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  • 简介:Inthisstudy,28,691genomesequencesand16,566expressedsequencetags(ESTs)ofEucalyptuswerederivedfromtheGenBankdatabase.Atotalof2292SSRlociweresoughtoutfrom1785effectivesequences.ThroughanalysesofSSRlociinformation,theSSRmotiflengthwasnegativelycorrelatedwiththeabundanceoftheSSRs.IntheESTsequencesofEucalyptus,tripletrepeatmotifswerethemostabundant,anddinucleotiderepeatsmotifshadthehighestfrequencies.Subsequently,395pairsofprimersweredesignedbasedontheSSRloci.UsingoptimizedSSR-PCRconditions,340pairsofprimersweresuccessfullyscreened,withasuccessrateof86.1%.Byconstructionofamaximumlikelihoodphylogenetictreeofsixeucalyptspecies,representedbyfivespeciesofthegenusEucalyptusandoneofthegenusCorymbia,thegeneticrelationshipsofEucalyptusurophyllaandE.camaldulensissuggestedbythistreewasfoundtodifferfromthatsuggestedbytraditionalmorphologicaltaxonomy.TheresultsprovideinsightsforevaluatinggeneticdiversityofEucalyptusandanalysisofEucalyptusphylogeneticsusingSSRmarkers.

  • 标签: SSR EUCALYPTUS SSR MARKERS SSR LOCI
  • 简介:普通洋葱(AlliumcepaL.)是一种开放授粉的重要蔬菜作物,在洋葱品种的纯度鉴定中因其亲本保有一定程度的异质性,所以杂交种的纯度百分率难以确定。为了有效地控制杂交种的纯度质量,本研究从收集于各文献的89对引物中筛选出了12对具有多态性的引物,利用筛选出的12对SSR引物对39份洋葱种质进行分析,检测到47条多态性带,平均有效等位基因数为7.25。可变类平均法(Flexiblegrouplinkage)聚类分析表明,SSR标记可将39份洋葱划分为三大类,聚类分析结果与洋葱的自然属性是相符合的。同时发现这些标记在常规品种、亲本自交系内,甚至在杂种一代中都显示出很高的遗传异质性。为了促进和提升繁育品种质量鉴定的准确性,本研究所提出的SSR分子标记辅助育种方案,可通过选定的SSR位点纯和的原种田,制出杂交种。该方案能在选育的几个SSR位点检测出准确的杂交率,还可以有效地监测洋葱F1代杂交种的纯度质量,并且这个方案可以用于任何表现出严重的近交衰退的异花授粉作物的SSR标记分子纯度鉴定,为促进和提升繁育品种质量鉴定的准确性提供帮助。

  • 标签: 洋葱 SSR标记 遗传多样性 种内异质性 纯度鉴定
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  • 简介:利用SSR标记对22份果桑种质进行了基因组多态性分析,从20对引物中筛选出6对用于这些果桑种质的SSR扩增。结果是共扩增出60条DNA条带,其中A10引物多态性最好,有40条多态性带。单条引物扩增的条带数量范围为1~40条,平均10条。扩增产物长度分布在500~2000bp之前,大多集中在500~1500bp。利用VISIONWORKS软件进行Jaccard相似性系数分析,并通过非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,建立亲缘关系图。22份果桑种质资源的遗传相似系数为0.25~0.68,其中种质8-奶油蜜和23-桂椹92L38遗传相似系数最大,为0.68;1-珍珠白和12-桂花蜜遗传相似系数最小,为0.25。在NG法测定下,在遗传相似系数为0.58处,22份果桑种质亲缘关系分为两个大类群。

  • 标签: 桑树 SSR 亲缘关系 聚类分析
  • 简介:摘要目的研究ERCP+EST+ENBD治疗胆总管结石的术后护理。方法选取本院收治的40例胆总管结石患者,所有胆总管结石患者的收取时间(2015年1月—2018年1月),均实施ERCP+EST+ENBD治疗,电脑随机分为观察组一组(20例患者)、对照组一组(20例石患者),分别实施术后护理和常规护理。结果观察组胆总管结石患者的住院时间、护理满意度评分与对照组具有显著差异(P<0.05)。结论通过对胆总管结石患者实施术后护理后,取得显著的效果,值得推广和应用。

  • 标签: ERCP+EST+ENBD 胆总管结石 术后护理
  • 简介:摘要目的对照分析内镜逆行胰胆管造影(ERCP)和内镜十二指肠乳头括约肌切开取石术(EST)与传统开腹手术在治疗肝外胆管结石方面的具体效果。方法选择了2016年1月—2018年1月我院收治的肝外胆管结石患者共100例作为研究对象,按照不同手术方式分为观察组和对照组,观察组实施ERCP和EST取石术进行治疗,对照组患者通过传统开腹手术进行治疗,对比两组的治疗效果。结果观察组结石除净率为96%,对照组结石除净率为92%,差异不具有统计学意义(P>0.05);但观察组并发症出现率为2%,对照组并发症出现率为12%;观察组患者的住院时长为(7.45±1.56)d,对照组的住院时长为(16.46±3.53)d,差异明显,具有统计学意义(P<0.05)。结论ERCP和EST取石术治疗肝外胆管结石的效果更加理想,对患者造成的创伤更小,更有助于患者的术后恢复,值得在临床上进行推广使用。

  • 标签: ERCP和EST取石术 肝外胆管结石 治疗效果
  • 简介:Assessmentofgeneticdiversityisanessentialcomponentingermplasmcharacterizationandconservation.TherearethreewildricespeciesinHainanProvince,includingOryzarufipogonGriff.InordertodetectthegeneticdiversityofdifferentpopulationsofOryzarufipogoninHainan,ISSR(inter-simplesequencerepeat)andSSR(simplesequencerepeat)markerswereusedtoinvestigate180accessionsfromsixlocalitiesinHainan.FourteenISSRprimersamplified185alleleswith171(92.43%)polymorphic,thenumberofallelesrangedfrom8to17,withanaverageof13.14allelesperlocus.Thirty-eightpairsofSSRprimersusedinthisstudyamplified213alleleswith190(89.20%)polymorphic,thenumberofallelesrangedfrom2to14,withanaverageof5.66allelesperlocus.BothISSRandSSRanalysesrevealedahighlevelofgeneticdiversityinthewildpopulations.ThepopulationwiththehighestgeneticdiversityisWanning(WN),andthepopulationwithlowestgeneticdiversityisWenchang(WC).TheresultsofaUPGMAclusterusingtheNTSYSprogramshowedthateachpopulationhasalowdegreeofgeneticdifferentiation.Furthermore,theManteltestrevealedthatthegeneticsimilaritiesdetectedbyISSRandSSRweresignificantlycorrelated(r=0.8634,t=93.67)whendetectinggeneticdiversityatthespecieslevel.ThetwomolecularmarkersystemswereabletodeterminethegeneticdiversityamongOryzarufipogon,andthetwogroupsofindexesobtainedbyusingthetwomarkershaveahighlevelofconsistency.

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  • 简介:辣椒(CapsicumannuumL.)杂交种子纯度快速检测技术对于保证辣椒杂交品种种子生产具有重要的意义。红龙13号、红龙18号、红龙25号辣椒杂交种是新疆隆平红安生物科技有限责任公司选育并大面积栽培的主栽品种。为鉴定上述3个品种的纯度,本实验在特异性引物筛选的基础上,利用SSR标记技术对3个辣椒品种进行了种子纯度鉴定。结果表明,每个品种都有1对以上SSR引物可将其父本和母本分开,3个辣椒杂交种品种的纯度分别为95.35%、89.36%和95.25%。SSR分子标记方法可以准确鉴定辣椒杂交种纯度,且大大缩短纯度鉴定周期。

  • 标签: 辣椒 SSR标记 种子纯度鉴定 红龙13号 红龙18号 红龙25号
  • 简介:为有效利用SSR-PCR技术分析国家一级重点保护植物银缕梅的遗传多样性,采用正交试验设计L16(43),即3因素4水平,对影响SSR-PCR扩增结果的因素(引物,模板DNA浓度和循环数)进行优化筛选,并在此基础上对聚丙烯酰胺凝胶上样量进行优化,建立了适合银缕梅的最佳SSR-PCR反应体系:10μL2×PCRMix、40ng模板DNA、10μmol/L引物,其余用ddH_2O补齐至20μL。PCR扩增程序为:95℃预变性15min,95℃变性30s,57.5℃退火1.5min,72℃延伸1min,30个循环,循环结束后,60℃延伸30min,扩增产物4℃保存。聚丙烯酰胺凝胶电泳上样量以1.5~2.0μL为最佳。利用优化后体系进行引物筛选,从18对引物中筛选出11对具有多态性引物,说明该反应体系具有良好的稳定性。该体系的建立可以为今后利用SSR标记对银缕梅遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供基础。

  • 标签: 银缕梅 正交设计 SSR-PCR 最佳上样量 引物筛选
  • 简介:微卫星标记(SSR)在近缘物种间具有通用性,因其高效率、低成本可广泛用于跨物种间的遗传多样性分析、基因定位和图谱构建等。本试验基于甜瓜基因组测序结果开发了120对SSR标记,研究其在8种葫芦科作物间的通用性及作物内的多态性,并利用NTSYS软件分析37份不同瓜类作物材料间的遗传多样性。结果显示,114对标记均在甜瓜基因组中得到有效扩增,黄瓜中有108对标记有效扩增,通用性比率为94.7%,南瓜中能有效扩增标记最少,其通用性比率也达到了41.2%,在8种葫芦科作物间均通用的标记有29对;通过对通用性标记的多态性分析表明,甜瓜多态性比率最高为61.4%,西瓜、黄瓜、苦瓜、冬瓜、西葫芦、南瓜和丝瓜多态性比率分别为32.5%、14%、4.4%、8.8%、3.5%、13.2%和11.4%;不同作物间的平均遗传相似系数在0.70~0.83之间,其中甜瓜和黄瓜平均遗传相似系数较小,亲缘关系较近,西葫芦和南瓜间的平均遗传相似系数最小,亲缘关系最近。这些通用性标记将有利于提高葫芦科作物整体分子生物学研究水平。

  • 标签: 甜瓜 葫芦科 SSR 通用性 遗传多样性
  • 简介:为丰富太子参分子标记库、开发太子参SSR标记、寻找有效的太子参种源鉴定方法。本研究运用MISA、Primer3等分子生物学分析工具,从太子参转录组中搜索获得11297个SSR位点,其出现频率为8.87%,分布距离为平均每10kb有1.47个SSR位点,其中主要重复类型是单核苷酸重复;11297个SSR位点中不同核苷酸基序类型的SSR有259种,主要以单核苷酸重复基序A/T为主,其次是三核苷酸重复基序AAT/ATT。在此基础上设计、筛选得到16821对特异性引物,其中针对高多态性SSR序列的引物有8706对,随机挑选其中的20对引物对来源于贵州、江苏、福建的6个太子参样品DNA进行PCR扩增,其扩增成功率达70%~80%。太子参转录组SSR分布密度大、类型丰富、多态性潜能高、通用性好,可为开发太子参功能性标记提供前期基础,在太子参种质资源评价和优质种源筛选等方面具有极大的开发价值和良好的应用前景。

  • 标签: 太子参 SSR 转录组 位点信息
  • 简介:利用SSR分子标记技术对农作物不同品种进行鉴定具有高效、准确、成本低等显著特点。为建立软枣猕猴桃资源鉴别方法,本研究选用28对SSR引物对10份软枣猕猴桃资源共16个样品进行鉴别,并结合田间农艺性状调查分析。结果表明,‘长江一号’与‘魁绿’无位点差异,其余资源间均存在3个以上的位点差异。田间农艺性状调查结果表明,‘长江一号’与‘魁绿’差异不显著,其余资源间差异显著。在遗传特性及表型上‘长江一号’与‘魁绿’相似度极高,而其余8份种质资源间均存在显著差异。本研究结果为软枣猕猴桃种质资源的鉴别提供可靠的技术支持。

  • 标签: 软枣猕猴桃 SSR 鉴别
  • 简介:本研究利用MISA工具筛选灯盏花基因组测序获得的462622条scaffolds,对其SSR位点信息进行分析,Primer3设计SSR引物,随机选取200对引物对60株灯盏花进行多态性扩增分析。研究结果表明:从灯盏花基因组中搜索到的231852个SSR位点中,二核苷酸基序是主要的重复类型,占总SSR的47.14%;AT/AT是最多的二核苷酸重复基元,占二核苷酸重复基元的74.60%,AAT/ATT是出现最多的三核苷酸重复基元,占三核苷酸重复基元的15%。PCR扩增发现,200对引物中有30对(15%)表现出稳定的多态性差异。灯盏花基因组中SSR位点出现频率高,类型丰富;大量的SSR为灯盏花的遗传多样性分析和遗传图谱构建提供了丰富的候选分子标记,利于开展灯盏花的遗传育种研究。

  • 标签: 灯盏花 基因组 SSR 多态性
  • 简介:探讨腹腔镜胆总管探查加腹腔镜胆囊切除术(LCBDE-LC)与内镜下逆行胰胆管造影术/十二指肠乳头括约肌切开术加腹腔镜胆囊切除术(ERCP/EST-LC)2种术式对胆囊结石合并胆总管结石的疗效、安全性和手术结果。收集2012年1月-2016年3月行微创手术治疗的患者62例。其中34例行LCBDE-LC治疗,28例行ERCP/EST-LC治疗,比较两组手术成功率、手术时间、术后胃肠功能恢复时间、住院时间、住院费用及术后早期并发症等相关指标。LCBDE-LC手术成功34例,成功率100%,术后发生胆瘘2例;ERCP/EST-LC组手术成功28例,成功率100%,术后并发急性胰腺炎4例,术后出血4例。两组术后并发急性胰腺炎、术后出血发生率差异有统计学意义(χ~2=4.291、2.125,P〈0.05)。LCBDE-LC组手术时间、住院时间、术后胃肠功能恢复时间及住院费用均少于ERCP/EST-LC组,差异有统计学意义(t=-9.836、-4.397、1.345、2.451,P〈0.05)。在同样适应证下,优先选择行LCBDE+LC术式治疗胆囊结石合并胆总管结石效果较好。

  • 标签: 微创手术 胆石症 ERCP/EST-LC LCBDE-LC 乳突肌切开术
  • 简介:该出版物是对2011年作为国际原子能机构《安全标准丛书》第SSR-2/2号印发的"安全要求"出版物《核电厂安全:调试和运行》所作的修订。上次修订的目的是根据新的运行经验和核工业的新趋势重新构建《安全标准丛书》第NS-R-2号(2000年印发);纳入关于核电厂运行的《安全标准丛书》第NS-R-2号以往未包括的新要求;以及反映当前的实践、新概念与技术的发展。

  • 标签: 核电厂安全 安全标准 运行经验 安全要求 调试 SSR
  • 简介:摘要目的分析经内镜乳头括约肌切开术(EST)与开腹胆总管切开取石术治疗胆总管结石的疗效对比。方法本次研究患者例数为80例,入院治疗时间为2016年9月~2018年1月,分为两组进行观察,分别采用开腹胆总管切开取石术治疗和经内镜乳头括约肌切开术。结果察组患者的手术时间、术中出血量以及术后住院时间均明显短于对照组,同时观察组并发症发生率明显低于对照组,p<0.05,但是,两组患者在结石清除率方面,不具有统计学意义。结论经内镜乳头括约肌切开术与开腹胆总管切开取石术治疗胆总管结石的结石清除率均良好,但是经内镜乳头括约肌切开术可以有效缩短手术时间,减少术中出血量,加速患者术后恢复,因此治疗效果要远高于开腹胆总管切开取石术。

  • 标签: 经内镜乳头括约肌切开术 开腹胆总管切开取石术 胆总管结石 疗效