简介：摘要：火龙果属于仙人掌科三角柱属植物，肉质茎，叶子退化成针刺状物，该刺状物不适合作为提取基因组DNA的材料。目前有用肉质茎作为植物材料提取DNA的报道，但肉质茎中含有丰富的植物性白蛋白，多糖和多种矿质元素等，提取时会产生粘稠状物质，影响到基因组DNA的提取效果。为筛选适合火龙果基因组DNA提取的组织材料，本文取幼茎、花瓣、雄蕊、雌蕊及根系等组织材料用于提取基因组DNA，经比对分析发现雄蕊花后5天的果肉提取效果最佳，提取的DNA能满足开展火龙果基因组相关分子生物学研究的需要。

简介：摘要单基因遗传病种类多而复杂，且有不断增长的趋势，总体发病率较高，临床表现各异，通过产前筛查和诊断，及早阻止致死或严重致残的单基因遗传病患儿的出生，是行之有效的防控策略。基于胎儿游离DNA的无创产前单基因遗传病检测技术已应用于临床，检测的疾病种类不断增加，技术也在不断取得突破，本文就该领域的研究进展做一综述。

简介：摘要目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎（乙肝）疫苗（HepB）免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法，招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象，将乙肝表面抗体浓度（抗-HBs）<100 mIU/ml设为病例组，≥100 mIU/ml设为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序、使用Illumina平台对IFNG基因目标区域及其CpG位点进行DNA甲基化高通量测序。采用非条件logistic回归模型分析IFNG基因18个位点胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸 DNA甲基化情况与HepB免疫应答水平的关联。结果病例组（104名）和对照组（159名）抗-HBs［M（Q1，Q3）］分别为62.34（30.06，98.88）mIU/ml和1 089.10（710.35，1 233.45）mIU/ml。病例组IFNG_1基因44和93位点甲基化水平差异高于对照组（P<0.05），非条件logistic回归模型显示，IFNG_1基因44位点（OR=1.18，95%CI：1.03~1.35）和93位点（OR=1.21，95%CI：1.07~1.38）DNA甲基化水平与HepB应答水平具有相关性。结论IFNG_1基因44和93位点DNA甲基化水平改变可能是影响广西汉族儿童HepB应答水平的相关因素。

简介：摘要目的探讨HBsAg阳性母亲C基因型HBV DNA CpG岛的类型、长度、CG位点等的分布特点及其与HBV宫内传播的关系，为HBV宫内传播机制研究提供新视角。方法连续收集2011年6月至2013年7月太原市第三人民医院妇产科住院分娩的HBsAg阳性母亲及其新生儿，通过面对面问卷调查及电子病历收集流行病学资料，采用电化学发光法和荧光定量PCR分别检测母亲及新生儿HBV血清学标志物及血清HBV DNA。以新生儿出生24 h内乙型肝炎（乙肝）疫苗/乙肝免疫球蛋白注射前股静脉血HBsAg和/或HBV DNA阳性判定为HBV宫内传播。将HBV宫内传播者中HBV DNA载量≥106 IU/ml（满足克隆测序要求）的22例母亲及其新生儿作为宫内传播组，从未发生宫内传播者中随机选取HBV DNA载量≥106 IU/ml的22例作为对照组，以HBV DNA测序分型结果为C基因型的39例母亲进行HBV DNA CpG岛分布预测等分析。结果39例HBV C基因型的母亲中，宫内传播组19例，对照组20例。39例C基因型者HBV DNA均含有传统CpG岛Ⅱ、岛Ⅲ，而对照组中有传统CpG岛Ⅰ以及新型CpG岛Ⅳ、岛Ⅴ；HBV宫内传播组和对照组母亲携带的HBV DNA CpG岛Ⅱ、岛Ⅲ长度和CpG岛Ⅱ CG位点个数分布不同，差异有统计学意义（P<0.05），HBV宫内传播组中CpG岛Ⅱ长度≥518 bp且其CG位点个数≥40个（11/19）的比例明显高于对照组（2/20），差异有统计学意义（P<0.05）；位于X基因启动子区的CpG岛Ⅱ长度和CG位点个数大于对照组，差异有统计学意义（P<0.05）。HBV宫内传播组中大部分母亲（12/19）携带的HBV DNA CpG岛Ⅱ完全覆盖了Xp区，明显多于对照组（5/20），且其HBV DNA Xp区CG位点个数大于对照组，差异有统计学意义（P<0.05）。结论HBsAg阳性母亲C基因型HBV DNA CpG岛分布与宫内传播有关，CpG岛Ⅱ长度长、CG位点个数多可能会增加HBV宫内传播的发生风险。

简介：摘要DNA损伤修复相关基因(mediator of DNA damage check point protein 1，MDC1)又称BRCT结构域1的核因子(nuclear factor with BRCT domain protein 1，NFBD1)，是一种参与DNA损伤反应早期进程的支架蛋白，在调控DNA损伤应答和维持基因组稳定性方面发挥着重要功效。本研究主要就MDC1的最新研究成果以及其在恶性肿瘤中的调控机制进行综述。

简介：摘要DNA损伤修复(DDR)基因突变在转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)患者中的发生率可达8%~16%，DDR基因突变与不良预后明显相关。DDR基因突变，尤其是BRCA1/2突变患者，对聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂(PARRi)及铂类治疗有较高敏感性。

简介：摘要目的调查我国实验室开展血液标本微生物细胞游离DNA（mcfDNA）宏基因组高通量测序（mNGS）的检测方法及质量保证情况。方法2020年10月向来自全国的80家实验室发放了mNGS检测血液标本中mcfDNA的调查问卷。问卷内容包括mNGS分析前、分析中、分析后及性能确认开展情况4个部分。（1）分析前：对标本质量的要求，如对标本的采集、储存及运输条件等；（2）分析中：mcfDNA的提取流程、文库的质量要求、测序平台的使用及生物信息学分析软件等；（3）分析后：对mNGS的结果解释标准；（4）性能确认开展情况：对各类病原体的最低检出限。要求各实验室依据实际情况填写调查问卷。对上述调查问卷的回报结果进行统计分析。结果80家实验室包括20家医疗单位和60家独立医学实验室。80.0%（64/80）的mNGS实验室检测血液中的mcfDNA时表示血浆及血清标本均可使用，其余实验室（16/80，20.0%）只采用血浆标本。参与调查的mNGS实验室所用的测序平台包括illumina 49家（61.3%），华大基因16家（20.0%），Ion Torrent 13家（16.3%），纳米孔测序2家（2.5%）。87.5%（70/80）的实验室使用第三方实验室搭建的集成分析工具，其他实验室（12.5%，10/80）使用开源软件自主搭建了分析平台。实验室间对mNGS结果的解释标准不一，其中标准化后病原体特异性序列数、相对丰度、基因组覆盖率及阴性对照中该微生物的检出情况是实验室考虑的主要因素。大部分实验室（76.3%，61/80）做过mcfDNA测序流程的性能确认实验，各实验室自建mNGS检测流程对革兰阳性菌、革兰阴性菌、真菌、寄生虫及其他病原体的最低检出限主要分布在10~100 拷贝/ml，对DNA病毒的检出限主要分布在500~1 000拷贝/ml。结论各实验室之间的检测流程具有很大差异，为了确保检测结果的及时准确，需要各实验室积极优化mNGS检测流程，完善质量保证措施，应用于临床前规范开展性能确认工作。

简介：摘要感染性疾病是临床常见疾病，发病率和病死率高，快速明确致病病原微生物，以指导合理的治疗方案仍是临床急需解决的重要课题。随着宏基因组二代测序(mNGS)技术在感染性疾病病原微生物检测方面的广泛应用，血浆游离DNA(cfDNA)mNGS作为一种无创性检测手段在病原微生物检测方面显示出巨大的潜力，成为诊断感染性疾病和指导治疗的新兴手段，但目前仍在研究的早期阶段。本文介绍了血浆cfDNA的生物学特点、血浆cfDNA mNGS在感染性疾病诊断中的研究进展及其在感染性疾病诊断中的应用和挑战。

简介：摘要目的探讨一例临床诊断为婴儿肝炎综合征的患儿的遗传学病因并对该家系进行产前诊断。方法对该家系先证者通过高通量测序进行代谢性肝病相关致病基因变异筛选，并用Sanger测序验证其变异来源，通过生物信息学方法对新报道变异致病性进行分析。结果高通量测序结果显示先证者为MPV17基因(NM_002437)c.182T>C(p.F61S)与c.293C>T(p.P98L)复合杂合变异引起的线粒体DNA耗竭综合征患者，Sanger测序验证变异分别遗传自其父亲和母亲。其中c.182T>C(p.F61S)变异尚未报道，经分析为可能致病性变异。结论MPV17基因c.182T>C(p.F61S)与c.293C>T(p.P98L)复合杂合变异为该患儿的遗传学病因；本研究发现了MPV17基因的一个新变异，拓宽了MPV17基因致病变异谱。

简介：

简介：摘要目的探讨DNA双链断裂修复基因XRCC5、LIG4的多态性与脑胶质瘤的相关性。方法以126例脑胶质瘤患者以及120例健康志愿者作为研究对象，检测XRCC5基因rs828704、rs9288516位点以及LIG4基因rs3093737、rs3093739、rs10131位点的多态性，分析其与脑胶质瘤易感性的关系。结果XRCC5基因rs828704、rs9288516位点及LIG4基因rs3093737、rs3093739、rs10131位点在两组的分布均满足Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。病例组XRCC5基因rs9288516位点的A等位基因、LIG4基因rs10131位点的T等位基因频率高于对照组(P<0.05)。XRCC5基因rs9288516位点、LIG4基因rs10131位点在显性模型及加性模型下与胶质瘤易感性具有相关性(P<0.05); LIG4基因rs3093739位点在显性模型下与胶质瘤的易感性相关(P<0.05)。结论XRCC5基因rs9288516位点、LIG4基因rs10131位点与胶质瘤的易感性存在相关性。

简介：摘要胚胎染色体异常是导致妊娠失败的主要原因之一，行胚胎植入前遗传学检测（preimplantation genetic testing，PGT），选择整倍体胚胎移植，可显著提高胚胎种植率和持续妊娠率。但由于PGT技术对胚胎的侵入性和技术的复杂性，限制了其在临床的广泛应用，开发一种安全、快速、经济的胚胎基因组检测方法将是生殖领域的一大进步。近年来，随着游离基因组DNA在胚胎培养液和囊胚腔液中的发现，许多学者开始探讨胚胎游离DNA在PGT中的适用性，然而目前的研究结果缺乏一致性结论。本文总结了胚胎培养液和囊胚腔液中基因组DNA在PGT领域的研究进展，并讨论其当前的局限性以及应用前景。

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简介：摘要：红色精神是青少年一本生动的“教科书”，紧扣“红旗不倒”精神，一起追寻红色足迹，传承红色精神，激励红色担当，感受了先辈们积极人格魅力！

简介：摘要HIV-1储存库的持续存在是治愈HIV的主要障碍，在临床研究中，需要可靠的生物标志物对其进行标记。HIV-1 DNA在HIV-1储存库中可被持续检测到，在HIV-1感染诊断、预测病毒反弹和监测治疗效果等方面具有重要应用价值。PCR的检测技术是临床上常用的HIV-1 DNA检测方法，随着技术的不断创新与进步，可更准确地通过定性或定量检测感染细胞中总的、整合的和未整合的HIV-1 DNA。感染细胞中不同形式的HIV-1 DNA作为生物标志物在HIV感染监测和艾滋病治疗相关研究中报道日益增多。本文对感染细胞中HIV-1 DNA的检测方法及其作为生物标志物的临床应用进展进行综述。

简介：【摘要】淫羊藿是重要的中药材之一，自古以来在我国众多中药典籍中都有所记载。然而淫羊藿种类较多，在全国范围内的分布较为广阔，中国黔东南、中部、西北、东北以及安徽浙江等地都有着广泛的分布。而分布在不同地区、在不同地域环境下生长的淫羊藿在性状、理化性质等多方面有所差异。而为了有效针对中药材淫羊藿进行鉴定，采用DNA分子鉴定技术能够有效规避淫羊藿在鉴定过程中受自然环境和生物体生长所产生的不确定性而带来的影响，本研究将结合中药材淫羊藿的DNA分子鉴定技术进行总结，综述DNA分子鉴定技术鉴定中药材淫羊藿的方法。

简介：摘要：随着DNA条码技术的不断成熟与推广，越来越多的中药生产加工企业选择这一技术参与药品的抽验及相关工作。本文分别从对中药材及饮片基原的鉴定；鉴定中成药组方药物种与建立药品溯源体系等三方面阐述药品抽验中的DNA条形码技术的具体应用。

简介：【摘要】淫羊藿是重要的中药材之一，自古以来在我国众多中药典籍中都有所记载。然而淫羊藿种类较多，在全国范围内的分布较为广阔，中国黔东南、中部、西北、东北以及安徽浙江等地都有着广泛的分布。而分布在不同地区、在不同地域环境下生长的淫羊藿在性状、理化性质等多方面有所差异。而为了有效针对中药材淫羊藿进行鉴定，采用DNA分子鉴定技术能够有效规避淫羊藿在鉴定过程中受自然环境和生物体生长所产生的不确定性而带来的影响，本研究将结合中药材淫羊藿的DNA分子鉴定技术进行总结，综述DNA分子鉴定技术鉴定中药材淫羊藿的方法。

简介：摘要DNA损伤修复（DDR）基因在肝癌中存在过表达的现象。研究发现，DDR与肝癌的发生与发展有密切的联系。DDR抑制剂与肝癌化疗、靶向治疗药物间存在协同作用，其可增强放疗的敏感性。部分DDR基因可作为肝癌预后评估的生物标志物。

简介：摘要：