
简介:唯一的肽(杯)的一个概念被建议并且实现了从双人脚踏车团spectrometry(MS/MS)识别整个房间的蛋白质离子系列。唯一的肽被定义为肽,不管它的长度,那仅仅在兴趣的proteome的一蛋白质存在,尽管这肽可以在一样的蛋白质非常出现一次。集成杯,一个二拍子的圆舞整个房间的蛋白质鉴定策略被开发进一步增加识别蛋白质的信心。包括吉祥物和SEQUEST包含Saccharomycescerevisiae和蛋白质鉴定工具的40,243个MS/MS离子系列的数据集被用来说明建议概念和策略。没有实现杯,SEQUEST识别的蛋白质是吉祥物识别的那些的2.26褶层。当杯被使用时,忍受唯一的肽的蛋白质由SEQUEST鉴别那些的3.89褶层被吉祥物识别。由跨comparing识别蛋白质的二个集合,仅仅从杯导出的89普通蛋白质被发现。在识别蛋白质之间的关键差异从每个蛋白质鉴定工具采用的filterng标准被结果。根据杯和蛋白质鉴定工具认出的蛋白质的公共分类的肽的起源,所有识别蛋白质是跨compared,导致拥有分配信心的不同层次的四组蛋白质。
简介:骨头导出髓的间充质的干细胞(MSC)是为房间移植在临床的应用程序显示出一个重要潜力的pluripotent干细胞。在现在的论文,proteomic技术被用来接近与猪的骨头髓MSC联系的蛋白质侧面并且在5-azacytidine(5-aza)的效果上调查MSC蛋白质的规定。超过1,700蛋白质种类根据胶化分析与MSC被分开。与控制MSC介绍的表达式相比,有起来调整的11个蛋白质点并且26在5-aza-treated房间的蛋白质模式下面调整。21蛋白质的一个总数被MALDI-TOF-MS分析成功地识别,在哪个之中一些有趣的蛋白质,例如高山哈B-crystallin,在A2的附属建筑,和stathmin1,被报导了通过不同发信号的小径在房间增长和区别包含。我们的数据应该为MSC区别和apoptosis的未来学习是有用的。
简介:TodeterminecancerpathwayactivitiesinninetypesofprimarytumorsandNCI60celllines,weappliedaninsilicoapproachbyexamininggenesignaturesreflectiveofconsequentpathwayactivationusinggeneexpressiondata.SupervisedlearningapproachespredictedthattheRaspathwayisactivein~70%oflungadenocarci-nomasbutinactiveinmostsquamouscellcarcinomas,pulmonarycarcinoids,andsmallcelllungcarcinomas.Incontrast,theTGF-β,TNF-α,Src,Myc,E2F3,andβ-cateninpathwaysareinactiveinlungadenocarcinomas.WepredictedanactiveRas,Myc,Src,and/orE2F3pathwayinsignificantpercentagesofbreastcancer,colorectalcarcinoma,andgliomas.OurresultsalsosuggestthatRasmaybethemostprevailingoncogenicpathway.Additionally,manyNCI60celllinesexhib-itedagenesignatureindicativeofanactiveRas,Myc,and/orSrc,butnotE2F3,β-catenin,TNF-α,orTGF-βpathway.Toourknowledge,thisisthefirstcom-prehensivesurveyofcancerpathwayactivitiesinninemajortumortypesandthemostwidelyusedNCI60celllines.The“geneexpressionpathwaysignatures”wehavedefinedcouldfacilitatetheunderstandingofmolecularmechanismsincan-cerdevelopmentandprovideguidancetotheselectionofappropriatecelllinesforcancerresearchandpharmaceuticalcompoundscreening.