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  • 简介:摘要目的分析2017至2020年我国诺如病毒流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因型的基因组以及变异情况。方法利用通用引物初步建立GⅡ组诺如病毒基因组扩增方法,扩增GⅡ.4 Sydney[P31]株基因组,并应用高通量测序技术对其基因组测序,对GⅡ.4 Sydney[P31]株进行系统进化分析和关键位点分析。结果利用初步建立的GⅡ组基因组扩增方法,8株GⅡ.4 Sydney[P31]株中,6株扩增成功并获得基因组序列。通过系统进化分析表明,本研究获得的自2017—2020年6株毒株和2015—2019年的GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇,2013年我国毒株GZ20 133 135株与2012—2014年GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇。血型抗原受体结合位点(HBGAs)分析表明2014年以后的毒株在Site Ⅱ发生了氨基酸突变Asp372Asn。通过抗原表位分析,2017年以后的毒株,在A表位(297、372和373)、B表位(333)、E表位(414)和H表位(309、310)都发生了变化;2020年的毒株20HN261和20HN253株在A表位(368)和G表位(355)较之前的毒株出现了新变化。结论本研究确定了我国流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因组关键位点变异情况,跟踪新毒株的出现提供了科学依据,为针对我国流行株疫苗研发设计提供了基础数据。

  • 标签: 诺如病毒 基因组 系统进化分析
  • 简介:摘要目的了解2019年我国5岁以下腹泻住院患儿A组轮状病毒(group A rotavirus, RVA)感染的流行特征,为A组轮状病毒监测提供参考。方法收集2019年我国20省监测哨点医院的5岁以下腹泻住院儿童粪便标本及临床信息。根据《全国病毒性腹泻监测方案》中轮状病毒检测方法进行RVA核酸检测及基因分型。结果采集病毒性腹泻标本共5 395份,检测5 038份,1 247份腹泻标本呈现RVA核酸阳性(1 247/5 038,24.75%)。RVA在福建省的阳性率最低(30/319,9.40%),在河南省的阳性率最高(182/338,53.85%);RVA在男性和女性患儿中的阳性率分别为25.24%(762/3 019)和24.02%(485/2 019),RVA感染无明显的性别分布特征(χ2 = 0.96, P=0.326);RVA以12~17月龄患儿为主要易感对象(342/1 033,33.11%),48~59月龄患儿RVA的阳性率较低(35/227,15.42%),RVA感染呈现明显的年龄分布特征(χ2 = 86.78, P<0.001);RVA感染具有明显的城乡差别(χ2 = 20.92, P<0.001)和季节特征(χ2 =411.42, P<0.001)。RVA基因分型结果显示G9P[8]型(994/1 122,88.59%)是主要的流行优势株。结论2019年我国5岁以下腹泻住院患儿RVA感染的主要基因型为G9P[8]型,且RVA感染具有明显的年龄、地域和季节特征。

  • 标签: 病毒性腹泻 A组轮状病毒 流行特征 基因型
  • 作者: 马亚林 王金冬 毛彤瑶 章青 孔翔羽 段招军
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2023-03-15
  • 出处:《中华实验和临床病毒学杂志》 2023年第01期
  • 机构:甘肃中医药大学公共卫生学院,兰州 730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,北京 102206,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,北京 102206 潍坊医学院,潍坊 261000,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,北京 102206
  • 简介:摘要目的原核表达GII.4基因型人诺如病毒(human norovirus, HuNoV)次要衣壳蛋白VP2并制备多克隆抗体。方法设计特异性引物扩增GII.4 HuNoV的VP2全基因,酶切连接至原核表达载体pGEX-6P-1,将鉴定正确的重组质粒转化BL21(DE3)感受态细胞。挑取单克隆摇菌,加入IPTG诱导重组GST-VP2融合蛋白的表达,经GST亲和层析纯化和酶切,获得GII.4 HuNoV VP2蛋白。通过SDS-PAGE分析纯化后HuNoV VP2蛋白相对分子质量。将纯化的GII.4 HuNoV VP2蛋白(0.5 mg/ml)免疫BALB/c小鼠,制备多克隆抗体。结果GII.4 HuNoV VP2蛋白被成功表达和纯化,相对分子质量(Mr.×103)约29。将GII.4 HuNoV VP2蛋白免疫BALB/c小鼠制备的多克隆抗体滴度高达1∶1 280 000。Western blot与间接ELISA分析显示该多克隆抗体能和GII.4 HuNoV VP2抗原特异性结合。结论利用原核表达系统成功表达了GII.4 HuNoV VP2蛋白,并成功制备出高效价GII.4 HuNoV VP2多克隆抗体。

  • 标签: 诺如病毒 VP2蛋白 原核表达 多克隆抗体
  • 简介:摘要目的探讨2015—2018年兰州市5岁以下住院腹泻儿童分子流行病学特征。方法收集2015年1月至2018年12月兰州市5岁以下腹泻住院儿童粪便标本和相应临床信息,采用RT-PCR方法进行扩增、测序和序列分析。应用SPSS 25.0软件进行相关统计分析,其中率的比较采用x2检验,分析2015—2018年兰州地区诺如病毒分子流行特征。结果诺如病毒的检出率为14.27%(112/785),2015—2018年的检出率为7.8%~17.6%,不同年份阳性率比较,差异有统计学意义,季节高峰分别出现在1月、5月和10月。1岁检出率最高,2岁检出率最低,差异无统计学意义。根据基因分型结果,GII.4 Sydney[P31]和GII.3[P12]为主要流行基因组合,分别占54.5%(61/112)和36.6%(41/112)。结论兰州市急性胃肠炎患儿诺如病毒基因型具有多样性,其中以GII.4 Sydney[P31]和GII.3[P12]为主要流行株。

  • 标签: 诺如病毒 基因型 流行病学 序列分析