简介：[目的]生态位模型在生物地理学、入侵生物学和保护生物学中具有广泛的应用，被越来越多地用于预测物种潜在分布和现实分布的研究中。本文以美国白蛾为例介绍pROC方案在生态位模型评价中的应用及其注意事项，以期对物种潜在分布预测进行合理的评价，促进生态位模型在我国的合理运用和发展。[方法]介绍ROC曲线和AUC值基本原理，总结其在生态位模型评价中的应用，从物种存在分布点和不存在分布点的可信度出发，分析AUC值用于模型评价的优点和不足，最后介绍局部受试者工作特征曲线的线下面积方案（pROC方案）来弥补传统AUC值的不足。[结果]AUC值虽独立于阈值，但因其综合灵敏度和特异度，而屏蔽这2个指标各自的特征，不能分别评估预测结果的灵敏度和特异度，同时对遗漏率和记账错率不能进行权衡，会误导使用者对模型的评价。与AUC值相比，ROC曲线的形状更具有价值，蕴含丰富的模型评价信息。[结论]模型评价需要将灵敏度和特异度区别对待，ROC曲线形状比AUC值在生态位模型评价中更为重要，pROC方案相对于传统AUC值具有优势，但容易对过度模拟做出不当判断。模型评价与作者研究目的密切相关：当以预测物种潜在分布为目的时（如入侵物种潜在分布、气候变化对物种分布的影响和谱系生物地理学），模型评价应当给予灵敏度（或者遗漏率）更多的权重；当以预测物种现实分布为目的时（如保护区界定和濒危物种引入），模型评价应当给予灵敏度和特异度同等的权重。

简介：【背景】抗除草剂转基因作物是全球种植面积最大的一类转基因植物,以除草剂抗性基因作为检测靶标的分子鉴定方法的研究与应用,对转基因生物安全的检测与监测有重要意义。【方法】根据除草剂抗性基因aad1和dmo的核苷酸序列设计PCR检测引物,并进行PCR反应体系优化、方法特异性、灵敏度、再现性等方面的测试,分别建立aad1基因和dmo基因的特异性PCR检测方法。【结果】建立的PCR检测方法在56~64℃的退火温度范围内均能获得一致性结果,具有良好的稳健性。该方法可将含有aad1基因和dmo基因的转基因作物与其他转基因作物区分开,其灵敏度可分别达到20个拷贝和40个拷贝。通过将aad1基因和dmo基因的检测引物放入同一管PCR反应体系中,还能在一次PCR中同时检测这2个靶标基因,双重PCR的检测灵敏度与单一PCR一致。【结论与意义】建立的分子方法可精准检测出含有aad1基因和dmo基因的转基因作物,具有特异性强、灵敏度高的特点,为抗除草剂转基因作物的筛选检测提供了可靠的技术支撑。

简介：苹果蠹蛾是世界性重要的果树害虫,也是我国一类进境检疫性有害生物,严重威胁着我国黄土高原和环渤海湾优势苹果产区的果业生产。化学防治是当前苹果蠹蛾防治最经济有效的措施,然而频繁使用化学杀虫剂引发的抗药性问题也在世界范围内相继报道。代谢抗性是苹果蠹蛾抗性中重要的机制,苹果蠹蛾解毒酶代谢杀虫剂的分子机制是当前代谢抗性研究的重点方向。基于分子模拟的方法在相关研究中扮演着越来越重要的角色,本文综述了分子模拟涉及的主要方法及其在苹果蠹蛾代谢杀虫剂分子机制研究中的应用,并展望未来可能的研究方向。

简介：【背景】外来人侵植物紫茎泽兰自然演化出耐高温种群，其适应机制与各种生理代谢有关。【方法】本文从超微细胞化学水平，对紫茎泽兰抗高温种群、敏感种群ATP酶活性定位，明确其在高温适应性中的作用，试图阐明该草的生态适应机制。【结果】正常情况下，紫茎泽兰ATP酶主要定位于细胞壁及细胞间隙周围的细胞壁表面；经40℃高温处理后，在不同的处理时间下，抗性、敏感种群之间ATP酶的活性表现出明显差异，其中以处理12h时差异最大，具体表现为抗高温种群的ATP酶活性明显高于敏感种群，ATP酶的定位点除细胞壁外，在细胞膜上也呈现大量的分布，而敏感种群在处理12h时的酶活性明显降低，只在细胞壁上有零星的分布。处理24h时，敏感种群叶片已完全萎蔫，细胞结构毁坏，细胞膜破损；而抗高温种群叶片仍然完好，细胞膜上仍有ATP酶分布。【结论与意义】经40℃高温处理后，紫茎泽兰抗高温种群ATP酶活性明显高于敏感种群，初步认为紫茎泽兰对高温的适应性与ATP酶活性相关。本研究为进一步阐明与紫茎泽兰适应性相关的入侵机理提供了资料。

简介：【背景】多样性比较是评价转基因作物对生物群落影响的标准参数之一。以往用于描述多样性的指数很多，但这些指数各有优缺点，生物学解释不全面。运用现代生物多样性表示方法，能够描述更复杂情况下的多样性关系。本文主要介绍了Rényi多样性指数曲线在生物安全研究中的应用。【方法】Rényi多样性指数曲线与以往常用的一维多样性指数不同，当其等级参数为某些特定值时代表了几个著名的多样性指数，该方法可较为确切地评价复杂的生物群落的多样性。本文在介绍其计算公式后，通过比较河北省2种转Bt基因棉田（孟山都33B和中棉30，均未施农药）以及常规管理（施用农药）和综合治理（IPM，施用农药和释放赤眼蜂相结合）条件下非转基因棉田的蜘蛛群落，证明了该方法的适用性。【结果】Rényi多样性指数曲线分析表明了所有可能的互作类型：1个明确的多样性排序以及2类棉田蜘蛛群落间不同的潜在关系。Rényi指数分析表明，在供试棉田中，中棉30棉田的蜘蛛多样性指数最高，其他3种棉田蜘蛛的多样性高低则难以一概而论。蜘蛛稀有种的多样性以孟山都33B棉田最高，IPM和常规棉田次之；蜘蛛常见种的多样性以IPM棉田最高，常规棉田和孟山都33B棉田次之。【结论与意义】Rényi多样性指数可用于生物群落多样性的综合评价，并可用于评价不同管理措施对生物多样性的影响。该方法弥补了仅用单一数量参数评价多样性的传统方法的缺陷，将不同参数整合成一个具有内在关联的概念框架。

简介：研究了取食转Bt-cry1Ah基因玉米花粉对龟纹瓢虫Propylaeajaponica（Thunberg）体内解毒酶和中肠蛋白酶活性的影响。利用饲喂结合比色方法,比较龟纹瓢虫取食转Bt-cry1Ah基因玉米花粉和非转基因玉米花粉后体内α-乙酸萘酯酶、乙酰胆碱酯酶、谷胱甘肽-S-转移酶、中肠总蛋白酶、类胰蛋白酶和类胰凝乳蛋白酶的酶活性。结果发现：在解毒酶方面,取食Bt玉米花粉的龟纹瓢虫4龄幼虫和蛹的α-乙酸萘酯酶活性显著低于取食非Bt玉米花粉的龟纹瓢虫（对照组）,取食Bt玉米花粉的龟纹瓢虫的乙酰胆碱酯酶和谷胱甘肽-S-转移酶活性在各个发育时期与对照相比均无显著差异。在中肠蛋白酶方面,与对照组相比,取食Bt玉米花粉的龟纹瓢虫的总蛋白酶和强碱性类胰蛋白酶活性在各个发育时期均无显著差异;但取食Bt玉米花粉的龟纹瓢虫的弱碱性类胰凝蛋白酶和类胰凝乳蛋白酶活性在蛹期显著低于取食非Bt玉米花粉的龟纹瓢虫。由此可见,龟纹瓢虫取食含有Cry1Ah杀虫蛋白的玉米花粉后,体内代谢解毒酶和中肠蛋白酶与Cry1Ah杀虫蛋白相互作用,可能会引起某些酶活性的变化。因此,转cry1Ah基因玉米花粉对龟纹瓢虫的潜在影响还需要进一步的研究。