简介:WereportedinthismanuscriptthatTGF-β1inducesapoptosisinAML12murinehepatocytes,whichisassociatedwiththeactivationofp38MAPKsignalingpathway.SB202190,aspecificinhibitorofp38MAPK,stronglyinhibitedtheTGF-β1-inducedapoptosisandPAI-1promoteractivity.TreatmentofcellswithTGF-β1activatesp38.Furthermore,over-expressionofdominantnegativemutantp38alsoreducedtheTGF-β1-inducedapoptosis.Thedataindicatethattheactivationofp38isinvolvedinTGF-β1-mediatedgeneexpressionandapoptosis.
简介:矮脆突变体dwf1(dwarfandfragile1)来源于EMS诱变处理的籼型恢复系缙恢10号,主要表现为根、茎、叶、叶鞘、子粒等器官特别脆,同时植株变矮、叶片披垂。株高、穗长、结实率、节间长以及千粒重有不同程度降低,细胞壁中纤维素和木质素含量下降、半纤维素含量增加,机械强度下降。茎秆表面锯齿状突起尖锐,薄壁细胞较野生型小、细胞大小不一致、排列紊乱,细胞形状不规则、长度稍有变短。该突变性状受一对隐性核基因控制,位于第9染色体上标记Ind6与Ind4之间,dwf1相对于野生型在LOC_Os09g25490第7外显子上有一个碱基的错义突变,导致氨基酸由半胱氨酸突变为精氨酸,该突变发生在基因的高度保守区域内。dwf1对深入研究水稻变矮变脆机制具有重要意义。
简介:Asystematicphylogeneticfootprintingapproachwasperformedtoidentifycon-servedtranscriptionfactorbindingsites(TFBSs)inmammalianpromoterregionsusinghuman,mouseandratsequencealignments.Wefoundthatthescoredis-tributionsofmostbindingsitemodelsdidnotfollowtheGaussiandistributionrequiredbymanystatisticalmethods.Therefore,weperformedanempiricaltesttoestablishtheoptimalthresholdforeachmodel.WegaugedourcomputationalpredictionsbycomparingwithpreviouslyknownTFBSsinthePCK1genepro-moterofthecytosolicisoformofphosphoenolpyruvatecarboxykinase,andachievedasensitivityof75%andaspecificityofapproximately32%.Almostallknownsitesoverlappedwithpredictedsites,andseveralnewputativeTFBSswerealsoidentified.WevalidatedapredictedSP1bindingsiteinthecontrolofPCK1tran-scriptionusinggelshiftandreporterassays.Finally,weappliedourcomputationalapproachtothepredictionofputativeTFBSswithinthepromoterregionsofallavailableRefSeqgenes.OurfullsetofTFBSpredictionsisfreelyavailableathttp://bfgl.anri.barc.usda.gov/tfbsConsSites.
简介:为研究烟草黑胫病不同亲本来源的抗性遗传规律,定位抗性基因位点,本研究利用抗黑胫病品种Beinhart1000-1构建了220个F2分离群体。通过病圃接种鉴定和遗传分析,确定Beinhart1000-1对烟草黑胫病的抗性由多基因控制。利用筛选到的70对稳定SSR引物对烟草黑胫病抗性进行了QTL分析,绘制了一张包含14条染色体的遗传连锁图谱,且定位到5个与烟草黑胫病抗性紧密相关的QTLs,分别在2、3、3、6、12号染色体上,其贡献率分别为6.2%、6.0%、6.7%、5.6%和5.1%。此结果使烟草黑胫病抗性研究进一步深入,推进了烟草黑胫病分子标记辅助选择。
简介:目的探讨血浆(1—3)-β-D-葡聚糖对早期诊断深部真菌感染的临床价值。方法收集2009年3月-11月间在北京友谊医院感染科住院患者174例,根据侵袭性真菌感染诊断标准,将患者分为排除深部真菌组、确诊组、临床诊断组、拟诊组。应用MB-80微生物动态快速检测系统,检测各组患者血浆(1—3)-β—D-葡聚糖水平,分析比较深部真菌感染组和非深部真菌感染组血浆(1-3)-β-D-葡聚糖的水平。结果深部真菌感染组血清(1-3)-β-D-葡聚糖含量为(153.4±37.0)pg/mL,排除深部真菌感染组血清(1-3)-β—D-葡聚糖含量为(54.6±8.6)pg/mL,两组间有统计学差异(t=3.4,P〈0.01);分析血浆(1-3)-β-D-葡聚糖诊断深部真菌感染,以20pg/mL为诊断阈值,其准确率、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70.1%、87.5%、61.9%、52.1%、91.2%。确诊病例、临床诊断病例、拟诊病例,3组间血清(1—3)-β-D-葡聚糖含量无统计学差异(P〉0.05)。结论深部真菌感染组的葡聚糖水平明显高于排除深部真菌感染组的葡聚糖水平,具有统计学意义。以20pg/mL为诊断阈值,其准确率、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为70.1%、87.5%、61.9%、52.1%、91.2%,可作为深部真菌感染的最佳诊断阈值。
简介:根据转录组测序获得的钙依赖蛋白激酶基因的EST序列设计特异引物,利用RT-PCR和RACE技术从油菜中克隆获得BnCDPK1基因全长序列,NCBI登录号为KF740477,其cDNA和gDNA全长分别为2115bp和2857bp,含有11个内含子和12个外显子。生物信息学分析表明其开放阅读框为1581bp,编码527个氨基酸,具有CDPKs家族典型的特征,含有1个激酶区域和4个钙离子手型结构域,与拟南芥AtCDPK28同源性最高,属于第Ⅳ亚家族。BnCDPK1在油菜的根、茎、叶、花、种子中均有表达,但表达丰度存在差异,叶片中表达量最高,其次为茎、根和种子,花中的表达量最低;在高抗和高感油菜品种中,菌核菌胁迫均能够诱导BnCDPK1上调表达,但是高抗品种比高感品种反应更迅速,表达量更高。接种前、接种后12h、接种后24h,高抗品种的表达量相比高感品种分别提高1.4倍、4倍和3倍,推测其可能参与油菜的生长发育以及油菜对菌核菌侵染的应答和防御反应。
简介:目的探究ripply1基因在斑马鱼早期背腹轴发生过程中的作用.方法利用斑马鱼整封原位杂交技术揭示ripply1基因在斑马鱼早期胚胎发育过程中的表达模式,通过显微注射技术在胚胎1细胞期注射ripply1的mRNA来高表达Ripply1蛋白并在后期观察胚胎背腹标记基因的变化及胚胎形态变化.利用Tol2转基因技术构建ripply1启动子驱动的GFP转基因鱼.结果原位杂交结果显示ripply1基因在斑马鱼原肠早期胚盾期特异表达在胚盾处,即预定的背部.高表达ripply1后,在胚盾期背部标记基因表达范围扩大,腹部标记基因表达减弱,受精后24小时胚胎表现出严重的背部化表型:头部增大,腹部卵黄延伸减弱,尾部躯干及尾部区域减少,有的甚至形成了第二个体轴.得到的转基因鱼揭示ripply1母源表达,并且转录起始位点上游1200个碱基驱动的GFP能模拟内源基因的表达图式.结论ripply1可能参与斑马鱼胚胎早期背腹轴的发生.
简介:目的:克隆并表达caspase-8/10相关RING结构域蛋白1(CARP1)基因,检测其泛素连接酶活性。方法:提取结肠癌HCT116细胞总RNA,RT-PCR扩增CARP1基因,将其克隆到真核表达载体pcDNA3-Flag中,序列正确的阳性克隆进行扩增,提取质粒转染至293T细胞中进行瞬时表达,通过体内泛素化检测其泛素化酶活性,通过萤光素酶报告基因的方法检测其对NF-kB转录活性的影响,利用细胞生长曲线检测CARP1基因对结肠癌细胞生长的影响。结果:免疫印迹实验表明CARP1基因在293T细胞中获得有效表达;免疫共沉淀实验表明,当CARP1存在时,受体相互作用蛋白1(RIP1)被泛素化;萤光素酶实验结果表明CARP1抑制肿瘤坏死因子a(TNFa)引起的NF-kB报道基因的激活;通过生长曲线发现CARP1能促进结肠癌细胞系HCT116生长,并能部分抵抗顺铂抑制细胞生长的作用。结论:构建的人CARP1基因真核表达载体在293T细胞中获得表达,表达产物具有RIP1泛素连接酶的活性,可抑制TNFa引起的NF-kB报告基因的激活,并且促进结肠癌细胞的生长,为进一步的基因功能研究奠定了基础。
简介:椎间盘退行性变动物模型已经应用于研究椎间盘的生物力学行为、生物化学变化和生物学改变。为了探讨生骨蛋白-1(OsteogenicProtein-1,OP-1)在椎间盘合成代谢和抗分解代谢中的作用,美国Rush大学生化系的ChubinskayaS等人用椎间注射的方法制作了椎间盘退行性变模型,并用生物学和免疫组化的方法开展了研究工作。该实验共用了34只大鼠,分成5组:空白对照组、阴性对照组、核浆(nucleuspulposus,NP)盐注射加压组、两组OP-1注射组:COP-1组(椎间盘注射OP-1后持续加压)和ROP-1组(OP-1注射后停止加压)。
简介:兼容丑恶纸巾的表面上的花粉萌芽是为植物授精的必要的步。这里,我们报导Arabidopsis变异的bcl1是由于花粉萌芽的失败不育的男性。我们证明bcl1异种等位基因不能被男配偶体播送,没有同型结合的bcl1异种被获得。花粉发育阶段的分析显示bcl1变化影响花粉萌芽然而并非花粉成熟。分子的分析证明花粉萌芽的失败被AtBECLIN1的混乱引起。AtBECLIN1在成熟花粉主要被表示并且与重要相同编码蛋白质到在酵母为autophagyandvacuolar蛋白质排序的过程(VPS)要求的Beclin1/Atg6/Vps30。我们也证明AtBECLIN1为正常被要求植物开发,和那与autophagy,VPS和glycosylphosphatidylinositolanchor系统有关的基因,被AtBECLIN1的缺乏影响。
简介:MembersofBcl-2familyofproteinsareregulatorsofcelldeaththatcanbegroupedintosubfamiliesofprosurvivalandproapoptoticmolecules.Theyarecharacterizedbythepresenceofseveralconservedmotifs,knownastheBcl-2homology(BH)domains,designatedBH1,BH2,BH3andBH4.MutagenesisandstructuralstudiesrevealedthattheBHdomainsareimportantfunctionaldomainsthatarealsorequiredfordimerizationfunction.Recently,asubfamilyofproapoptoticmoleculesonlycontainsBH3motifhasbeenidentifiedsuggestingBH3domainalonemaybesufficientformediatingproapoptoticfunctionamong