简介:目的旨在研究来源于抗病毒基因HERC5的新型环状RNAhsa_circ_0001426的特征,并探索该环状RNA真核过表达载体的构建和鉴定。方法从反向剪切位点的验证、蛋白翻译的潜能、对RNaseR处理的抵抗性、在细胞内的胞质胞核分布情况四个方面来研究hsa_circ_0001426的特征。此外,还利用环状RNA克隆构建试剂盒来构建hsa_circ_0001426的过表达载体,并验证其表达效果。结果hsa_circ_0001426是由HERC5基因第18号外显子反向剪切至第12号外显子形成,其序列中包含一条可翻译318个氨基酸的开放阅读框,其抵抗RnaseR的处理,主要分布于细胞质。针对该环状RNA的过表达载体构建成功,其在转染HEK293T细胞后48h的表达量最高。结论首次成功分析了抗病毒基因HERC5的新型环状RNAhsa_circ_0001426的特征,并利用试剂盒首次成功构建了hsa_circ_0001426的真核过表达载体,并可在细胞中高效表达;为深入研究hsa_circ_0001426的特征和功能奠定基础,并进一步扩充了HERC5基因的相关研究。
简介:摘要目的分析表皮生长因子受体(EGFR)基因突变阳性的非小细胞肺癌(NSCLC)腹膜转移患者的预后因素。方法收集2014—2019年收治的EGFR突变阳性NSCLC腹膜转移患者的临床资料。主要观察和分析指标为中位生存期(mOS ),其中mOS1表示从确诊不可切除的中晚期肺癌开始或根治性切除术后发生复发和/或转移开始接受一线酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗至出现肿瘤耐药的时间,mOS2表示从确诊腹膜转移开始至死亡或随访终点的时间。结果共收集5例患者,均为异时性转移,第一代TKI治疗耐药后出现腹膜转移。耐药后再次基因检测发现EGFR T790M突变阳性3例。mOS1:总体为14.4个月;EGFR 19外显子突变者为18.8个月,21外显子突变者为16.3个月,18外显子突变者为15.6个月。mOS2:总体为7.5个月;EGFR T790M突变阳性者为10.4个月,EGFR T790M突变阴性者为5.2个月;接受靶向治疗联合血管抑制剂治疗者为12.6个月,单纯靶向治疗者为9.3个月,血管抑制剂联合化学治疗者为6.2个月,单纯血管抑制剂治疗者为4.2个月。结论EGFR突变阳性NSCLC患者腹膜转移后再次行基因检测非常必要,靶向治疗联合血管抑制剂治疗策略可能使患者获得更长的生存期。
简介:目的构建先天性QT间期延长综合征相关基因SCN5A-delQKP1507-1509突变型真核表达载体,并观察其在人胚肾293(HEK293)细胞中的表达。方法采用一步法构建SCN5A-delQKP1507-1509突变型真核表达载体PEGFP-delQKP-hH1,用脂质体转染法将野生型和突变型质粒分别转染HEK293细胞,激光共聚焦显微镜观察钠通道蛋白在HEK293细胞的表达与定位,Westernblot检测其蛋白表达。结果经电泳及DNA测序显示突变型1507-1509位点成功缺失9个碱基,野生型与突变型均在HEK293细胞膜上表达,且表达量差异无统计学意义(P〉0.05)。结论成功构建钠通道基因SCN5A-delQKP1507-1509突变型真核表达载体,并在HEK293细胞中表达,为进一步研究其功能奠定基础。
简介:目的:探讨老年易感病脑梗死与HPA-1~5、15基因多态性的相关性。方法:采用PCR-SSP技术对214例60岁以上脑梗死病例组和220例健康体检者对照组进行HPA-1~5、15系统基因分型,并应用统计学方法对两组进行χ^2检验和Logistic回归分析。结果:①HPA-2抗原系统多态性病例与对照组比较差异有统计学意义。脑梗死组基因频率(a=0.9159,b=0.0481)与对照组基因频率(a=0.9773,b=0.0227)相比较P〈0.01;脑梗死组基因型频率(aa=0.8318,ab=0.1682,bb=0)与对照组基因型(aa=0.9545,ab=0.0455,bb=0)相比较P〈0.01。②HPA-2回归分析:脑梗死HPA-2b基因和HPA-2ab基因型均显著高于对照组,以HPA-2aa为指示符进行Logistic回归分析并以年龄调整后,HPA-2ab的OR值=4.123(95%CI=1.981~8.581)。结论:HPA-2抗原系统基因多态性可能是本地区老年人群脑梗死发病的遗传易感因素,HPA-2b可能是其易感基因,HPA-2ab可能是其易感基因型。
简介:目的本实验探讨靶向沉默CDCA5基因的表达对人乳腺癌细胞增殖的影响及其主要机制。方法采用Westernblot检测乳腺癌组织、癌旁正常组织和人乳腺癌细胞系MCF-7、MDA—MB-231及MDA—MB-435s细胞中CDCA5蛋白的表达。针对CDCA5基因的siRNA,设阴性对照组siRNA—NC及空白对照组Blank。PCR检测各组对CDCA5基因的沉默效果。MTT法检测siRNA、siRNA-NC和Blank各组细胞增殖能力,流式细胞仪分别检测3组细胞周期的变化。Westernblot用于分析P1k1、SA2和pSA2蛋白表达情况。结果CDCA5在乳腺癌组织中的表达明显高于癌旁正常组织。人乳腺癌细胞系MDA—MB-435s中CDCA5蛋白的表达明显高于MCF-7和MDA-MB-231细胞系。siRNA在各组中有最强的基因沉默效果,与siRNA—NC和Blank组相比,siRNA组细胞增殖能力明显降低(P〈0.05),处于细胞周期G2/M期的细胞数量明显增多(P〈0.05)。沉默CDCA5基因后Plk1和pSA2蛋白表达明显降低。结论沉默CDCA5基因可有效抑制乳腺癌细胞增殖,这可能与下调CDCA5/Plk1/SA2信号通路从而使细胞周期被阻滞在G2/M期有关。
简介:摘要目的探讨替吉奥+奥沙利铂(SOX)方案联合甲磺酸阿帕替尼治疗晚期不可手术切除胃癌的效果。方法抽取2017年1月至2021年6月呼和浩特市第一医院收治的晚期胃癌患者60例,按照治疗方案分为对照组和观察组,每组30例。对照组采用SOX方案,观察组采用SOX联合甲磺酸阿帕替尼方案。比较两组疗效、总生存期、无进展生存期、不良反应发生率以及治疗前后血清血管内皮生长因子(VEGF)水平。结果观察组总有效率(60.00%,18/30)高于对照组(33.33%,10/30),P<0.05。观察组总生存期、无进展生存期长于对照组(t=4.051、2.937,P<0.05)。两组不良反应发生率比较差异未见统计学意义(P>0.05)。治疗前,两组VEGF水平比较差异未见统计学意义(P>0.05);治疗后,观察组血清VEGF水平[(392.02±65.14)ng/L]低于对照组[(486.02±72.54)ng/L],P<0.05。结论晚期不可手术切除胃癌患者应用SOX联合甲磺酸阿帕替尼方案治疗,相比单项SOX方案,可提高疗效,使患者生存期延长,且不会明显增加不良反应。
简介:摘要目的探讨SOX9蛋白和K-Ras蛋白在胃癌组织中表达及临床意义。方法选择义乌市中心医院于2016年1月至2020年1月行手术且经病理检查证实为胃癌患者120例为观察对象,取癌组织及癌旁组织。采用免疫组织化学法检测SOX9蛋白和K-Ras蛋白阳性表达;采用Western Blot检测SOX9蛋白和K-Ras蛋白表达灰度值。比较癌组织与癌旁组织SOX9蛋白和K-Ras蛋白阳性率,不同病理特征SOX9蛋白和K-Ras蛋白阳性率,及癌组织与癌旁组织SOX9蛋白和K-Ras蛋白表达灰度值。结果癌组织SOX9蛋白阳性率[69.17%(83/120)]和K-Ras蛋白阳性率[58.33%(70/120)]高于癌旁组织[15.00%(18/120)和11.67%(14/120)](χ2=72.227、57.436,均P<0.05)。不同性别、年龄、分化程度和TNM分期SOX9蛋白表达阳性率和K-Ras蛋白表达阳性率比较差异无统计学意义(均P>0.05);淋巴结转移患者SOX9蛋白表达阳性率(92.45%)高于无淋巴结转移患者(50.75%)(χ2=24.136,P<0.05)。淋巴结转移患者K-Ras蛋白表达阳性率(79.25%)高于无淋巴结转移患者(41.79%)(χ2=17.079,P<0.05)。癌组织SOX9蛋白表达灰度值(0.87±0.15)和K-Ras蛋白表达灰度值(0.56±0.13)高于癌旁组织(0.12±0.03)和(0.10±0.03)(t=53.079、37.769,均P<0.05)。结论SOX9蛋白和K-Ras蛋白在胃癌组织中高表达,且与淋巴结转移密切相关。
简介:AbstractObjective:SOX4, a transcription factor, has been found to contribute to tumorigenesis in several cancers. This study was performed to determine whether SOX4 mediates BRAF inhibitor resistance in melanoma.Methods:Melanoma cell lines with acquired resistance to BRAF inhibitor (SK-MEL-5R, SK-MEL-28R, and A375R) were generated by adding escalating concentrations of PLX4032 into parental SK-MEL-5, SK-MEL-28, and A375 cells for >6 months. The expression of SOX4 and insulin-like growth factor 1 receptor (IGF-1R) was measured by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) and Western blotting. The downstream signaling of IGF-1R was detected by Western blotting. SOX4 and IGF-1R overexpression or knockdown was conducted by lentivirus transfection. Cell viability and apoptosis were demonstrated by MTT and flow cytometry, respectively. The binding ability of SOX4 to IGF-1R promoter was determined by chromatin immunoprecipitation quantitative PCR assay.Results:SOX4 was upregulated in BRAF inhibitor-resistant melanoma cells as compared with parental cells (SK-MEL-5 group, 1.02 vs. 6.33; SK-MEL-28 group, 1.03 vs. 3.22; A375 group, 1.00 vs. 1.86; t=°7.069, 29.26, and 5.291, respectively; all P < 0.01), and PLX4032 treatment could not alter the expression of SOX4 in resistant cells. SOX4 overexpression attenuated the response of parental cells to PLX4032 (for cell viability, SK-MEL-5 group: 77.76% vs. 104.28%, F= 91.50; SK-MEL-28 group: 60.59% vs. 93.13%, F= 171.8; A375 group: 62.50% vs. 80.87%, F= 47.15. For apoptosis rates, SK-MEL-5 group: 34.90% vs. 14.31%, F= 4.781; SK-MEL-28 group, 40.8% vs. 29.4%, F= 13.32, P= 0.063; A375 group: 40.20% vs. 17.09%, F= 11.39; all P < 0.05, otherwise indicated). While SOX4 knockdown enhanced the response of resistant cells to PLX4032 (for cell viability, SK-MEL-5R group: 93.75% vs. 69.53%, F= 94.45, SK-MEL-28R group: 95.60% vs. 66.79%, F= 30.41, A375R group: 95.51% vs. 59.98%, F= 111.6; for apoptosis rates, SK-MEL-5R group: 16.2% vs. 44.4%, F= 25.67, SK-MEL-28R group: 26.59% vs. 44.20%, F= 158.0, A375R group: 5.98% vs. 31.51 %, F= 14.35, and all P < 0.01). Chromatin immunoprecipitation quantitative PCR assay demonstrated that SOX4 binded to the promoter of IGF-1R (1.04 vs. 1.94 [-1044 to -920 bp] and 0.110 vs. 0.139 [GAPDH], F= 534.5, P < 0.01). In addition, SOX4 overexpression increased IGF-1R and its downstream phosphorylated ERK, phosphorylated AKT, and phosphorylated STAT3 expression, while SOX4 knockdown exerted the opposite effects. Moreover, IGF-1R knockdown overcame SOX4 overexpression-induced PLX4032 resistance (cell viability: 35.85% vs. 52.79% vs. 37.84% [A375 group, negative control group vs. SOX4 overexpressing group vs. SOX4 overexpressing + sh-IGF-1R group]; apoptosis rates: 25.30% vs. 9.56% vs. 22.26 [A375 group, negative control group vs. SOX4 overexpressing group vs. SOX4 overexpressing+ sh-IGF-1R group]; F= 13.01 and 41.87, respectively; all P < 0.01), while IGF-1R overexpression abrogated SOX4 knockdown-induced response enhancement to PLX4032 for comparison of negative control group, sh-SOX4 group and sh-SOX4 + IGF-1R overexpressing group (cell viability: 96.62% vs. 86.86% vs. 97.26% (A375R), 98.15% vs. 81.63% vs. 98.49% [SK-MEL-5R]; apoptosis rates: 13.81% vs. 32.00% vs. 12.16 [A375R], 29.70% vs. 41.40% vs. 26.10% [SK-MEL-5R]; F= 13.56, 12.86, 38.81, and 39.85, respectively; all P < 0.01).Conclusion:SOX4 mediates BRAF inhibitor resistance in melanoma through regulation of IGF-1R signaling. SOX4 might serve as a potential target for the treatment of BRAF inhibitor-resistant melanoma.
简介:摘要目的探讨1例46,XY性发育异常(disorders of sex development,DSD)患儿的遗传学机制,并分析其基因型与表型的相关性。方法对患儿进行全外显子组测序,并对其NR5A1基因的第1~7外显子进行多重连接探针扩增检测。结果患儿表现为幼稚女童外阴,Tanner分期为1期。B超可见卵巢和子宫。患儿外周血染色体核型为46,XY,全外显子组测序发现其携带NR5A1基因第5外显子杂合缺失(chr9q33.3:127 255 298-127 255 438),为新发现的致病变异,遗传自母亲,父亲未见异常。结论46,XY DSD患儿主要表现为外生殖器男性化不足,NR5A1基因变异是其重要的遗传学病因。全外显子组测序提高了基因变异的检出率,为患儿家庭的遗传咨询提供了确切的依据。
简介:摘要目的了解2020年福州市哨点医院5岁以下腹泻住院儿童粪便样本中A组轮状病毒(group A rotavirus, RVA)的基因组特征。方法通过ELISA对腹泻住院儿童粪便样本进行RVA筛查,采用RT-PCR方法扩增RVA阳性样本的11个基因节段并进行Illumina二代测序,使用MEGA等生物学软件对重要基因片段进行序列分析和抗原位点分析。结果成功获得20株RVA全基因组序列,包括4种G/P基因组合G9P[8](55%)、G3P[8](25%)、G8P[8](15%)以及G2P[4](5%),全基因组中DS-1-like重配株比例占40%(8/20)。相同型别的RVA序列同源性高,且与现今世界流行的毒株亲缘关系近。VP7、VP4和NSP4片段氨基酸位点变异情况复杂,重要抗原位点存在多处氨基酸变异情况发生。结论在福州地区首次检测到G3P[8]型和G8P[8]型DS-1-like重配株,VP7、VP4和NSP4片段抗原位点上存在变异。鉴于不常见DS-1-like重配株的检出和多个重要抗原位点变异现象的出现,有必要对RVA全基因组特征进行持续监测,为疫情防控和疫苗的免疫策略提供科学依据。
简介:摘要多源浦肯野纤维相关室性早搏综合征(MEPPC)是近年来新发现的SCN5A突变相关的临床心律失常综合征,患者携带SCN5A错义突变(p.R222Q),呈常染色体显性遗传,临床表现为多源浦肯野纤维相关室性早搏、心房颤动、伴或不伴有扩张性心肌病。亚洲人群尚无此病例报道,本文报道了1例MEPPC患者,结合文献分析其发病原因,探索治疗方案,丰富了该病流行病学及临床资料信息。
简介:摘要目的探讨人胚胎干细胞(hESCs)定向分化为晶状体小体(LB)过程中非经典Wnt信号通路配体Wnt5a对晶状体发育的作用。方法选取人H9胚胎干细胞系,采用mTeSR培养基进行干细胞培养。"三阶段法"诱导hESCs分化为LB。培养至18 d,将细胞分为对照组和Wnt5a处理组,其中Wnt5a处理组培养基中添加500 ng/ml Wnt5a。培养至35 d,在倒置显微镜下观察细胞形态变化和LB的大小并提取对照组和Wnt5a处理组的总RNA进行转录组测序(RNA-Sequence)检测,表达差异大于1.5倍且P≤0.05被定义为差异表达基因(DEGs),进行生物信息学分析。结果培养结束时发现,与对照组相比,Wnt5a处理组细胞形成的LB面积明显变大。转录组测序结果显示,与对照组相比,Wnt5a处理组中478个基因表达下调,201个基因表达上调,其中Wnt5a可使晶状体细胞分化及晶状体特异基因的表达上调。生物信息学分析结果显示,Wnt5a主要参与了细胞外基质(ECM)改变的过程,提示在晶状体细胞分化中,Wnt5a可改变ECM;同时,富集结果还显示经Wnt5a处理,上皮-间充质转化过程相关过程受抑制,提示Wnt5a还可抑制晶状体细胞,特别是晶状体上皮细胞的异常分化;此外,Wnt5a还可影响晶状体细胞骨架重塑。结论Wnt5a可能通过上调MAPK/ERK级联信号调整ECM的结构成分,影响晶状体细胞骨架重塑,从而促进晶状体细胞的分化。
简介:[摘要]目的:观察人骨保护素(humanosteoprotegerin,hOPG)在犬牙周韧带细胞(periodontalligamentcells,PDLCs)中的表达情况,为后期的牙周组织再生实验制备高表达目的基因hOPG的种子细胞。方法:体外构建携带hOPG基因的腺病毒载体Ad5-hOPG—EGFP,并将其转染Beagle犬PDLCs,通过流式细胞术、实时定量RT.PCR、ELISA以及WesternBlot检测目的基因的转录和表达。结果:重组腺病毒Ad5一hOPG—EGFP成功转染犬PDLCs,转染72h后转染效率达到80%以上,转染的细胞发出较强的绿色荧光;基因和蛋白水平检测表明,hOPG在犬PDLCs中得到了有效表达。结论:重组腺病毒介导的hOPG基因可以在PDLCs中有效表达。