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  • 简介:【摘要】目的 围绕药品检测环境微生物,采用多种测序技术对其实施鉴定分析,评定其应用价值。方法 以药品微生物实验室为对象,采集、收集其环境当中的细菌(248株)、霉菌(6株),实施鉴定操作(全自动微生物生化鉴定仪)。依据所得到的生化鉴定结果,基于种属分类学,选择20种具有代表性的细菌(28株)与霉菌(6株),分别用宏基因组测序技术(Hiseq2000与Ion torrent测序平台)、一代测序技术(基于ABI3500测序平台)实施鉴定分析,对菌株鉴定方法所具有的准确性进行相互验证。结果 在28株细菌当中,较之生化鉴定,16SrDNA一代测序鉴定有23株属水平分类一致,10株种水平分类一致。用Hiseq2000对细菌混合实施全基因测序鉴定,较之16SrDNA一代测序,15株种水平一致,2株属水平一致;针对霉菌全基因组测序而言,得到菌信息3株,相比于一代测序结果(霉菌LSU rDNA),3株菌信息缺失。用Ion torrent开展16S rDNA宏基因组测序鉴定,与16S rDNA一代测序结果相比较,有11种对应,且10种属对一代测序当中的28株菌进行了覆盖。结论 针对新一代的宏基因组测序技术及配套的分析方法而言,需持续健全与优化,方能快速、准确的对环境微生物混合菌株实施鉴定,更好的实施建库溯源工作。

  • 标签: 药品检测环境 测序技术 微生物鉴定
  • 简介:【摘要】目的 围绕药品检测环境微生物,采用多种测序技术对其实施鉴定分析,评定其应用价值。方法 以药品微生物实验室为对象,采集、收集其环境当中的细菌(248株)、霉菌(6株),实施鉴定操作(全自动微生物生化鉴定仪)。依据所得到的生化鉴定结果,基于种属分类学,选择20种具有代表性的细菌(28株)与霉菌(6株),分别用宏基因组测序技术(Hiseq2000与Ion torrent测序平台)、一代测序技术(基于ABI3500测序平台)实施鉴定分析,对菌株鉴定方法所具有的准确性进行相互验证。结果 在28株细菌当中,较之生化鉴定,16SrDNA一代测序鉴定有23株属水平分类一致,10株种水平分类一致。用Hiseq2000对细菌混合实施全基因测序鉴定,较之16SrDNA一代测序,15株种水平一致,2株属水平一致;针对霉菌全基因组测序而言,得到菌信息3株,相比于一代测序结果(霉菌LSU rDNA),3株菌信息缺失。用Ion torrent开展16S rDNA宏基因组测序鉴定,与16S rDNA一代测序结果相比较,有11种对应,且10种属对一代测序当中的28株菌进行了覆盖。结论 针对新一代的宏基因组测序技术及配套的分析方法而言,需持续健全与优化,方能快速、准确的对环境微生物混合菌株实施鉴定,更好的实施建库溯源工作。

  • 标签: 药品检测环境 测序技术 微生物鉴定
  • 简介:【摘要】 目的 分析在药品检测环境微生物鉴定中,应用多种测序技术的应用效果。方法 研究时间段选择近1年,研究起始时间为2020年1月,研究结束时间为2020年12月,共计纳入实验室收集的细菌菌株216株以及3株霉菌进行鉴定,应用全自动微生物生化鉴定仪进行鉴定,对菌株鉴定情况进行分析。结果 经过鉴定,在编号15细菌菌株中,测得其16rDNA片段,无法区分苏云金芽孢杆菌与蜡样芽胞杆菌。在霉菌测序鉴定中,编号3、4号测得的LSU rDNA片段,无法区分青霉菌变种、岛青霉菌、绳状篮状菌、绳状青霉菌进行区分。结论 在药品检测环境微生物鉴定中,新一代宏基因组测序技术与分析方法有一定局限性存在,在鉴定中还应当进一步与环境微生物混合菌株融合、优化。

  • 标签: 药品检测环境 微生物鉴定 多种测序技术 应用价值
  • 简介:摘要:目的  探讨多种测序技术在药品检测环境微生物鉴定中的应用价值。方法  此次研究对象选取药品微生物实验室中的122株细菌和3株霉菌,为连续8月时间经收集所获取,应用全自动微生物生化鉴定仪对其进行鉴定。依照生化鉴定相应的结果,选取在种属分类学上存在一定代表性的细菌应用一代测序技术加以鉴定分析,相互验证菌株鉴定方法的准确性。结果  通过实验观察,菌株生化鉴定和测序鉴定结果显示不一致的菌株,根据镜检、生长特点及其菌落形态,将参考测序鉴定结果当作依据。编号24细菌测得16SrDNA片段种,不能针对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌加以有效区分。编号2和编号3种霉菌测得LSU rDNA片段种,针对绳状青霉菌、绳状篮状菌、岛青霉菌、青霉菌变种不能进行有效的区分。结论  一代测序技术具有一定的局限性,应更为深入地与环境微生物混合菌株进行融合,以实现快速、准确鉴定,并将此作为基础,进行建库溯源,以确保测序工作开展的高效与准确。

  • 标签: 药品检测 环境微生物 多种测序技术
  • 简介:自从诺贝尔奖得主Sanger1977年发明双脱氧DNA测序方法后,该测序法已独占商业性的DNA测序技术20年,虽然其不断改善的自动化操作已经大大加速了测序的速度,使科学家们能提前几年完成人类基因组草图测序,并测出了另外几百种生物的基因组,但当前普遍使用的测序仪,一次只能读取1,000个左右的碱基,且DNA样品需要长时间的制备和分析,因而科学家们一直在寻求革命性的技术革新:高速测序技术。本文综述了DNA高速测序技术及DNA高速测序仪器的进展情况,并对其应用前景进行了展望。

  • 标签: 高速测序技术 DNA 高速测序仪器 基因组
  • 简介:

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  • 简介:由于分子生物学近年来的迅速发展,很多临床实验室开展了分子诊断实验项目。虽然目前由于操作复杂和高昂成本的原因,DNA测序技术尚没有大规模走进临床实验室,但是在众多分子诊断方法中,DNA序列测定和分析无疑是最权威的金标准。DNA测序技术在这几十年来从手工到自动化,从复杂到简单,但是近几年的高通量测序技术使之重新复杂起来,本文将介绍一下DNA测序技术与仪器的历史沿革与最新进展。

  • 标签: 分子诊断 基因测序 高通量
  • 简介:

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  • 简介:姐姐和弟弟去采蘑菇,姐姐采了20个蘑菇,她看弟弟采的蘑菇比她少,就给了弟弟6个,现在姐弟俩的蘑菇个数一样多了。原来弟弟采了多少个蘑菇?

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  • 简介:根据《全球出生缺陷报告》,全球每年出生遗传相关出生缺陷婴儿近800万,占出生总人数6%;其中300多万遗传性出生缺陷患儿在5岁前夭折,另外约300万将终身带病。94%以上患儿、95%以上死亡病例来自低等和中等收入国家。现已发现7000多种遗传或部分遗传性出生缺陷;遗传性病因可分为染色体病(含基因组病)、单基因病和多基因病。其中,严重遗传病占严重出生缺陷的80%,常为致愚、致残、致死性,且难以治疗、预后差,给家庭和社会造成极大的负担,严重影响人口素质。因此,严重遗传病的预防和早期诊断具有重要的意义。

  • 标签: 产前诊断 高通量 遗传性病因 出生缺陷 测序 中等收入国家
  • 简介:高通量测序技术通过几个间段的发展已经能够产生海量的基因组序列。与此同时,高通量测序技术本身也深刻地改变着作物育种的策略和途径:分子标记的辅助选择将极大地提高育种的选择效率;基于重测序技术的单倍型分析能够快速准确地研究种质资源;对没作物进行从头测序,提供大量的序列信息用于育种实践。

  • 标签: 高通量测序技术 作物育种 分子标记辅助选择 重测序 单倍型分析
  • 简介:摘要胃癌是一种高异质性肿瘤,传统测序方式通常将胃癌组织或细胞当做整体进行分析,易忽视其中各个细胞亚群的作用。作为一种新兴技术,单细胞测序可在单个细胞水平对基因组、转录组等多组学进行分析,可识别胃癌组织中的罕见细胞亚群,有助于解析胃癌的发生发展轨迹。本文就单细胞测序的优势、流程以及在胃癌研究中的应用进行综述,并探讨其应用前景。

  • 标签: 胃癌 单细胞测序 异质性
  • 简介:花丛中有13只蝴蝶,飞走了8只,还剩几只?小明说:"这道题应该用减法计算,算式是13-8。我把8分解成3和5,先算13-3=10(只),再算10-5=5(只)。所

  • 标签: 蝴蝶 算式 算法 分解 减法 计算
  • 简介:[摘要]要想上好通用技术这门课,教师必须打破以前的教学模式,改变教学方法和思路,多收集一些身边的素材,通过这些生活载体,把枯燥无味的技术知识转变成为学生感兴趣的、实践型的知识,这就要求我们把课堂搞“活”,使学生活跃在课堂中,并能够在实践中体会到技术的本质,从而提高自身的技术素养,达到预期目标。[关键词]通用技术案例小试验讨论通用技术以学生的亲手操作,亲历情景,亲身体验为基础,强调学生的全员参与和全程参与。它由许多模块组成,包括案例分析、马上行动、小试验、小词典等。跟其他科目相比看似内容丰富,但真正需要讲解的知识点却少,而且较多的知识不需要教师的解释学生就可以完全掌握。在这样的情况下如何吸引学生的兴趣,我觉得活跃课堂是首要条件,在一个轻松的氛围里学习势必会达到事半功倍的效果。对于这个问题,我在教学过程中作了很多尝试,有困惑,有反思,也有成效。活跃课堂可以有多种途径,例如小试验、寻找贴近生活得案例、课堂讨论等,下面我在这里作简单介绍。

  • 标签: 技术课堂 活跃通用 途径活跃
  • 简介:目的探讨慢性中耳炎手术方法。方法2005年7月至2007年7月为45例46耳慢性中耳炎,胆脂瘤性中耳炎及中耳炎后遗症患者经耳内切口,在清除病灶的同时采用自体外耳道一乳突骨膜,骨质修补鼓膜,重建上鼓室盾板,外耳道后壁,听骨链,术后随访达12—36个月,以最后一次随访听力记录为统计数据,统计分析用配对t检验。结果46耳术后AC,BC和ABG术前术后差值(dBHL)为22.74±12.45,6.16±5.07和17.87±7.14,经配对t检验,P均〈0.01,差异有显著统计学意义。43耳(93.5%)获得形态正常外耳道,鼓膜及含气的中耳腔,1耳外耳道存在过敏湿疹溢液,1耳大胆脂瘤伴中耳积液,鼓膜置管,持续有分泌物,给予再次手术后听力改善满意。结论慢性中耳炎术中行耳内切口采用自体外耳道一乳突骨膜骨质修补鼓膜,重建上鼓室盾板,外耳道后壁,听骨链,能达到彻底清除病灶,提高听力的目的,自体移植材料成活率高,痛苦少,经济且无碍美容。

  • 标签: 慢性化脓性中耳炎 鼓室成形术 手术操作