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  • 简介:摘要目的建立燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达5个微小RNA(microRNA,miRNA)靶基因蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选具有重要作用基因及基因模块。方法将本课题组前期筛选燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达5个miRNA(hsa-miRNA-3131、hsa-miRNA-4516、hsa-miRNA-6501-5p、hsa-miRNA-10b-5p、hsa-miRNA-4683)靶基因定位到STRING在线数据库(https://string-db.org),筛选PPI网络。使用Cytoscape v3.6.0软件对PPI网络可视化,通过NetworkAnalyzer插件得到拓扑属性值度和拓扑属性值介数,筛选PPI网络中心节点(度和介数均最高节点)。同时,采用CytoHubba插件中最大团中心(MCC)分析方法来确定PPI网络中重要节点。通过MCODE插件进行聚类分析,筛选PPI网络基因模块。将基因模块所包含蛋白名称在线提交KOBAS v3.0数据库(http://kobas.cbi.pku.edu.cn/),对MCODE插件筛选出基因模块进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果靶基因PPI网络由1 035个节点和4 346个边组成。泛素蛋白A-52残基核糖体蛋白融合产物1(UBA52)度(101)和介数(0.010 723 89)均最高,为PPI网络中心节点。经MCC分析,UBA52为PPI网络中重要节点。从PPI网络中选择排名前5基因模块,5个基因模块KEGG通路富集分析中高度富集基因通路分别为泛素介导蛋白水解、剪接体、内吞作用、神经活性配体-受体相互作用、囊泡转运。结论成功建立了燃煤污染型氟暴露人群血浆中差异表达5个miRNA靶基因PPI网络,筛选出UBA52基因和5个基因模块主要通路。

  • 标签: 微小RNA 蛋白质-蛋白质相互作用网络 KEGG
  • 简介:紫花苜蓿为多年生豆科草本植物,伊朗在有历史记载之前很长时间里就已种植,因此被认为是苜蓿起源中心。如今,苜蓿是世界土种植面积最大豆科牧草,种植面积达八千万英亩。苜蓿营养成分齐全而均衡,适应性强、分布范围广、产量高,是一种重要饲料作物,同时它还可以控制土壤侵蚀,改善水质量,保护生态平衡,而且为后续作物提供大量氮,因而事有“牧草之王”美誉。苜蓿蛋白含量高,品质好是优于其它牧草显著特征之一,本文就苜蓿蛋白特征和近年来关于影响苜蓿粗蛋白含量因素研究成果作一综述。

  • 标签: 粗蛋白含量 紫花苜蓿 蛋白质 豆科牧草 种植面积 饲料作物
  • 简介:尽管胰腺癌影像学诊断水平明显提高,但是早期患者往往缺乏临床症状而没有进行影像学检查。目前常用肿瘤标志物CA19-9在胰腺癌筛查中敏感性和特异性不高,尤其对于早期胰腺癌诊断价值不大,所以胰腺癌早期诊断仍然是个难题。随着分子生物学技术迅猛发展,蛋白组学应运而生。本文应用SELDI—TOF—MS技术探测胰腺癌患者血清蛋白组学变化,以期发现特异蛋白类肿瘤标志物,从而实现胰腺癌早期诊断。

  • 标签: 血清蛋白质组学 早期胰腺癌 诊断水平 指纹谱 分子生物学技术 影像学检查
  • 简介:摘要病理性心脏重塑是多种心脏疾病主要病理改变,表现为心肌肥厚和纤维化,并最终导致心力衰竭。心肌细胞作为一种终末分化细胞,增殖再生能力有限,因此蛋白稳态对于心肌细胞生存和功能极其重要。细胞蛋白稳态是指蛋白合成与降解过程达到动态平衡,其主要受到包括分子伴侣、泛素蛋白酶体、细胞自噬等3种途径在内蛋白质量控制系统调节。近年研究表明,心肌细胞蛋白稳态在心脏稳态维持中发挥重要作用,蛋白质量控制系统中任一环节出现异常均可能引起蛋白毒性,从而导致病理性心脏重塑。该文综述了蛋白稳态在心脏稳态维持中作用新进展,并展望了通过调节蛋白稳态治疗心脏疾病前景。

  • 标签: 心脏重塑 蛋白质稳态
  • 简介:蛋白一级结构鉴定实验中将传统蛋白酶解技术联用质谱技术是当前蛋白研究所必需,通过探索和实践,使本科教学渗入科研第一线,激发学生科研兴趣。

  • 标签: 蛋白质酶解 实验教学 改革
  • 简介:由双向电泳、质谱、计算机图像数据处理组成蛋白组学技术体系具有高通量、高分辨率和高重复性特点,能对微量样品进行全面自动定量分析.并在药物作用靶标、安全性评价、耐药性机制、疾病动物模型研制和中医药现代化等方面有新颖而重要应用。蛋白组学技术将在药物研究和开发中带来根本性变革,我国应尽快将蛋白组技术用于药物研究中。

  • 标签: 蛋白质组学技术 新药研究 药物研究 临床应用 双向电泳 质谱
  • 简介:牙周组织包括牙周膜、牙骨质、牙槽骨和牙龈,为牙齿及周围组织提供附着支持、本体神经感受和修复保护等功能。在感染、创伤或接受外界刺激时,牙周组织会发生适应性改建.不同类型细胞发生定向迁移、增殖分化及功能活化,并与细胞外基质相互作用,维持牙周改建动态平衡。

  • 标签: 牙周组织 蛋白质组学 应用 适应性改建 细胞外基质 周围组织
  • 简介:蛋白、总氮检测虽有不同分析方法,但都涉及到样品消化与蒸馏过程。现以使用蛋白测定仪进行消化、蒸馏这两个过程中注意事项与同行交流。

  • 标签: 蛋白质测定仪 检测过程 蒸馏过程 样品消化
  • 简介:摘要随着人类基因组计划进行,蛋白组学逐步建立并且更加完备起来,目前它已深入到生命科学及医药学各个领域,尤其是在疾病研究、治疗和新药开发中得到了更为广泛应用。

  • 标签: 蛋白质组学 疾病研究 新药开发
  • 简介:仔猪断奶是目前养猪业生产中一个非常重要环节,是制约养猪生产效益重要因素,随着养猪生产水平提高,仔猪断奶日龄逐渐提早。但由于仔猪消化系统尚未发育成熟,因此能否配合出既经济又能减轻“早期断奶腹泻综合症”日粮,使仔猪能顺利完成从母乳到断奶日粮过渡,同时又能维持最大生长速度。通过使用价格较低工业氨基酸,降低蛋白原料用量来满足动物氨基酸需求,即在生产中配制低蛋白日粮成为一种现实可能。目前.低蛋白日粮在养猪业中研究已相对成熟,但在实际应用中也需要注意一些相关问题。

  • 标签: 低蛋白 日粮 仔猪
  • 简介:摘要纳米技术是与原子、分子相关技术。通过加工最终以粒装呈现,粒径必须保持在1~100cm之内。这一技术因其自身存在众多优点,在药物领域受到了广泛认可。药物生物利用度、稳定性等都在一定程度上得到了改善,所以纳米技术被应用于药物递送系统研发中。药物递送系统是药物研发不可或缺一部分,通过合理科学系统,改变自身存在缺陷。这一研发目标很快便成为了热点,受到了相关人员重视。本文主要探讨纳米药物递送系统在蛋白药物中应用,对其分类进行描述,阐明其存在优势,力求为以后研究提供借鉴。

  • 标签: 纳米药物递送系统 蛋白质药物 应用
  • 简介:摘要随着蛋白组学概念提出及其技术不断发展,人类拥有了一条寻找恶性肿瘤诊断及判断预后重要线索,这对于恶性肿瘤发病机制及临床诊治亦具有重要指导意义。本文着重于蛋白组学研究现状、研究意义以及近年来研究进展,为今后开展恶性肿瘤蛋白组学研究提供部分参考依据。

  • 标签: 蛋白质组学 恶性肿瘤
  • 简介:采用分光光度法,以曙红染料为显色剂,研究了在酸性介质中曙红与牛血清蛋白作用吸收光谱并用于测定样品中蛋白含量.曙红与蛋白作用构成了曙红-蛋白复合物,研究了影响该复合物稳定和灵敏度因素,确定了该实验最佳条件.实验表明,曙红-蛋白复合物最大吸收波长从515nm红移到531nm.在最佳条件下,线性范围为0.4×10-5~1.6×10-5mol/L,检出限为0.09×10-5

  • 标签: 曙红 牛血清蛋白 吸收光谱 分光光度法
  • 简介:蛋白折叠是生命科学领域前沿课题之一.本文从热力学原理来分析蛋白折叠结构中能量和稳定性因素,利用熵效应和吉布斯自由能变化初步预测蛋白可能折叠结构.

  • 标签: 蛋白质折叠 熵效应 吉布斯自由能变化
  • 简介:蛋白是细胞中主要功能分子,是生命物质基础,蛋白功能是通过蛋白之间相互作用而发挥,而蛋白相互作用界面上只有很少数被称之为"能量热点"残基对相互作用贡献了大部分结合自由能,如何识别这些能量热点是目前生物信息学领域比较热门研究问题。其中基于机器学习蛋白能量热点识别中,特征选择方法使用对识别模型性能影响非常大。该文中,笔者通过对蛋白能量热点识别中特征选择方法研究现状进行全面的分析,指出还存在一些问题及以后改进思路和方向,为蛋白能量热点预测准确率提高奠定基础。

  • 标签: 蛋白质能量热点 特征选择 预测 降低维度
  • 简介:实验提出了一种基于词频统计蛋白关系知识发现方法,该方法首先通过生物命名实体识别技术识别出蛋白实体,然后统计共出现频率,形成候选实体对,从而发现最有可能实体关联。

  • 标签: 知识发现 生物命名实体识别 实体关联
  • 简介:随着蛋白组学研究技术发展,微生物蛋白组学研究具有突破性进展。简要介绍蛋白组学分类,概括5种蛋白组学技术,综合分析极端微生物、放线菌、病原菌以及群体微生物蛋白组学研究及应用最新进展。

  • 标签: 蛋白质组学 极端微生物 放线菌 病原菌 群体微生物
  • 简介:2006年5月5日《Science》报道来自ScrippsResearch和Skaggs生物化学研究院消息,研究人员揭示了一种被称为EmrD多药转运蛋白(multidrugtransporterprotein,MTP)结构,它可找出避免多药耐药性和增强现有药物能效。

  • 标签: 蛋白质 药物 多药耐药性 药效 科学 生物化学研究