简介:Theratioofnonsynonymoussubstitutionrate(Ka)tosynonymoussubstitutionrate(Ks)iswidelyusedasanindicatorofselectivepressureatsequencelevelamongdifferentspecies,anddiversemutationmodelshavebeenincorporatedintoseveralcomputingmethods.Wehavepreviouslydevelopedanewγ-MYNmethodbycapturingakeydynamicevolutiontraitofDNAnucleotidesequences,inconsiderationofvaryingmutationratesacrosssites.WenowreportafurtherimprovementofNG,LWL,MLWL,LPB,MLPB,andYNmethodsbasedonanintroductionofgammadistributiontoillustratethevariationofrawmutationrateoversites.Thenoveltycomesintwoways:(1)weincorporateanoptimalgammadistributionshapeparameteraintoγ-NG,γ-LWL,γ-MLWL,γ-LPB,γ-MLPB,andγ-YNmethods;(2)weinvestigatehowvariablesubstitutionratesaffectthemethodsthatadoptdifferentmodelsaswellastheinterplayamongfourevolutionalfeatureswithrespecttoKa/Kscomputations.Ourresultssuggestthatvariablesubstitutionratesoversitesundernegativeselectionexhibitanoppositeeffectonωestimatescomparedwiththoseunderpositiveselection.WebelievethatthesensitivityofournewmethodshasbeenimprovedthanthatoftheiroriginalmethodsunderdiverseconditionsanditisadvantageoustointroducenovelparametersforKa/Kscomputation.
简介:蚜虫属gossypii格洛弗显示出明显的主人专门化,与在许多区域的专业化葫芦、专业化棉花的遗传因子型或主人赛跑。因为它的年度出生的主人庄稼更早开始衰老,专业化葫芦的遗传因子型可以承受食物缺乏。这遗传因子型使用克服这挑战的方法仍然糟糕被理解。以便在主机移动和用法理解专业化葫芦的遗传因子型蚜虫的潜力,棉花(Gossypiumhirsutum)上的这遗传因子型的性能,普通却差的优秀主机植物,在这研究被探索。仅仅当这些植物有至少九片叶子时,专业化葫芦的蚜虫能在棉花上建立人口,并且随后的人口相当慢慢地发展。存在whitefly,棉花上的人口改进了专业化葫芦的蚜虫的成功率。专业化葫芦的蚜虫在棉花的更旧的叶子主要是分布式的,与仅仅在上面的叶子安定的一些。为40,54和61 days在棉花上饲养的专业化葫芦的蚜虫仍然为他们的出生的主人植物,黄瓜(Cucumissativus),而非棉花维持了强壮的偏爱,并且当他们被转移到新六叶的棉花上时,他们繁殖的率和天赋的内在的率增加的网戏剧性地更低植物或分开的叶子。因此,我们断定专业化葫芦的蚜虫有潜力利用成熟或强调whitefly的棉花植物,而是那棉花上的这喂的经验没为葫芦改变他们的专门化。一些棉花植物能充当一位暂时的主人让专业化葫芦的蚜虫克服食物缺乏从开始衰老产生葫芦。
简介:ItisoutofquestionthatChinahasachievedconsiderableadvancementsinscienceandtechnology.Theworldwidespreadof"MadeinChina"thatgetsonthewesterncountries'nervesisagoodillustration.However,althoughcomparativelybetterthansomeotherdevelopingcountries,wehavetofacethesituationthatscienceandtechnologyinsuchagreatnationasChinaisstillseriouslylaggedbehind,lackinggreatbreakthroughsandtop-rankingmastersandleaders.That'swhywefeeluneasyinfrontofinternationalcolleagues.
简介:Ithasbeenshownthattheprogressinthedeterminationofmembraneproteinstructuregrowsexponentially,withapproximatelythesamegrowthrateasthatofthewater-solubleproteins.Inordertoinvestigatetheeffectofthis,ontheperformanceofpredictionalgorithmsforbothα-helicalandβ-barrelmembraneproteins,weconductedaprospectivestudybasedonhistoricalrecords.WetrainedseparatehiddenMarkovmodelswithdifferentsizedtrainingsetsandevaluatedtheirperformanceontopologypredictionforthetwoclassesoftransmembraneproteins.Weshowthattheexistingtop-scoringalgorithmsforpredictingthetransmembranesegmentsofα-helicalmembraneproteinsperformslightlybetterthanthatofβ-barreloutermembraneproteinsinallmeasuresofaccuracy.Withthesamerationale,ameta-analysisoftheperformanceofthesecondarystructurepredictionalgorithmsindicatesthatexistingalgorithmictechniquescannotbefurtherimprovedbyjustaddingmorenon-homologoussequencestothetrainingsets.Theupperlimitforsecondarystructurepredictionisestimatedtobenomorethan70%and80%ofcorrectlypredictedresiduesforsinglesequencebasedmethodsandmultiplesequencebasedones,respectively.Therefore,weshouldconcentrateoureffortsonutilizingnewtechniquesforthedevelopmentofevenbetterscoringpredictors.
简介:目的:用主动脉瓣关闭不全法致新西兰兔心衰模型。方法运用导管术造成新西兰兔主动脉瓣膜关闭不全,制作超容量负荷型心衰模型。观察动物的毛色、精神状态、活动情况、饲料消耗指数、体重增加指数、呼吸频率等指标对该模型进行评价;检测血清SOD活力和MDA含量,判断模型组动物机体抗氧化能力;利用酶联免疫法检测血清中cAMP、cGMP的变化情况;利用基因芯片技术分析该模型基因表达差异。结果模型动物SBP、DBP和LVSP著性下降,LV+dp/dt和LV±dp/dt明显下降,LVDP显著上升。模型组与正常组比较,毛发枯槁,活动减少,进食减少,反应迟钝,精神萎靡,抓起时反抗减轻。模型组呼吸频率加快;模型组血清SOD活性低于正常组,MDA含量高于正常组;模型组血清cAMP明显低于正常组,cGMP明显高于正常组;利用基因芯片共检测出665个差异基因,其中与心功能较密切相关的基因主要与离子通道、肌收缩、信号转导等功能有关。结论采用主动脉瓣关闭不全法建立兔心衰模型方法可靠。主动脉关闭不全,使心脏前负荷增加,造成左心室舒张末期容积增加,导致左心室扩大肥厚及心力衰竭。心肌组织基因芯片检测结果显示,该模型基因表达出现了一定的变化。
简介:目的:探讨主动脉夹层(aorticdissection,AD)血管组织中氧化应激蛋白NOX1的表达及意义。方法:收集2014年~2015年在武汉大学人民医院AD患者升主动脉血管组织标本(AD组)及多器官捐献患者升主动脉血管组织标本(对照组)各12例。采用维多利亚蓝染色观察主动脉中膜弹性纤维形态结构;应用SP免疫组织化学法及Westernblot法对标本组织中的NOX1进行检测分析。结果:AD组主动脉中膜弹性纤维形态和排列不规则、破碎、丢失,结构紊乱。免疫组织化学显示NOX1阳性表达见于主动脉壁平滑肌细胞胞质中,AD组与对照组比较,NOX1表达明显升高。Westernblot蛋白印迹示AD组NOX1表达明显增高,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论:NOX1在AD主动脉中膜中表达上调,可能在AD的发生中发挥作用。
简介:目的应用β-氨基丙腈(β-aminopropionitrile,BAPN)饮水联合血管紧张素II(angiotensinII,AngII)皮下埋泵建立小鼠主动脉夹层模型。方法40只3周龄雄性C57Bl/6J小鼠随机分为两组,均每日给予0.1g/(kg·bw)BAPN饮水,BAPN饮水后第28天给予皮下埋泵,BAPN饮水+生理盐水埋泵组持续泵入生理盐水,BAPN饮水+AngII埋泵组持续泵入AngII,每分钟1000ng/(kg·bw)。采用小鼠无创血压测量计尾套法检测小鼠血压和心率。实验中死亡小鼠立即解剖,分离主动脉。埋泵72h后,未死亡小鼠注射过量戊巴比妥钠处死,留取主动脉。苏木素-伊红染色显微镜下观察主动脉壁假腔形成情况。结果BAPN饮水+AngII埋泵组小鼠总的夹层发生率为95%,死亡率为24%(夹层动脉瘤破裂死亡),BAPN饮水+生理盐水埋泵组夹层发生率为5%,死亡率为0;镜下主动脉病理切片显示夹层主动脉有假腔形成。结论成功建立高主动脉夹层发生率的小鼠模型。
简介:目的:探讨年龄对于复杂性急性StanfordB型主动脉夹层(ComplicatedacutetypeBaorticdissection,cABAD)患者预后的影响。方法:回顾性分析2010年1月至2017年6月急诊收治入院的156例cABAD患者的住院病例资料,将其根据不同的年龄、治疗方式(药物保守治疗、血管内介入治疗、传统手术治疗)及治疗结果进行分组,并在不同的年龄组进行分析。结果:本研究的患者平均年龄为52.46±11.72岁,45%的患者(n=70)大于65岁,55%的患者(n=86)小于65岁。小于65岁的患者有22.2%的患者(n=19)接受药物保守治疗J9.8%的患者(n=17)接受传统手术治疗、58%的患者(n=50)接受血管内介入治疗,大于65岁的患者有48.6%的患者(n=34)接受药物保守治疗、11.4%的患者(n=8)接受传统手术治疗、40%的患者(n=28)接受血管内介入治疗。小于65岁与大于65岁患者院内死亡率分别为12.8%与35.7%(P<0.007),接受血管内治疗分别为2%与28.6%(P=0.001),常规手术治疗分别为21%与37.5%(p=0.468),药物保守治疗分别为31.5%与41.7%(p=0.489)。年龄65岁或以上是多因素分析中住院死亡率的预测因子(OR=2.72;95%CI1.343-4.674;p=0.012)。结论:年龄265岁对于cABAD患者的预后具有显著的影响,血管内介入治疗可有效降低院内死亡率,但死亡率随着年龄的增长而升高。