简介：摘要目的了解2019年秋冬季青岛地区手足口病住院患者柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6，CV-A6)流行情况及VP1区基因特征和种系进化关系。方法收集2019年秋冬季青岛地区手足口病住院患者104份咽拭子，使用肠道病毒通用RT-PCR筛选出阳性标本。再用肠道病毒VP1区的通用分型引物扩增阳性样本，扩增序列测序并进行BLAST比对。用CV-A6 VP1全长引物，扩增CV-A6阳性样本，扩增产物测序，通过DNAstar和MEGA软件进行核苷酸和氨基酸的同源性分析并构建系统发育树。结果104份咽拭子样本中，肠道病毒检测阳性60份，总体阳性率为57.7%，其中CV-A6阳性率26.9%(28/104)，柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)阳性率30.8%(32/104)。对28份CV-A6阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析获得22株阳性序列，其核苷酸同源性为93.6%～99.9%，氨基酸同源性为98.0%～100%。系统进化分析表明22株CV-A6均属于D基因型中的D3亚型。结论引起2019年秋冬季青岛地区住院手足口病的病原体是CV-A6和CV-A16，CV-A6的流行株主要是D3亚型。
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