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  • 简介:按GB3358.82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写x(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。

  • 标签: 统计学 真菌学 著录 杂志 中国 算术平均数
  • 简介:按GB3358-82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写x(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。③标准误用英文小写s^-x。④t检验用英文小写t。⑤F检验用英文大写F。⑥卡方检验用希文小写x^2。

  • 标签: 统计学 真菌学 著录 杂志 中国 算术平均数
  • 简介:按GB3358.82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写x(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。③标准误用英文小写sx。④t检验用英文小写t。

  • 标签: 统计学 真菌学 著录 杂志 中国 算术平均数
  • 简介:按GB3358-82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写x珔(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。③标准误用英文小写s珔x。④t检验用英文小写t。⑤F检验用英文大写F。⑥卡方检验用希文小写χ2。⑦相关系数用英文小写r。

  • 标签: 著录规范 英文大写 真菌学 希文 算术平均数 相关系数
  • 简介:按GB3358-82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写x(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。③标准误用英文小写s。④t检验用英文小写t。

  • 标签: 统计学 真菌学 著录 杂志 中国 算术平均数
  • 简介:按GB3358—82《统计名词及符号》有关规定书写,常用如下:①样本算术平均数用英文小写互(中位数仍用M)。②标准差用英文小写s。③标准误用英文小写Si。④t检验用英文小写t。⑤F检验用英文大写F。⑥卡方检验用希文小写x2。⑦相关系数用英文小写r。⑧自由度用希文小写口。⑨概率用英文大写PP值前应给出具体检验值,如t值、x2值、q值)。以上符号均用斜体。

  • 标签: 统计学 真菌学 著录 杂志 中国 算术平均数
  • 简介:对111份云南改良稻种和77份元阳地方稻种采用程氏指数法进行籼粳分类,比色法测定抗性淀粉、γ-氨基丁酸和总黄酮含量,并用SPSS软件对数据进行统计分析,结果表明:(1)总体抗性淀粉含量籼型〉偏籼〉偏粳〉粳型,γ-氨基丁酸含量则相反,黄酮含量与籼粳分化关系不明;(2)抗性淀粉、总黄酮含量有色米〉无色米,γ-氨基丁酸含量无色米〉有色米。总体功能性成分含量有色米〉无色米,籼稻〉粳稻,糙米〉精米,地方种〉改良种,有色、籼型糙米功能性成分最高,揭示了籼粳分化和米色与抗性淀粉、γ-氨基丁酸与总黄酮含量关系。

  • 标签: 抗性淀粉 Γ-氨基丁酸 总黄酮 程氏指数 籼粳亚种
  • 简介:目的应用转录技术,对UVA照射后白念珠菌菌丝及生物膜进行基因表达分析.方法体外构建白念珠菌(ATCC90028)生物膜,采用UVA-LED抗菌设备(复旦大学光电所制,波长365nm,强度13mW/cm2,频率100Hz),照射白念珠菌生物膜5min、10min、15min,对照不光照.用转录技术分析UVA实验和对照之间差异表达基因,进行GO、KEGG遗传差异富集分析.结果UVA光照相对于对照有大量差异表达基因,核糖体合成RIO2基因、氨基糖和核苷糖代谢相关基因MCR1、CBR1、内质网蛋白加工途径相关基因SHP1显著上调;RNA降解途径相关基因MPP6和细胞内吞作用相关基因CHMP6显著下调.结论UVA直接或间接调节白念珠菌菌丝及生物膜相关生理代谢途径,参与诱发细胞凋亡过程.

  • 标签: 白念珠菌 UVA RNA-seq测序 差异表达基因
  • 简介:水稻白叶枯病是世界性水稻病害,严重威胁水稻高产和稳产。为了挖掘水稻抗白叶枯病新基因,本研究对个野生稻基因导入系W6023进行了白叶枯病多菌系接种鉴定及抗谱分析,发现W6023具有广谱抗病性。用强致病菌PXO99诱导W6023及其感病轮回亲本IR24后进行转录测序,分别获得105644962和91022599条序列,通过GO注释及KEGG富集分析,发现差异表达基因主要富集在次生代谢产物生物合成、植物激素信号转导及糖代谢途径等方面。在这些差异表达基因中,发现203个基因表达有显著差异,其中在W6023中上调表达基因有114个(56.2%),下调表达有89个(43.8%),而且35.9%分布在第11染色体上。生物信息学分析发现在203个差异表达基因中有16个属于类抗病基因,如NBS-LRR;14个直接或间接与水稻体内过氧化物代谢相关,如编码过氧化物酶和金属硫蛋白;6个编码抗病相关转录因子,如WRKY和NAC;18个为信号传导相关基因,编码钙调素结合蛋白和萜类合成酶。随机选择6个W6023中上调表达和3个IR24中上调表达基因进行RT-PCR及qRT-PCR分析,结果与转录测序结果致,表明本研究获得转录测序数据结果是可靠,为以后更深入挖掘W6023抗病基因及分子机理研究提供了基础。

  • 标签: 水稻 抗病基因 白叶枯病 转录组测序 差异表达基因
  • 简介:在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录测序基础上,利用生物信息方法,从其转录数据中共获得23条MLOunigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157-0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5-9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,电点小于7仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15-50个氨基酸保守基序。它们系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季具有较高同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病候选基因,对这6条候选基因进步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因典型结构特征。最后,通过qRT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌互作过程。

  • 标签: 长尖叶蔷薇 大花香水月季 MLO基因 抗白粉病 生物信息学 QRT-PCR
  • 简介:目的分析11例未见明显免疫功能低下肺隐球菌病患者临床特征并文献复习。方法回顾分析2004年1月~2016年12月经病理或病原确诊为肺隐球菌病11例患者临床资料结果11例患者均未见明显免疫功能低下,值得注意是,其中7例患者(63.6%)有肥胖、高血压、冠心病基础病,1例有20多年吸烟史,只有1例是体检发现。6例初诊误诊,误诊率为54.54%(6/11),最易被误诊为肺癌(5/6)。较少累及肺外器官。影像表现以两中下肺单发结节最多见,以肺外周,胸膜下为显著;斑片样渗出影相对较少;10例结节或肿块边缘均有晕征。胸膜反应性增厚或胸膜牵拉7例,周围有毛刺和粗条索8例;空洞及空腔各1例。11例PC患者中,9例经病理确诊,2例经肺穿刺液涂片找到隐球菌。结论免疫正常PC患者以男性青壮年多发,高血压、肥胖、冠心病、吸烟者为高发人群,影像以肺下部单发结节多见,结节周围常常有晕征,不光滑。空洞及空腔少见。罕见累及肺外器官,初诊易误诊为肺癌。诊断主要依赖于病理组织检查。

  • 标签: 隐球菌病 免疫功能健全 CT表现
  • 简介:以抗黑星病黄瓜材料HX1为试材,接种黑星病菌(Cladosporiumcucumerinum)2h、8h、20h、32h和72h叶片作为试验方(Tester),相应未接种叶片作为对照方(Driver),利用SSH技术,构建了黑星病菌侵染初期正向和反向cDNA-SSH文库。用巢式引物PCR检测插入片段,获得了200个阳性克隆,通过测序,除去重复序列,共得到105个UniqueESTs,其中50个为singleton,55个为contings。与非冗余蛋白数据库进行BLASTx比对,结果显示,17条ESTs未找到同源序列,88条非重复序列和已知基因同源性较高,占全部ESTs序列83.8%,其中86条ESTs与非冗余蛋白数据库已知功能蛋白具有高度相似性。结合高密度点阵膜杂交差异筛选,阳性率为75.0%。经初步分析这些序列功能,差异表达ESTs功能涉及能量和基础代谢、信号转导、蛋白和核酸代谢、光合作用及逆境中特异表达基因等方面,为研究黄瓜抗黑星病基因提供了依据。

  • 标签: 黄瓜 黑星病 抑制性消减杂交 差异表达
  • 简介:水稻脆性突变体是研究细胞壁组分结构形成机制重要材料。通过离子柬诱变籼稻9311获得1个茎秆、叶片均脆突变体,命名为bc9311--1。bc9311-1突变体与野生型9311相比,分蘖数减少,结实率显著降低,其他农艺性状无明显差异。叶片和茎秆细胞壁成分分析表明,与野生型相比,bc9311-1突变体茎秆中纤维素和木质素含量明显降低,半纤维素和SiO,含量显著增加;叶片中纤维素含量降低,半纤维素和木质素含量增加,SiO2含量无明显差异。遗传分析表明,该脆性突变体脆性性状受单隐性基因控制。以bc9311-1突变体与02428杂交F,群体为基因定位群体,利用SSR标记将bc9311-1突变位点定位在水稻第1染色体上,位于SSR分子标记RM1095和RM3632之间,遗传距离分别为0.6cM和3.4cM,与其中标记RM1183表现共分离。这些结果为进步克隆突变基因,揭示脆性性状分子机制奠定坚实基础。

  • 标签: 水稻 细胞壁 脆秆 基因定位
  • 简介:近年来,系列重要医学致病真菌全基因数据陆续被公布,使人类对这些致病菌认识提高到全新水平。本文在回溯医学真菌基因和基因测序技术发展历程、综述其发展现状及应用基础上,再分别介绍重要医学真菌全基因测序进展。

  • 标签: 真菌 全基因组测序 念珠菌 隐球菌 曲霉 青霉
  • 简介:目的制备并鉴定抗曲霉不同抗原单克隆抗体。方法采用烟曲霉细胞壁抗原成分、分泌抗原和灭活分生孢子,分别免疫BALB/c小鼠,制备单克隆抗体,免疫荧光法鉴定单克隆抗体与曲霉属和念珠菌属抗原交叉反应。结果获得29株稳定分泌抗曲霉单抗杂交瘤细胞株,其中用烟曲霉细胞壁抗原成分免疫获得11株,用分泌抗原免疫获得13株,用孢子免疫获得5株;Ig亚类鉴定,11个克隆株为IgG1亚类,3个克隆株为IgG3,15个克隆株为IgM。免疫荧光法鉴定29株单抗特异性识别烟曲霉细胞壁抗原,与其他曲霉抗原有交叉反应。结论29株单克隆抗体,对于建立侵袭性曲霉感染早期诊断方法、筛选曲霉保护性抗体以及研究抗体保护机制奠定了实验基础。

  • 标签: 曲霉抗原 单克隆抗体 交叉反应
  • 简介:我国皮肤病性及真菌病奠基人之代宗师复旦大学附属华山医院皮肤科秦启贤教授因病医治无效不幸于2010年5月15日17时08分在复旦大学附属华山医院逝世,享年91岁。

  • 标签: 真菌病 皮肤病 复旦大学 皮肤科 医院 华山
  • 简介:目的DNA是进行分子生物研究重要基础。在本研究中,我们建立了2种简单快速抽提基因DNA方法并可用作PCR扩增模板。通过比较4种不同DNA抽提方法以确定哪种更适合进行下基因分析。方法这4种方法是:玻璃珠法,酶法,3%SDS法和氯化苄法。玻璃珠法是用玻璃珠在混漩器上剧烈振荡破碎细胞壁;3%SDS法是将细胞在含10mmol/LDTT3%SDS溶液中加热,然后用5mmol/LKAc和异丙醇抽提,DNA产量通过A260测定。结果3%SDS溶解法、经典酶法、玻璃珠法和氯化苄法DNA产量分别为0.4154±0.0367、0.8484±0.0756、1.2636±0.2040、0.4070±0.0339(g/L×10^8CFU/mL)。结论玻璃珠法是最敏感、重复性好、简单、费用合理抽提方法。

  • 标签: 新生隐球菌 DNA抽提 方法
  • 简介:目的以分子生物方法为“金标准”对两种商品化酵母样真菌鉴定产品RapidIDYeastPlus(简称RapIDYST)及API20CAUX(简称API20C)鉴定效能进行评估.方法从2010年中国医院侵袭性真菌感染监测网菌株库中筛选酵母样真菌25种,共计194株.其中,包含临床最常见5种酵母样真菌(白念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、新生隐球菌)共130株,占研究总菌株数67.0%.所有菌株已经过分子生物方法准确鉴定至种水平.菌株复苏分纯后,严格按照产品操作指南,平行进行RapIDYST和API20C鉴定.结果所研究菌株中,有181株(18种)在RapIDYST鉴定菌种数据库中,所有在库菌株种及复合体鉴定正确率为87.8%(159/181).相比,API鉴定菌种库包含菌株174株(18种),在库菌株种及复合体鉴定正确率为92.0%(160/174).RapIDYST与API20C对于5种临床常见酵母样真菌种鉴定正确率分别为93.1%和97.1%.对于库外菌株,RapIDYST鉴定错误率分别为23.1%(3/13),相比API20C鉴定错误率为60.0%(12/20).综合此次评估结果,二者对酵母样真菌鉴定效能无显著差异(McNemar检验,P0.05).结论两种商品化产品对酵母样真菌鉴定效能基本致;相较而言,RapIDYST在操作便捷性、检测时间方面具有较大优势.

  • 标签: 侵袭性真菌病 酵母样真菌 RAPID ID YEAST PLUS
  • 简介:以239份大豆品种资源为试材,研究其子粒中全磷和无机磷含量差异表现,分析大豆子粒中磷含量水平,并筛选高全磷、高无机磷资源材料。研究结果表明,供试239份大豆品种子粒中全磷、无机磷含量存在极显著差异;其分布范围分别为全磷6.24~9.56g/kg,无机磷0.12~0.37g/kg;平均含量分别为7.78g/kg,0.20g/kg;无机磷与全磷含量比值为1.39%~4.94%,平均为2.56%。同时,筛选出子粒中高全磷、高无机磷含量大豆品种各5个,其中品种洋黄豆、高家营黑豆、绿75、郭柳条青、大毛角为高全磷材料;品种8012混-1、黄豆、白露快、平顶黄、黑大粒为高无机磷材料;

  • 标签: 大豆 子粒 全磷含量 无机磷